RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483670.5

PDCD4-208, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 5

Gene PDCD4, Length 774 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-208ENST00000483670 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.66■■■■■ 7.62
PDCD4-208ENST00000483670 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.8■■■■■ 6.52
PDCD4-208ENST00000483670 ABCC9O60706 1549 aa54.41■■■■■ 6.3
PDCD4-208ENST00000483670 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.5■■■■■ 5.99
PDCD4-208ENST00000483670 NACADO15069 1562 aa52.45■■■■■ 5.99
PDCD4-208ENST00000483670 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.25■■■■■ 5.95
PDCD4-208ENST00000483670 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.2■■■■■ 5.95
PDCD4-208ENST00000483670 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.2■■■■■ 5.95
PDCD4-208ENST00000483670 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.94■■■■■ 5.91
PDCD4-208ENST00000483670 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.23■■■■■ 5.79
PDCD4-208ENST00000483670 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.8■■■■■ 5.72
PDCD4-208ENST00000483670 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.8■■■■■ 5.72
PDCD4-208ENST00000483670 SCRIBQ14160 1630 aa50.77■■■■■ 5.72
PDCD4-208ENST00000483670 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.47■■■■■ 5.67
PDCD4-208ENST00000483670 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.84■■■■■ 5.57
PDCD4-208ENST00000483670 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.5■■■■■ 5.52
PDCD4-208ENST00000483670 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.28■■■■■ 5.48
PDCD4-208ENST00000483670 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.95■■■■■ 5.43
PDCD4-208ENST00000483670 SMARCA4P51532 1647 aa48.62■■■■■ 5.37
PDCD4-208ENST00000483670 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.62■■■■■ 5.37
PDCD4-208ENST00000483670 SMARCA2P51531 1590 aa48.37■■■■■ 5.33
PDCD4-208ENST00000483670 NCAPD3P42695 1498 aa48.35■■■■■ 5.33
PDCD4-208ENST00000483670 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.34■■■■■ 5.33
PDCD4-208ENST00000483670 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.22■■■■■ 5.31
PDCD4-208ENST00000483670 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.21■■■■■ 5.31
PDCD4-208ENST00000483670 HMGXB3Q12766 1538 aa48.15■■■■■ 5.3
PDCD4-208ENST00000483670 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.97■■■■■ 5.27
PDCD4-208ENST00000483670 WIZO95785 1651 aa47.71■■■■■ 5.23
PDCD4-208ENST00000483670 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.7■■■■■ 5.23
PDCD4-208ENST00000483670 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.28■■■■■ 5.16
PDCD4-208ENST00000483670 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.12■■■■■ 5.13
PDCD4-208ENST00000483670 NESP48681 1621 aa47.05■■■■■ 5.12
PDCD4-208ENST00000483670 ERCC6Q03468 1493 aa46.99■■■■■ 5.11
PDCD4-208ENST00000483670 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.93■■■■■ 5.1
PDCD4-208ENST00000483670 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.79■■■■■ 5.08
PDCD4-208ENST00000483670 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.67■■■■■ 5.06
PDCD4-208ENST00000483670 CFTRP13569 1480 aa46.66■■■■■ 5.06
PDCD4-208ENST00000483670 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.59■■■■■ 5.05
PDCD4-208ENST00000483670 CUX2O14529 1486 aa46.54■■■■■ 5.04
PDCD4-208ENST00000483670 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.43■■■■■ 5.02
PDCD4-208ENST00000483670 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.43■■■■■ 5.02
PDCD4-208ENST00000483670 PRDM2Q13029 1718 aa46.38■■■■■ 5.02
PDCD4-208ENST00000483670 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.38■■■■■ 5.01
PDCD4-208ENST00000483670 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.35■■■■■ 5.01
PDCD4-208ENST00000483670 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.27■■■■■ 5
PDCD4-208ENST00000483670 WDR62O43379 1518 aa46.13■■■■■ 4.97
PDCD4-208ENST00000483670 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.87■■■■■ 4.93
PDCD4-208ENST00000483670 ABCC8Q09428 1581 aa45.75■■■■■ 4.92
PDCD4-208ENST00000483670 TOPBP1Q92547 1522 aa45.63■■■■■ 4.9
PDCD4-208ENST00000483670 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.62■■■■■ 4.89
PDCD4-208ENST00000483670 IFT140Q96RY7 1462 aa45.39■■■■■ 4.86
PDCD4-208ENST00000483670 CUX1P39880 1505 aa45.25■■■■■ 4.83
PDCD4-208ENST00000483670 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.23■■■■■ 4.83
PDCD4-208ENST00000483670 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.14■■■■■ 4.82
PDCD4-208ENST00000483670 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.12■■■■■ 4.81
PDCD4-208ENST00000483670 SOGA1O94964 1423 aa45.07■■■■■ 4.81
PDCD4-208ENST00000483670 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.06■■■■■ 4.8
PDCD4-208ENST00000483670 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.02■■■■■ 4.8
PDCD4-208ENST00000483670 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.02■■■■■ 4.8
PDCD4-208ENST00000483670 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.98■■■■■ 4.79
PDCD4-208ENST00000483670 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.97■■■■■ 4.79
PDCD4-208ENST00000483670 TOP2BQ02880 1626 aa44.94■■■■■ 4.79
PDCD4-208ENST00000483670 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.94■■■■■ 4.79
PDCD4-208ENST00000483670 WDR97A6NE52 1622 aa44.93■■■■■ 4.78
PDCD4-208ENST00000483670 SYNJ1O43426 1573 aa44.86■■■■■ 4.77
PDCD4-208ENST00000483670 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.83■■■■■ 4.77
PDCD4-208ENST00000483670 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.75■■■■■ 4.75
PDCD4-208ENST00000483670 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.74■■■■■ 4.75
PDCD4-208ENST00000483670 OSCARQ8IYS5 282 aa44.58■■■■■ 4.73
PDCD4-208ENST00000483670 GRIN2BQ13224 1484 aa44.57■■■■■ 4.73
PDCD4-208ENST00000483670 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.56■■■■■ 4.72
PDCD4-208ENST00000483670 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.54■■■■■ 4.72
PDCD4-208ENST00000483670 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.49■■■■■ 4.71
PDCD4-208ENST00000483670 PBRM1Q86U86 1689 aa44.48■■■■■ 4.71
PDCD4-208ENST00000483670 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.45■■■■■ 4.71
PDCD4-208ENST00000483670 CHD1O14646 1710 aa44.39■■■■■ 4.7
PDCD4-208ENST00000483670 FBLN2P98095 1184 aa44.3■■■■■ 4.68
PDCD4-208ENST00000483670 SYNJ2O15056 1496 aa44.28■■■■■ 4.68
PDCD4-208ENST00000483670 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.25■■■■■ 4.67
PDCD4-208ENST00000483670 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.24■■■■■ 4.67
PDCD4-208ENST00000483670 KIF27Q86VH2 1401 aa44.11■■■■■ 4.65
PDCD4-208ENST00000483670 ADAMTS12P58397 1594 aa44.1■■■■■ 4.65
PDCD4-208ENST00000483670 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.07■■■■■ 4.64
PDCD4-208ENST00000483670 GRIN2AQ12879 1464 aa43.97■■■■■ 4.63
PDCD4-208ENST00000483670 TRIM41Q8WV44 630 aa43.95■■■■■ 4.63
PDCD4-208ENST00000483670 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.92■■■■■ 4.62
PDCD4-208ENST00000483670 IGF1RP08069 1367 aa43.86■■■■■ 4.61
PDCD4-208ENST00000483670 CUL7Q14999 1698 aa43.86■■■■■ 4.61
PDCD4-208ENST00000483670 ARHGEF11O15085 1522 aa43.82■■■■■ 4.61
PDCD4-208ENST00000483670 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.81■■■■■ 4.6
PDCD4-208ENST00000483670 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.81■■■■■ 4.6
PDCD4-208ENST00000483670 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.81■■■■■ 4.6
PDCD4-208ENST00000483670 NUP160Q12769 1436 aa43.79■■■■■ 4.6
PDCD4-208ENST00000483670 CEP170Q5SW79 1584 aa43.71■■■■■ 4.59
PDCD4-208ENST00000483670 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.63■■■■■ 4.57
PDCD4-208ENST00000483670 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.54■■■■■ 4.56
PDCD4-208ENST00000483670 SHROOM2Q13796 1616 aa43.47■■■■■ 4.55
PDCD4-208ENST00000483670 ARAP1Q96P48 1450 aa43.44■■■■■ 4.54
PDCD4-208ENST00000483670 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.4■■■■■ 4.54
PDCD4-208ENST00000483670 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.39■■■■■ 4.54
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