RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490738.5

CAMTA1-213, Transcript of calmodulin binding transcription activator 1, humanhuman

TSL 2

Gene CAMTA1, Length 538 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1-213ENST00000490738 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.94■■■■■ 8.47
CAMTA1-213ENST00000490738 ABCC9O60706 1549 aa60.98■■■■■ 7.35
CAMTA1-213ENST00000490738 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa60.91■■■■■ 7.34
CAMTA1-213ENST00000490738 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa58■■■■■ 6.88
CAMTA1-213ENST00000490738 NACADO15069 1562 aa57.61■■■■■ 6.81
CAMTA1-213ENST00000490738 DCAF8L2P0C7V8 631 aa57.33■■■■■ 6.77
CAMTA1-213ENST00000490738 DNAJC5BQ9UF47 199 aa57.3■■■■■ 6.76
CAMTA1-213ENST00000490738 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.84■■■■■ 6.69
CAMTA1-213ENST00000490738 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56.8■■■■■ 6.68
CAMTA1-213ENST00000490738 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.69■■■■■ 6.67
CAMTA1-213ENST00000490738 BICRAQ9NZM4 1560 aa56.38■■■■■ 6.62
CAMTA1-213ENST00000490738 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.31■■■■■ 6.6
CAMTA1-213ENST00000490738 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.11■■■■■ 6.57
CAMTA1-213ENST00000490738 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.56■■■■■ 6.48
CAMTA1-213ENST00000490738 SCRIBQ14160 1630 aa55.53■■■■■ 6.48
CAMTA1-213ENST00000490738 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa55.07■■■■■ 6.41
CAMTA1-213ENST00000490738 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.97■■■■■ 6.39
CAMTA1-213ENST00000490738 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.93■■■■■ 6.38
CAMTA1-213ENST00000490738 NCAPD3P42695 1498 aa53.23■■■■■ 6.11
CAMTA1-213ENST00000490738 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa53.07■■■■■ 6.09
CAMTA1-213ENST00000490738 SMARCA4P51532 1647 aa52.98■■■■■ 6.07
CAMTA1-213ENST00000490738 SMARCA2P51531 1590 aa52.87■■■■■ 6.05
CAMTA1-213ENST00000490738 HMGXB3Q12766 1538 aa52.8■■■■■ 6.04
CAMTA1-213ENST00000490738 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.71■■■■■ 6.03
CAMTA1-213ENST00000490738 ERCC6Q03468 1493 aa52.61■■■■■ 6.01
CAMTA1-213ENST00000490738 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa52.57■■■■■ 6.01
CAMTA1-213ENST00000490738 CUX2O14529 1486 aa52.54■■■■■ 6
CAMTA1-213ENST00000490738 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP52.51■■■■■ 6
CAMTA1-213ENST00000490738 PEG3Q9GZU2 1588 aa52.48■■■■■ 5.99
CAMTA1-213ENST00000490738 NESP48681 1621 aa52.4■■■■■ 5.98
CAMTA1-213ENST00000490738 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.37■■■■■ 5.97
CAMTA1-213ENST00000490738 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa52■■■■■ 5.91
CAMTA1-213ENST00000490738 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.85■■■■■ 5.89
CAMTA1-213ENST00000490738 WIZO95785 1651 aa51.72■■■■■ 5.87
CAMTA1-213ENST00000490738 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.7■■■■■ 5.87
CAMTA1-213ENST00000490738 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.68■■■■■ 5.86
CAMTA1-213ENST00000490738 CADPSQ9ULU8 1353 aa51.6■■■■■ 5.85
CAMTA1-213ENST00000490738 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.29■■■■■ 5.8
CAMTA1-213ENST00000490738 MRC2Q9UBG0 1479 aa51.26■■■■■ 5.8
CAMTA1-213ENST00000490738 WDR62O43379 1518 aa51.14■■■■■ 5.78
CAMTA1-213ENST00000490738 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.05■■■■■ 5.76
CAMTA1-213ENST00000490738 CEP164Q9UPV0 1460 aa51.04■■■■■ 5.76
CAMTA1-213ENST00000490738 CFTRP13569 1480 aa51.03■■■■■ 5.76
CAMTA1-213ENST00000490738 FANCD2Q9BXW9 1451 aa51.01■■■■■ 5.76
CAMTA1-213ENST00000490738 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP50.61■■■■■ 5.69
CAMTA1-213ENST00000490738 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.51■■■■■ 5.68
CAMTA1-213ENST00000490738 PRDM2Q13029 1718 aa50.41■■■■■ 5.66
CAMTA1-213ENST00000490738 TRIM41Q8WV44 630 aa50.23■■■■■ 5.63
CAMTA1-213ENST00000490738 OSCARQ8IYS5 282 aa50.15■■■■■ 5.62
CAMTA1-213ENST00000490738 TOPBP1Q92547 1522 aa50.04■■■■■ 5.6
CAMTA1-213ENST00000490738 IFT140Q96RY7 1462 aa50.03■■■■■ 5.6
CAMTA1-213ENST00000490738 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP50■■■■■ 5.59
CAMTA1-213ENST00000490738 ABCC8Q09428 1581 aa49.9■■■■■ 5.58
CAMTA1-213ENST00000490738 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.84■■■■■ 5.57
CAMTA1-213ENST00000490738 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49.67■■■■■ 5.54
CAMTA1-213ENST00000490738 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.61■■■■■ 5.53
CAMTA1-213ENST00000490738 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP49.54■■■■■ 5.52
CAMTA1-213ENST00000490738 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP49.54■■■■■ 5.52
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CAMTA1-213ENST00000490738 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.49■■■■■ 5.51
CAMTA1-213ENST00000490738 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.49■■■■■ 5.51
CAMTA1-213ENST00000490738 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa49.37■■■■■ 5.49
CAMTA1-213ENST00000490738 ARHGEF11O15085 1522 aa49.35■■■■■ 5.49
CAMTA1-213ENST00000490738 SOGA1O94964 1423 aa49.31■■■■■ 5.48
CAMTA1-213ENST00000490738 CHD1O14646 1710 aa49.29■■■■■ 5.48
CAMTA1-213ENST00000490738 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP49.23■■■■■ 5.47
CAMTA1-213ENST00000490738 FGD5Q6ZNL6 1462 aa49.22■■■■■ 5.47
CAMTA1-213ENST00000490738 CUX1P39880 1505 aa49.19■■■■■ 5.47
CAMTA1-213ENST00000490738 FBLN2P98095 1184 aa49.17■■■■■ 5.46
CAMTA1-213ENST00000490738 WDR97A6NE52 1622 aa49.05■■■■■ 5.44
CAMTA1-213ENST00000490738 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.01■■■■■ 5.44
CAMTA1-213ENST00000490738 CYB5RLQ6IPT4 315 aa49■■■■■ 5.43
CAMTA1-213ENST00000490738 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.97■■■■■ 5.43
CAMTA1-213ENST00000490738 ARAP1Q96P48 1450 aa48.88■■■■■ 5.42
CAMTA1-213ENST00000490738 GRIN2BQ13224 1484 aa48.86■■■■■ 5.41
CAMTA1-213ENST00000490738 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.86■■■■■ 5.41
CAMTA1-213ENST00000490738 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.82■■■■■ 5.41
CAMTA1-213ENST00000490738 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.77■■■■■ 5.4
CAMTA1-213ENST00000490738 SYNJ2O15056 1496 aa48.72■■■■■ 5.39
CAMTA1-213ENST00000490738 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.7■■■■■ 5.39
CAMTA1-213ENST00000490738 SYNJ1O43426 1573 aa48.69■■■■■ 5.39
CAMTA1-213ENST00000490738 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.66■■■■■ 5.38
CAMTA1-213ENST00000490738 PBRM1Q86U86 1689 aa48.64■■■■■ 5.38
CAMTA1-213ENST00000490738 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.58■■■■■ 5.37
CAMTA1-213ENST00000490738 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.45■■■■■ 5.35
CAMTA1-213ENST00000490738 TRHP20396 242 aaPredicted RBP48.42■■■■■ 5.34
CAMTA1-213ENST00000490738 TOP2BQ02880 1626 aa48.38■■■■■ 5.34
CAMTA1-213ENST00000490738 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.37■■■■■ 5.33
CAMTA1-213ENST00000490738 GRIN2AQ12879 1464 aa48.25■■■■■ 5.31
CAMTA1-213ENST00000490738 ADAMTS12P58397 1594 aa48.21■■■■■ 5.31
CAMTA1-213ENST00000490738 NUP160Q12769 1436 aa48.11■■■■■ 5.29
CAMTA1-213ENST00000490738 CEP170Q5SW79 1584 aa48.09■■■■■ 5.29
CAMTA1-213ENST00000490738 FHAD1B1AJZ9 1412 aa48.08■■■■■ 5.29
CAMTA1-213ENST00000490738 ERCC6L2Q5T890 1561 aa48.04■■■■■ 5.28
CAMTA1-213ENST00000490738 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48.03■■■■■ 5.28
CAMTA1-213ENST00000490738 SHROOM2Q13796 1616 aa47.88■■■■■ 5.25
CAMTA1-213ENST00000490738 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP47.64■■■■■ 5.22
CAMTA1-213ENST00000490738 JPH4Q96JJ6 628 aa47.61■■■■■ 5.21
CAMTA1-213ENST00000490738 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.54■■■■■ 5.2
CAMTA1-213ENST00000490738 IGF1RP08069 1367 aa47.47■■■■■ 5.19
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