RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568316.1

RBBP6-211, Transcript of RB binding protein 6, ubiquitin ligase, human

TSL 5

Gene RBBP6, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP6-211	ENST00000568316	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		59.31	■■■■■ 7.09
RBBP6-211	ENST00000568316	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		52.44	■■■■■ 5.99
RBBP6-211	ENST00000568316	ABCC9	O60706	1549 aa		50.91	■■■■■ 5.74
RBBP6-211	ENST00000568316	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	49.53	■■■■■ 5.52
RBBP6-211	ENST00000568316	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		49.43	■■■■■ 5.5
RBBP6-211	ENST00000568316	NACAD	O15069	1562 aa		49.19	■■■■■ 5.46
RBBP6-211	ENST00000568316	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		49.13	■■■■■ 5.46
RBBP6-211	ENST00000568316	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		49.04	■■■■■ 5.44
RBBP6-211	ENST00000568316	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		49.01	■■■■■ 5.44
RBBP6-211	ENST00000568316	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		48.04	■■■■■ 5.28
RBBP6-211	ENST00000568316	SCRIB	Q14160	1630 aa		48.01	■■■■■ 5.28
RBBP6-211	ENST00000568316	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	47.68	■■■■■ 5.22
RBBP6-211	ENST00000568316	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		47.64	■■■■■ 5.22
RBBP6-211	ENST00000568316	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		47.33	■■■■■ 5.17
RBBP6-211	ENST00000568316	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	46.35	■■■■■ 5.01
RBBP6-211	ENST00000568316	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		46.21	■■■■■ 4.99
RBBP6-211	ENST00000568316	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		46.19	■■■■■ 4.99
RBBP6-211	ENST00000568316	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		46.03	■■■■■ 4.96
RBBP6-211	ENST00000568316	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	45.92	■■■■■ 4.94
RBBP6-211	ENST00000568316	SMARCA4	P51532	1647 aa		45.92	■■■■■ 4.94
RBBP6-211	ENST00000568316	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		45.76	■■■■■ 4.92
RBBP6-211	ENST00000568316	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		45.52	■■■■■ 4.88
RBBP6-211	ENST00000568316	SMARCA2	P51531	1590 aa		45.48	■■■■■ 4.87
RBBP6-211	ENST00000568316	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	45.42	■■■■■ 4.86
RBBP6-211	ENST00000568316	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		45.41	■■■■■ 4.86
RBBP6-211	ENST00000568316	NCAPD3	P42695	1498 aa		45.38	■■■■■ 4.86
RBBP6-211	ENST00000568316	WIZ	O95785	1651 aa		45.3	■■■■■ 4.84
RBBP6-211	ENST00000568316	HMGXB3	Q12766	1538 aa		45.21	■■■■■ 4.83
RBBP6-211	ENST00000568316	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	45.2	■■■■■ 4.83
RBBP6-211	ENST00000568316	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	44.82	■■■■■ 4.77
RBBP6-211	ENST00000568316	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	44.77	■■■■■ 4.76
RBBP6-211	ENST00000568316	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		44.3	■■■■■ 4.68
RBBP6-211	ENST00000568316	NES	P48681	1621 aa		44.21	■■■■■ 4.67
RBBP6-211	ENST00000568316	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		44.11	■■■■■ 4.65
RBBP6-211	ENST00000568316	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		44.1	■■■■■ 4.65
RBBP6-211	ENST00000568316	CFTR	P13569	1480 aa		43.96	■■■■■ 4.63
RBBP6-211	ENST00000568316	ERCC6	Q03468	1493 aa		43.83	■■■■■ 4.61
RBBP6-211	ENST00000568316	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		43.8	■■■■■ 4.6
RBBP6-211	ENST00000568316	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		43.68	■■■■■ 4.58
RBBP6-211	ENST00000568316	PRDM2	Q13029	1718 aa		43.65	■■■■■ 4.58
RBBP6-211	ENST00000568316	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		43.64	■■■■■ 4.58
RBBP6-211	ENST00000568316	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		43.53	■■■■■ 4.56
RBBP6-211	ENST00000568316	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	43.38	■■■■■ 4.54
RBBP6-211	ENST00000568316	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		43.35	■■■■■ 4.53
RBBP6-211	ENST00000568316	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	43.17	■■■■■ 4.5
RBBP6-211	ENST00000568316	WDR62	O43379	1518 aa		43.17	■■■■■ 4.5
RBBP6-211	ENST00000568316	CUX2	O14529	1486 aa		43.08	■■■■■ 4.49
RBBP6-211	ENST00000568316	TOPBP1	Q92547	1522 aa		43	■■■■■ 4.47
RBBP6-211	ENST00000568316	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		42.99	■■■■■ 4.47
RBBP6-211	ENST00000568316	ABCC8	Q09428	1581 aa		42.95	■■■■■ 4.47
RBBP6-211	ENST00000568316	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		42.91	■■■■■ 4.46
RBBP6-211	ENST00000568316	CUX1	P39880	1505 aa		42.9	■■■■■ 4.46
RBBP6-211	ENST00000568316	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	42.81	■■■■■ 4.44
RBBP6-211	ENST00000568316	SYNJ1	O43426	1573 aa		42.7	■■■■■ 4.43
RBBP6-211	ENST00000568316	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	42.68	■■■■■ 4.42
RBBP6-211	ENST00000568316	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		42.67	■■■■■ 4.42
RBBP6-211	ENST00000568316	TOP2B	Q02880	1626 aa		42.64	■■■■■ 4.42
RBBP6-211	ENST00000568316	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		42.62	■■■■■ 4.41
RBBP6-211	ENST00000568316	IFT140	Q96RY7	1462 aa		42.56	■■■■■ 4.4
RBBP6-211	ENST00000568316	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		42.52	■■■■■ 4.4
RBBP6-211	ENST00000568316	SOGA1	O94964	1423 aa		42.5	■■■■■ 4.39
RBBP6-211	ENST00000568316	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	42.46	■■■■■ 4.39
RBBP6-211	ENST00000568316	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	42.38	■■■■■ 4.37
RBBP6-211	ENST00000568316	WDR97	A6NE52	1622 aa		42.26	■■■■■ 4.36
RBBP6-211	ENST00000568316	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		42.24	■■■■■ 4.35
RBBP6-211	ENST00000568316	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	42.23	■■■■■ 4.35
RBBP6-211	ENST00000568316	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	42.22	■■■■■ 4.35
RBBP6-211	ENST00000568316	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	42.2	■■■■■ 4.35
RBBP6-211	ENST00000568316	TRIM41	Q8WV44	630 aa		42.2	■■■■■ 4.35
RBBP6-211	ENST00000568316	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		42.05	■■■■■ 4.32
RBBP6-211	ENST00000568316	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		42.03	■■■■■ 4.32
RBBP6-211	ENST00000568316	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		42.03	■■■■■ 4.32
RBBP6-211	ENST00000568316	GRIN2B	Q13224	1484 aa		41.93	■■■■■ 4.3
RBBP6-211	ENST00000568316	PBRM1	Q86U86	1689 aa		41.9	■■■■■ 4.3
RBBP6-211	ENST00000568316	KIF27	Q86VH2	1401 aa		41.86	■■■■■ 4.29
RBBP6-211	ENST00000568316	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		41.84	■■■■■ 4.29
RBBP6-211	ENST00000568316	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	41.75	■■■■■ 4.27
RBBP6-211	ENST00000568316	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		41.73	■■■■■ 4.27
RBBP6-211	ENST00000568316	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		41.71	■■■■■ 4.27
RBBP6-211	ENST00000568316	FBLN2	P98095	1184 aa		41.63	■■■■■ 4.25
RBBP6-211	ENST00000568316	IGF1R	P08069	1367 aa		41.62	■■■■■ 4.25
RBBP6-211	ENST00000568316	ADAMTS12	P58397	1594 aa		41.61	■■■■■ 4.25
RBBP6-211	ENST00000568316	CHD1	O14646	1710 aa		41.59	■■■■■ 4.25
RBBP6-211	ENST00000568316	SYNJ2	O15056	1496 aa		41.59	■■■■■ 4.25
RBBP6-211	ENST00000568316	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	41.56	■■■■■ 4.24
RBBP6-211	ENST00000568316	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		41.54	■■■■■ 4.24
RBBP6-211	ENST00000568316	CUL7	Q14999	1698 aa		41.47	■■■■■ 4.23
RBBP6-211	ENST00000568316	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		41.42	■■■■■ 4.22
RBBP6-211	ENST00000568316	GRIN2A	Q12879	1464 aa		41.41	■■■■■ 4.22
RBBP6-211	ENST00000568316	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		41.4	■■■■■ 4.22
RBBP6-211	ENST00000568316	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	41.4	■■■■■ 4.22
RBBP6-211	ENST00000568316	EEA1	Q15075	1411 aa		41.39	■■■■■ 4.22
RBBP6-211	ENST00000568316	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		41.3	■■■■■ 4.2
RBBP6-211	ENST00000568316	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		41.21	■■■■■ 4.19
RBBP6-211	ENST00000568316	PRX	Q9BXM0	1461 aa		41.19	■■■■■ 4.18
RBBP6-211	ENST00000568316	CEP170	Q5SW79	1584 aa		41.19	■■■■■ 4.18
RBBP6-211	ENST00000568316	NUP160	Q12769	1436 aa		41.18	■■■■■ 4.18
RBBP6-211	ENST00000568316	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		41.12	■■■■■ 4.17
RBBP6-211	ENST00000568316	KIF21B	O75037	1637 aa		40.95	■■■■■ 4.15
RBBP6-211	ENST00000568316	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		40.92	■■■■■ 4.14

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms