Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 PHGDH-221ENST00000641573 1180 nt14.13□□□□□ -0.153e-8■■■■■ 240.4
UTP3Q9NQZ2 PHGDH-203ENST00000462324 767 ntTSL 514.03□□□□□ -0.163e-8■■■■■ 240.4
UTP3Q9NQZ2 PHGDH-218ENST00000641491 986 nt13.92□□□□□ -0.183e-8■■■■■ 240.4
UTP3Q9NQZ2 PHGDH-220ENST00000641570 1036 nt13.92□□□□□ -0.183e-8■■■■■ 240.4
UTP3Q9NQZ2 PHGDH-222ENST00000641587 566 nt10.53□□□□□ -0.723e-8■■■■■ 240.4
UTP3Q9NQZ2 PHGDH-215ENST00000641371 725 nt10.34□□□□□ -0.753e-8■■■■■ 240.4
UTP3Q9NQZ2 PHGDH-212ENST00000641247 710 nt10.18□□□□□ -0.783e-8■■■■■ 240.4
UTP3Q9NQZ2 PHGDH-206ENST00000493622 742 ntTSL 59.68□□□□□ -0.863e-8■■■■■ 240.4
UTP3Q9NQZ2 ACAP2-212ENST00000481463 561 ntTSL 321.01■□□□□ 0.951e-10■■■■■ 240.4
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC12-218ENST00000479897 454 ntTSL 313.41□□□□□ -0.262e-14■■■■■ 240.4
UTP3Q9NQZ2 PGD-203ENST00000465632 642 ntTSL 214.09□□□□□ -0.156e-8■■■■■ 240.2
UTP3Q9NQZ2 KLHDC4-218ENST00000567298 4572 ntTSL 516.87■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 239.9
UTP3Q9NQZ2 PIGQ-218ENST00000635909 2212 ntTSL 520.22■□□□□ 0.835e-8■■■■■ 239.8
UTP3Q9NQZ2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.745e-8■■■■■ 239.8
UTP3Q9NQZ2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.55e-8■■■■■ 239.8
UTP3Q9NQZ2 PIGQ-221ENST00000636657 2841 ntTSL 517.53■□□□□ 0.45e-8■■■■■ 239.8
UTP3Q9NQZ2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.168e-8■■■■■ 239.7
UTP3Q9NQZ2 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.131e-6■■■■■ 239.6
UTP3Q9NQZ2 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.441e-6■■■■■ 239.6
UTP3Q9NQZ2 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 239.6
UTP3Q9NQZ2 HIPK2-203ENST00000428878 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 239.6
UTP3Q9NQZ2 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.121e-6■■■■■ 239.6
UTP3Q9NQZ2 BCORL1-203ENST00000456822 5648 ntTSL 515.64■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 239.2
UTP3Q9NQZ2 RHPN1-203ENST00000522899 1778 ntTSL 518.93■□□□□ 0.621e-31■■■■■ 239.1
UTP3Q9NQZ2 PFKFB3-205ENST00000379789 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 239.1
UTP3Q9NQZ2 DAPK1-217ENST00000496522 579 ntTSL 216.85■□□□□ 0.296e-7■■■■■ 239.1
UTP3Q9NQZ2 DAPK1-210ENST00000472344 548 ntTSL 515.56■□□□□ 0.086e-7■■■■■ 239.1
UTP3Q9NQZ2 WDPCP-201ENST00000272321 3392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.421e-8■■■■■ 239
UTP3Q9NQZ2 PIEZO1-206ENST00000474606 544 ntTSL 418.82■□□□□ 0.64e-10■■■■■ 238.8
UTP3Q9NQZ2 HNRNPM-206ENST00000596984 664 ntTSL 519.81■□□□□ 0.767e-7■■■■■ 238.5
UTP3Q9NQZ2 LCMT1-205ENST00000570981 612 ntTSL 210.16□□□□□ -0.787e-8■■■■■ 238.4
UTP3Q9NQZ2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.034e-7■■■■■ 238.3
UTP3Q9NQZ2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.534e-7■■■■■ 238.3
UTP3Q9NQZ2 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.034e-7■■■■■ 238.3
UTP3Q9NQZ2 TBC1D5-227ENST00000485432 566 ntTSL 422.14■■□□□ 1.138e-7■■■■■ 238.3
UTP3Q9NQZ2 PIP5K1C-208ENST00000637724 435 ntTSL 321.32■■□□□ 14e-7■■■■■ 238
UTP3Q9NQZ2 WDR27-212ENST00000546953 3175 ntTSL 211.44□□□□□ -0.584e-10■■■■■ 238
UTP3Q9NQZ2 PIP5K1C-204ENST00000587482 1311 ntTSL 517.5■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 237.7
UTP3Q9NQZ2 KLHL22-208ENST00000470335 824 ntTSL 221.77■■□□□ 1.083e-9■■■■■ 237.6
UTP3Q9NQZ2 KLHL22-203ENST00000431430 572 ntTSL 416.66■□□□□ 0.263e-9■■■■■ 237.6
UTP3Q9NQZ2 RNF145-207ENST00000519985 894 ntTSL 39.93□□□□□ -0.823e-24■■■■■ 237.6
UTP3Q9NQZ2 SRRM1-213ENST00000485441 561 ntTSL 38.85□□□□□ -0.994e-22■■■■■ 237.6
UTP3Q9NQZ2 MAD1L1-205ENST00000421113 564 ntTSL 420.55■□□□□ 0.883e-8■■■■■ 237.4
UTP3Q9NQZ2 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.044e-13■■■■■ 237.2
UTP3Q9NQZ2 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.214e-13■■■■■ 237.2
UTP3Q9NQZ2 BCCIP-201ENST00000278100 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.424e-13■■■■■ 237.2
UTP3Q9NQZ2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.143e-8■■■■■ 237.2
UTP3Q9NQZ2 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.193e-8■■■■■ 237.2
UTP3Q9NQZ2 PGAM5-202ENST00000454808 1084 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.213e-8■■■■■ 237.2
UTP3Q9NQZ2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.384e-7■■■■■ 237.2
UTP3Q9NQZ2 CYTH1-217ENST00000592497 454 ntTSL 38.92□□□□□ -0.982e-15■■■■■ 237.2
UTP3Q9NQZ2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.931e-6■■■■■ 237.1
UTP3Q9NQZ2 RBBP6-211ENST00000568316 556 ntTSL 526.73■■□□□ 1.871e-16■■■■■ 237.1
UTP3Q9NQZ2 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.022e-9■■■■■ 237
UTP3Q9NQZ2 SPART-211ENST00000495510 2001 ntTSL 214.14□□□□□ -0.152e-12■■■■■ 237
UTP3Q9NQZ2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.193e-8■■■■■ 236.8
UTP3Q9NQZ2 DEDD2-203ENST00000593804 1586 ntTSL 221.44■■□□□ 1.023e-8■■■■■ 236.8
UTP3Q9NQZ2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.993e-8■■■■■ 236.8
UTP3Q9NQZ2 POLR1A-203ENST00000409681 6454 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.561e-9■■■■■ 236.8
UTP3Q9NQZ2 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.091e-9■■■■■ 236.8
UTP3Q9NQZ2 CNTROB-214ENST00000576723 2461 ntTSL 214.87□□□□□ -0.039e-10■■■■■ 236.6
UTP3Q9NQZ2 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.159e-10■■■■■ 236.6
UTP3Q9NQZ2 CNTROB-202ENST00000563694 3705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.29e-10■■■■■ 236.6
UTP3Q9NQZ2 CNTROB-201ENST00000380262 3769 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.299e-10■■■■■ 236.6
UTP3Q9NQZ2 CNTROB-207ENST00000571632 2960 ntTSL 212.87□□□□□ -0.359e-10■■■■■ 236.6
UTP3Q9NQZ2 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.384e-7■■■■■ 236.4
UTP3Q9NQZ2 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.744e-7■■■■■ 236.4
UTP3Q9NQZ2 NOSTRIN-208ENST00000447264 794 ntTSL 57.71□□□□□ -1.184e-7■■■■■ 236.4
UTP3Q9NQZ2 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.244e-7■■■■■ 236.4
UTP3Q9NQZ2 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.374e-7■■■■■ 236.4
UTP3Q9NQZ2 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.374e-7■■■■■ 236.4
UTP3Q9NQZ2 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.394e-7■■■■■ 236.4
UTP3Q9NQZ2 RCOR3-208ENST00000526255 909 ntTSL 1 (best)7□□□□□ -1.294e-52■■■■■ 236.4
UTP3Q9NQZ2 FAM207A-203ENST00000458015 643 ntTSL 521.4■■□□□ 1.021e-6■■■■■ 236.3
UTP3Q9NQZ2 CLSTN3-201ENST00000266546 4185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.43e-11■■■■■ 236.2
UTP3Q9NQZ2 CLSTN3-207ENST00000537408 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.473e-11■■■■■ 236.2
UTP3Q9NQZ2 CAMSAP1-207ENST00000483991 4342 ntTSL 211.65□□□□□ -0.543e-11■■■■■ 236.2
UTP3Q9NQZ2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.662e-6■■■■■ 236
UTP3Q9NQZ2 MAN1B1-215ENST00000545539 573 ntTSL 424.85■■□□□ 1.571e-27■■■■■ 236
UTP3Q9NQZ2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.562e-6■■■■■ 236
UTP3Q9NQZ2 CHID1-216ENST00000529539 602 ntTSL 222.51■■□□□ 1.193e-11■■■■■ 236
UTP3Q9NQZ2 MON2-208ENST00000549378 1689 ntTSL 1 (best)22.25■■□□□ 1.151e-27■■■■■ 236
UTP3Q9NQZ2 DDX11-220ENST00000542244 1193 ntTSL 1 (best)21.17■□□□□ 0.981e-27■■■■■ 236
UTP3Q9NQZ2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 236
UTP3Q9NQZ2 CHID1-223ENST00000534207 1171 ntTSL 519.18■□□□□ 0.663e-11■■■■■ 236
UTP3Q9NQZ2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.572e-8■■■■■ 236
UTP3Q9NQZ2 ZNF205-203ENST00000414351 1006 ntTSL 317.56■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 236
UTP3Q9NQZ2 MAN1B1-210ENST00000540346 570 ntTSL 416.86■□□□□ 0.291e-27■■■■■ 236
UTP3Q9NQZ2 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 236
UTP3Q9NQZ2 DDX11-207ENST00000535317 879 ntTSL 315.76■□□□□ 0.111e-27■■■■■ 236
UTP3Q9NQZ2 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.082e-8■■■■■ 236
UTP3Q9NQZ2 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.082e-8■■■■■ 236
UTP3Q9NQZ2 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.031e-9■■■■■ 236
UTP3Q9NQZ2 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.142e-8■■■■■ 236
UTP3Q9NQZ2 PPP1R32-203ENST00000432063 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.161e-9■■■■■ 236
UTP3Q9NQZ2 DDX11-227ENST00000544652 400 ntTSL 514□□□□□ -0.171e-27■■■■■ 236
UTP3Q9NQZ2 TNS1-221ENST00000615025 6488 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.32e-8■■■■■ 236
UTP3Q9NQZ2 MON2-207ENST00000549286 424 ntTSL 513.01□□□□□ -0.331e-27■■■■■ 236
UTP3Q9NQZ2 CLCN6-202ENST00000346436 5583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 236
UTP3Q9NQZ2 LIG3-207ENST00000586119 565 ntTSL 312.34□□□□□ -0.431e-12■■■■■ 236
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