RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465669.1

RAPH1-212, Transcript of Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, humanhuman

TSL 2

Gene RAPH1, Length 360 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPH1-212ENST00000465669 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.91■■■■■ 6.54
RAPH1-212ENST00000465669 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.62■■■■■ 5.53
RAPH1-212ENST00000465669 ABCC9O60706 1549 aa48.78■■■■■ 5.4
RAPH1-212ENST00000465669 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.97■■■■■ 5.11
RAPH1-212ENST00000465669 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.78■■■■■ 5.08
RAPH1-212ENST00000465669 NACADO15069 1562 aa46.7■■■■■ 5.07
RAPH1-212ENST00000465669 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.55■■■■■ 5.04
RAPH1-212ENST00000465669 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.33■■■■■ 5.01
RAPH1-212ENST00000465669 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.15■■■■■ 4.98
RAPH1-212ENST00000465669 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.72■■■■■ 4.91
RAPH1-212ENST00000465669 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.66■■■■■ 4.9
RAPH1-212ENST00000465669 SCRIBQ14160 1630 aa45.44■■■■■ 4.86
RAPH1-212ENST00000465669 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.39■■■■■ 4.86
RAPH1-212ENST00000465669 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.84■■■■■ 4.77
RAPH1-212ENST00000465669 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.77■■■■■ 4.76
RAPH1-212ENST00000465669 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.19■■■■■ 4.66
RAPH1-212ENST00000465669 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.06■■■■■ 4.64
RAPH1-212ENST00000465669 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.79■■■■■ 4.6
RAPH1-212ENST00000465669 SMARCA4P51532 1647 aa43.38■■■■■ 4.54
RAPH1-212ENST00000465669 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.31■■■■■ 4.52
RAPH1-212ENST00000465669 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.18■■■■■ 4.5
RAPH1-212ENST00000465669 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.14■■■■■ 4.5
RAPH1-212ENST00000465669 NCAPD3P42695 1498 aa43.12■■■■■ 4.49
RAPH1-212ENST00000465669 SMARCA2P51531 1590 aa43.07■■■■■ 4.49
RAPH1-212ENST00000465669 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.87■■■■■ 4.45
RAPH1-212ENST00000465669 HMGXB3Q12766 1538 aa42.87■■■■■ 4.45
RAPH1-212ENST00000465669 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.83■■■■■ 4.45
RAPH1-212ENST00000465669 WIZO95785 1651 aa42.68■■■■■ 4.42
RAPH1-212ENST00000465669 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.63■■■■■ 4.41
RAPH1-212ENST00000465669 NESP48681 1621 aa42.2■■■■■ 4.35
RAPH1-212ENST00000465669 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.17■■■■■ 4.34
RAPH1-212ENST00000465669 ERCC6Q03468 1493 aa42.03■■■■■ 4.32
RAPH1-212ENST00000465669 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.96■■■■■ 4.31
RAPH1-212ENST00000465669 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.91■■■■■ 4.3
RAPH1-212ENST00000465669 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.74■■■■■ 4.27
RAPH1-212ENST00000465669 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.72■■■■■ 4.27
RAPH1-212ENST00000465669 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
RAPH1-212ENST00000465669 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.63■■■■■ 4.25
RAPH1-212ENST00000465669 CFTRP13569 1480 aa41.61■■■■■ 4.25
RAPH1-212ENST00000465669 CUX2O14529 1486 aa41.49■■■■■ 4.23
RAPH1-212ENST00000465669 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
RAPH1-212ENST00000465669 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.44■■■■■ 4.22
RAPH1-212ENST00000465669 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.38■■■■■ 4.21
RAPH1-212ENST00000465669 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.32■■■■■ 4.2
RAPH1-212ENST00000465669 PRDM2Q13029 1718 aa41.23■■■■■ 4.19
RAPH1-212ENST00000465669 WDR62O43379 1518 aa41.14■■■■■ 4.18
RAPH1-212ENST00000465669 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
RAPH1-212ENST00000465669 TOPBP1Q92547 1522 aa40.77■■■■■ 4.12
RAPH1-212ENST00000465669 ABCC8Q09428 1581 aa40.69■■■■■ 4.1
RAPH1-212ENST00000465669 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.68■■■■■ 4.1
RAPH1-212ENST00000465669 IFT140Q96RY7 1462 aa40.49■■■■■ 4.07
RAPH1-212ENST00000465669 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.46■■■■■ 4.07
RAPH1-212ENST00000465669 CUX1P39880 1505 aa40.46■■■■■ 4.07
RAPH1-212ENST00000465669 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
RAPH1-212ENST00000465669 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.06
RAPH1-212ENST00000465669 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.33■■■■■ 4.05
RAPH1-212ENST00000465669 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.32■■■■■ 4.04
RAPH1-212ENST00000465669 SOGA1O94964 1423 aa40.29■■■■■ 4.04
RAPH1-212ENST00000465669 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
RAPH1-212ENST00000465669 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.2■■■■■ 4.03
RAPH1-212ENST00000465669 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.17■■■■■ 4.02
RAPH1-212ENST00000465669 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
RAPH1-212ENST00000465669 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
RAPH1-212ENST00000465669 SYNJ1O43426 1573 aa40.1■■■■■ 4.01
RAPH1-212ENST00000465669 TOP2BQ02880 1626 aa40.05■■■■■ 4
RAPH1-212ENST00000465669 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.03■■■■■ 4
RAPH1-212ENST00000465669 WDR97A6NE52 1622 aa39.91■■■■□ 3.98
RAPH1-212ENST00000465669 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.89■■■■□ 3.98
RAPH1-212ENST00000465669 OSCARQ8IYS5 282 aa39.87■■■■□ 3.97
RAPH1-212ENST00000465669 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.8■■■■□ 3.96
RAPH1-212ENST00000465669 FBLN2P98095 1184 aa39.78■■■■□ 3.96
RAPH1-212ENST00000465669 GRIN2BQ13224 1484 aa39.78■■■■□ 3.96
RAPH1-212ENST00000465669 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.76■■■■□ 3.96
RAPH1-212ENST00000465669 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.72■■■■□ 3.95
RAPH1-212ENST00000465669 PBRM1Q86U86 1689 aa39.67■■■■□ 3.94
RAPH1-212ENST00000465669 CHD1O14646 1710 aa39.67■■■■□ 3.94
RAPH1-212ENST00000465669 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.63■■■■□ 3.94
RAPH1-212ENST00000465669 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.6■■■■□ 3.93
RAPH1-212ENST00000465669 SYNJ2O15056 1496 aa39.51■■■■□ 3.92
RAPH1-212ENST00000465669 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.39■■■■□ 3.9
RAPH1-212ENST00000465669 ADAMTS12P58397 1594 aa39.37■■■■□ 3.89
RAPH1-212ENST00000465669 KIF27Q86VH2 1401 aa39.35■■■■□ 3.89
RAPH1-212ENST00000465669 TRIM41Q8WV44 630 aa39.32■■■■□ 3.89
RAPH1-212ENST00000465669 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.31■■■■□ 3.88
RAPH1-212ENST00000465669 GRIN2AQ12879 1464 aa39.26■■■■□ 3.88
RAPH1-212ENST00000465669 IGF1RP08069 1367 aa39.21■■■■□ 3.87
RAPH1-212ENST00000465669 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.2■■■■□ 3.87
RAPH1-212ENST00000465669 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.19■■■■□ 3.86
RAPH1-212ENST00000465669 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.19■■■■□ 3.86
RAPH1-212ENST00000465669 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.19■■■■□ 3.86
RAPH1-212ENST00000465669 ARHGEF11O15085 1522 aa39.18■■■■□ 3.86
RAPH1-212ENST00000465669 CEP170Q5SW79 1584 aa39.08■■■■□ 3.85
RAPH1-212ENST00000465669 NUP160Q12769 1436 aa39.07■■■■□ 3.85
RAPH1-212ENST00000465669 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.07■■■■□ 3.84
RAPH1-212ENST00000465669 CUL7Q14999 1698 aa39.02■■■■□ 3.84
RAPH1-212ENST00000465669 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39■■■■□ 3.83
RAPH1-212ENST00000465669 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.94■■■■□ 3.82
RAPH1-212ENST00000465669 ARAP1Q96P48 1450 aa38.88■■■■□ 3.81
RAPH1-212ENST00000465669 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.83■■■■□ 3.81
RAPH1-212ENST00000465669 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.76■■■■□ 3.8
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