RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545539.5

MAN1B1-215, Transcript of mannosidase alpha class 1B member 1, humanhuman

TSL 4

Gene MAN1B1, Length 573 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAN1B1-215ENST00000545539 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.04■■■■■ 6.72
MAN1B1-215ENST00000545539 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.88■■■■■ 5.74
MAN1B1-215ENST00000545539 ABCC9O60706 1549 aa50.06■■■■■ 5.6
MAN1B1-215ENST00000545539 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.05■■■■■ 5.28
MAN1B1-215ENST00000545539 NACADO15069 1562 aa47.92■■■■■ 5.26
MAN1B1-215ENST00000545539 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.86■■■■■ 5.25
MAN1B1-215ENST00000545539 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.5■■■■■ 5.19
MAN1B1-215ENST00000545539 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.46■■■■■ 5.19
MAN1B1-215ENST00000545539 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.19■■■■■ 5.14
MAN1B1-215ENST00000545539 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.91■■■■■ 5.1
MAN1B1-215ENST00000545539 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.71■■■■■ 5.07
MAN1B1-215ENST00000545539 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.52■■■■■ 5.04
MAN1B1-215ENST00000545539 SCRIBQ14160 1630 aa46.4■■■■■ 5.02
MAN1B1-215ENST00000545539 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.12■■■■■ 4.97
MAN1B1-215ENST00000545539 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.08■■■■■ 4.97
MAN1B1-215ENST00000545539 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.37■■■■■ 4.85
MAN1B1-215ENST00000545539 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.26■■■■■ 4.84
MAN1B1-215ENST00000545539 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.02■■■■■ 4.8
MAN1B1-215ENST00000545539 SMARCA4P51532 1647 aa44.35■■■■■ 4.69
MAN1B1-215ENST00000545539 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.27■■■■■ 4.68
MAN1B1-215ENST00000545539 NCAPD3P42695 1498 aa44.17■■■■■ 4.66
MAN1B1-215ENST00000545539 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.16■■■■■ 4.66
MAN1B1-215ENST00000545539 SMARCA2P51531 1590 aa44.14■■■■■ 4.66
MAN1B1-215ENST00000545539 HMGXB3Q12766 1538 aa43.96■■■■■ 4.63
MAN1B1-215ENST00000545539 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.94■■■■■ 4.62
MAN1B1-215ENST00000545539 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.89■■■■■ 4.62
MAN1B1-215ENST00000545539 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.83■■■■■ 4.61
MAN1B1-215ENST00000545539 WIZO95785 1651 aa43.48■■■■■ 4.55
MAN1B1-215ENST00000545539 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.33■■■■■ 4.53
MAN1B1-215ENST00000545539 ERCC6Q03468 1493 aa43.24■■■■■ 4.51
MAN1B1-215ENST00000545539 NESP48681 1621 aa43.2■■■■■ 4.51
MAN1B1-215ENST00000545539 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.11■■■■■ 4.49
MAN1B1-215ENST00000545539 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.01■■■■■ 4.48
MAN1B1-215ENST00000545539 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.89■■■■■ 4.46
MAN1B1-215ENST00000545539 CUX2O14529 1486 aa42.84■■■■■ 4.45
MAN1B1-215ENST00000545539 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.84■■■■■ 4.45
MAN1B1-215ENST00000545539 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.72■■■■■ 4.43
MAN1B1-215ENST00000545539 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.63■■■■■ 4.41
MAN1B1-215ENST00000545539 CFTRP13569 1480 aa42.56■■■■■ 4.4
MAN1B1-215ENST00000545539 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.49■■■■■ 4.39
MAN1B1-215ENST00000545539 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.42■■■■■ 4.38
MAN1B1-215ENST00000545539 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.42■■■■■ 4.38
MAN1B1-215ENST00000545539 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.4■■■■■ 4.38
MAN1B1-215ENST00000545539 PRDM2Q13029 1718 aa42.26■■■■■ 4.36
MAN1B1-215ENST00000545539 WDR62O43379 1518 aa42.25■■■■■ 4.35
MAN1B1-215ENST00000545539 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.07■■■■■ 4.33
MAN1B1-215ENST00000545539 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
MAN1B1-215ENST00000545539 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.83■■■■■ 4.29
MAN1B1-215ENST00000545539 ABCC8Q09428 1581 aa41.71■■■■■ 4.27
MAN1B1-215ENST00000545539 TOPBP1Q92547 1522 aa41.69■■■■■ 4.26
MAN1B1-215ENST00000545539 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.63■■■■■ 4.26
MAN1B1-215ENST00000545539 IFT140Q96RY7 1462 aa41.52■■■■■ 4.24
MAN1B1-215ENST00000545539 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.2
MAN1B1-215ENST00000545539 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
MAN1B1-215ENST00000545539 CUX1P39880 1505 aa41.25■■■■■ 4.19
MAN1B1-215ENST00000545539 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
MAN1B1-215ENST00000545539 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
MAN1B1-215ENST00000545539 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.18■■■■■ 4.18
MAN1B1-215ENST00000545539 SOGA1O94964 1423 aa41.16■■■■■ 4.18
MAN1B1-215ENST00000545539 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.13■■■■■ 4.17
MAN1B1-215ENST00000545539 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.06■■■■■ 4.16
MAN1B1-215ENST00000545539 OSCARQ8IYS5 282 aa41.02■■■■■ 4.16
MAN1B1-215ENST00000545539 WDR97A6NE52 1622 aa40.96■■■■■ 4.15
MAN1B1-215ENST00000545539 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
MAN1B1-215ENST00000545539 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.91■■■■■ 4.14
MAN1B1-215ENST00000545539 TOP2BQ02880 1626 aa40.84■■■■■ 4.13
MAN1B1-215ENST00000545539 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.84■■■■■ 4.13
MAN1B1-215ENST00000545539 SYNJ1O43426 1573 aa40.8■■■■■ 4.12
MAN1B1-215ENST00000545539 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.76■■■■■ 4.12
MAN1B1-215ENST00000545539 GRIN2BQ13224 1484 aa40.72■■■■■ 4.11
MAN1B1-215ENST00000545539 CHD1O14646 1710 aa40.72■■■■■ 4.11
MAN1B1-215ENST00000545539 FBLN2P98095 1184 aa40.7■■■■■ 4.11
MAN1B1-215ENST00000545539 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.7■■■■■ 4.11
MAN1B1-215ENST00000545539 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.69■■■■■ 4.1
MAN1B1-215ENST00000545539 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
MAN1B1-215ENST00000545539 PBRM1Q86U86 1689 aa40.63■■■■■ 4.1
MAN1B1-215ENST00000545539 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.63■■■■■ 4.09
MAN1B1-215ENST00000545539 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
MAN1B1-215ENST00000545539 SYNJ2O15056 1496 aa40.49■■■■■ 4.07
MAN1B1-215ENST00000545539 TRIM41Q8WV44 630 aa40.4■■■■■ 4.06
MAN1B1-215ENST00000545539 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.37■■■■■ 4.05
MAN1B1-215ENST00000545539 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.37■■■■■ 4.05
MAN1B1-215ENST00000545539 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.37■■■■■ 4.05
MAN1B1-215ENST00000545539 ARHGEF11O15085 1522 aa40.34■■■■■ 4.05
MAN1B1-215ENST00000545539 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.29■■■■■ 4.04
MAN1B1-215ENST00000545539 ADAMTS12P58397 1594 aa40.27■■■■■ 4.04
MAN1B1-215ENST00000545539 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.25■■■■■ 4.03
MAN1B1-215ENST00000545539 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.2■■■■■ 4.03
MAN1B1-215ENST00000545539 GRIN2AQ12879 1464 aa40.19■■■■■ 4.02
MAN1B1-215ENST00000545539 KIF27Q86VH2 1401 aa40.1■■■■■ 4.01
MAN1B1-215ENST00000545539 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40■■■■□ 3.99
MAN1B1-215ENST00000545539 NUP160Q12769 1436 aa39.99■■■■□ 3.99
MAN1B1-215ENST00000545539 CEP170Q5SW79 1584 aa39.98■■■■□ 3.99
MAN1B1-215ENST00000545539 ARAP1Q96P48 1450 aa39.97■■■■□ 3.99
MAN1B1-215ENST00000545539 IGF1RP08069 1367 aa39.91■■■■□ 3.98
MAN1B1-215ENST00000545539 CUL7Q14999 1698 aa39.89■■■■□ 3.98
MAN1B1-215ENST00000545539 SHROOM2Q13796 1616 aa39.73■■■■□ 3.95
MAN1B1-215ENST00000545539 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.71■■■■□ 3.95
MAN1B1-215ENST00000545539 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.68■■■■□ 3.94
MAN1B1-215ENST00000545539 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.64■■■■□ 3.94
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