RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564634.5

CYLD-208, Transcript of CYLD lysine 63 deubiquitinase, humanhuman

TSL 3

Gene CYLD, Length 539 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLD-208ENST00000564634 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.99■■■■■ 7.67
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CYLD-208ENST00000564634 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.7■■■■■ 6.67
CYLD-208ENST00000564634 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.16■■■■■ 6.26
CYLD-208ENST00000564634 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.87■■■■■ 6.21
CYLD-208ENST00000564634 NACADO15069 1562 aa53.66■■■■■ 6.18
CYLD-208ENST00000564634 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.37■■■■■ 6.13
CYLD-208ENST00000564634 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.12■■■■■ 6.09
CYLD-208ENST00000564634 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53■■■■■ 6.07
CYLD-208ENST00000564634 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.72■■■■■ 6.03
CYLD-208ENST00000564634 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.62■■■■■ 6.01
CYLD-208ENST00000564634 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.15■■■■■ 5.94
CYLD-208ENST00000564634 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.94■■■■■ 5.9
CYLD-208ENST00000564634 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.78■■■■■ 5.88
CYLD-208ENST00000564634 SCRIBQ14160 1630 aa51.75■■■■■ 5.88
CYLD-208ENST00000564634 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.58■■■■■ 5.85
CYLD-208ENST00000564634 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.48■■■■■ 5.83
CYLD-208ENST00000564634 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.36■■■■■ 5.81
CYLD-208ENST00000564634 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.67■■■■■ 5.54
CYLD-208ENST00000564634 NCAPD3P42695 1498 aa49.51■■■■■ 5.52
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CYLD-208ENST00000564634 ERCC6Q03468 1493 aa49.35■■■■■ 5.49
CYLD-208ENST00000564634 CUX2O14529 1486 aa49.32■■■■■ 5.49
CYLD-208ENST00000564634 SMARCA4P51532 1647 aa49.27■■■■■ 5.48
CYLD-208ENST00000564634 SMARCA2P51531 1590 aa49.2■■■■■ 5.47
CYLD-208ENST00000564634 HMGXB3Q12766 1538 aa49.17■■■■■ 5.46
CYLD-208ENST00000564634 NESP48681 1621 aa48.98■■■■■ 5.43
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CYLD-208ENST00000564634 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.71■■■■■ 5.39
CYLD-208ENST00000564634 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.58■■■■■ 5.37
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CYLD-208ENST00000564634 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.35■■■■■ 5.33
CYLD-208ENST00000564634 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.22■■■■■ 5.31
CYLD-208ENST00000564634 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.01■■■■■ 5.28
CYLD-208ENST00000564634 WIZO95785 1651 aa48.01■■■■■ 5.28
CYLD-208ENST00000564634 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.88■■■■■ 5.26
CYLD-208ENST00000564634 WDR62O43379 1518 aa47.77■■■■■ 5.24
CYLD-208ENST00000564634 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.63■■■■■ 5.22
CYLD-208ENST00000564634 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.53■■■■■ 5.2
CYLD-208ENST00000564634 TRIM41Q8WV44 630 aa47.48■■■■■ 5.19
CYLD-208ENST00000564634 CFTRP13569 1480 aa47.4■■■■■ 5.18
CYLD-208ENST00000564634 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.39■■■■■ 5.18
CYLD-208ENST00000564634 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.34■■■■■ 5.17
CYLD-208ENST00000564634 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.19■■■■■ 5.14
CYLD-208ENST00000564634 OSCARQ8IYS5 282 aa46.96■■■■■ 5.11
CYLD-208ENST00000564634 PRDM2Q13029 1718 aa46.96■■■■■ 5.11
CYLD-208ENST00000564634 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.79■■■■■ 5.08
CYLD-208ENST00000564634 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.68■■■■■ 5.06
CYLD-208ENST00000564634 IFT140Q96RY7 1462 aa46.64■■■■■ 5.06
CYLD-208ENST00000564634 TOPBP1Q92547 1522 aa46.59■■■■■ 5.05
CYLD-208ENST00000564634 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.52■■■■■ 5.04
CYLD-208ENST00000564634 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.52■■■■■ 5.04
CYLD-208ENST00000564634 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.52■■■■■ 5.04
CYLD-208ENST00000564634 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.42■■■■■ 5.02
CYLD-208ENST00000564634 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.39■■■■■ 5.02
CYLD-208ENST00000564634 ABCC8Q09428 1581 aa46.37■■■■■ 5.01
CYLD-208ENST00000564634 ARHGEF11O15085 1522 aa46.31■■■■■ 5
CYLD-208ENST00000564634 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.21■■■■■ 4.99
CYLD-208ENST00000564634 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.18■■■■■ 4.98
CYLD-208ENST00000564634 CHD1O14646 1710 aa46.15■■■■■ 4.98
CYLD-208ENST00000564634 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.09■■■■■ 4.97
CYLD-208ENST00000564634 FBLN2P98095 1184 aa45.97■■■■■ 4.95
CYLD-208ENST00000564634 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.96■■■■■ 4.95
CYLD-208ENST00000564634 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.95■■■■■ 4.95
CYLD-208ENST00000564634 ARAP1Q96P48 1450 aa45.85■■■■■ 4.93
CYLD-208ENST00000564634 SOGA1O94964 1423 aa45.84■■■■■ 4.93
CYLD-208ENST00000564634 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.83■■■■■ 4.93
CYLD-208ENST00000564634 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.77■■■■■ 4.92
CYLD-208ENST00000564634 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.74■■■■■ 4.91
CYLD-208ENST00000564634 CUX1P39880 1505 aa45.68■■■■■ 4.9
CYLD-208ENST00000564634 WDR97A6NE52 1622 aa45.65■■■■■ 4.9
CYLD-208ENST00000564634 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.6■■■■■ 4.89
CYLD-208ENST00000564634 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.57■■■■■ 4.89
CYLD-208ENST00000564634 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.53■■■■■ 4.88
CYLD-208ENST00000564634 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.5■■■■■ 4.87
CYLD-208ENST00000564634 SYNJ1O43426 1573 aa45.5■■■■■ 4.87
CYLD-208ENST00000564634 GRIN2BQ13224 1484 aa45.49■■■■■ 4.87
CYLD-208ENST00000564634 SYNJ2O15056 1496 aa45.39■■■■■ 4.86
CYLD-208ENST00000564634 PBRM1Q86U86 1689 aa45.37■■■■■ 4.85
CYLD-208ENST00000564634 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.29■■■■■ 4.84
CYLD-208ENST00000564634 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.23■■■■■ 4.83
CYLD-208ENST00000564634 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.19■■■■■ 4.83
CYLD-208ENST00000564634 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.18■■■■■ 4.82
CYLD-208ENST00000564634 GRIN2AQ12879 1464 aa44.93■■■■■ 4.78
CYLD-208ENST00000564634 ADAMTS12P58397 1594 aa44.91■■■■■ 4.78
CYLD-208ENST00000564634 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.91■■■■■ 4.78
CYLD-208ENST00000564634 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.89■■■■■ 4.78
CYLD-208ENST00000564634 CEP170Q5SW79 1584 aa44.83■■■■■ 4.77
CYLD-208ENST00000564634 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.83■■■■■ 4.77
CYLD-208ENST00000564634 TOP2BQ02880 1626 aa44.8■■■■■ 4.76
CYLD-208ENST00000564634 NUP160Q12769 1436 aa44.77■■■■■ 4.76
CYLD-208ENST00000564634 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.68■■■■■ 4.74
CYLD-208ENST00000564634 SHROOM2Q13796 1616 aa44.64■■■■■ 4.74
CYLD-208ENST00000564634 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.6■■■■■ 4.73
CYLD-208ENST00000564634 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP44.52■■■■■ 4.72
CYLD-208ENST00000564634 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.39■■■■■ 4.7
CYLD-208ENST00000564634 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.29■■■■■ 4.68
CYLD-208ENST00000564634 JPH4Q96JJ6 628 aa44.27■■■■■ 4.68
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