Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 ELK4-204ENST00000616704 2535 ntTSL 223■■□□□ 1.274e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 VGLL4-205ENST00000417466 894 ntTSL 322.36■■□□□ 1.174e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.154e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.014e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.014e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.934e-7■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.824e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 WIPF2-203ENST00000494757 2113 ntTSL 1 (best)19.85■□□□□ 0.775e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.711e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.635e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 PBX3-211ENST00000497091 425 ntTSL 518.87■□□□□ 0.614e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.582e-21■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 VGLL4-218ENST00000623028 728 ntTSL 518.63■□□□□ 0.574e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.564e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 LSM14A-207ENST00000589878 559 ntTSL 418.36■□□□□ 0.534e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.524e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 PBX3-202ENST00000373482 1130 ntTSL 1 (best)18.12■□□□□ 0.494e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 PBX3-205ENST00000373492 950 ntTSL 1 (best)18.12■□□□□ 0.494e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.482e-21■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 KDM6A-207ENST00000475233 612 ntTSL 517.87■□□□□ 0.451e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 SOAT2-202ENST00000542365 1797 ntTSL 217.7■□□□□ 0.424e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.424e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 VGLL4-204ENST00000417206 581 ntTSL 417.67■□□□□ 0.424e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.44e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.42e-21■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 PARN-209ENST00000563641 1029 ntTSL 517.49■□□□□ 0.394e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.375e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 PBX3-209ENST00000491787 875 ntTSL 517.24■□□□□ 0.354e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 EBP-203ENST00000446158 714 ntTSL 516.9■□□□□ 0.32e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 IQSEC1-202ENST00000473088 545 ntTSL 416.87■□□□□ 0.294e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.281e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.264e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 GAK-217ENST00000511980 1768 ntTSL 516.62■□□□□ 0.254e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.255e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CALD1-209ENST00000436461 1614 ntTSL 516.47■□□□□ 0.234e-6■■■■□ 20.7
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ILF3Q12906 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.214e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.211e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.191e-6■■■■□ 20.7
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ILF3Q12906 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.161e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.141e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 NDUFAF5-214ENST00000485738 718 ntTSL 515.82■□□□□ 0.124e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.041e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 EFHC1-235ENST00000637849 2746 ntTSL 515.16■□□□□ 0.024e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 AC004922.1-202ENST00000441989 1702 ntTSL 215.14■□□□□ 0.014e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 PRKRIP1-203ENST00000468316 2045 ntTSL 1 (best)15.14■□□□□ 0.014e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.011e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.014e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.024e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.034e-6■■■■□ 20.7
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ILF3Q12906 CMIP-206ENST00000565029 1559 ntTSL 1 (best)14.72□□□□□ -0.054e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.074e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.074e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 NDUFAF5-201ENST00000378081 2409 ntTSL 214.5□□□□□ -0.094e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.094e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.14e-6■■■■□ 20.7
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ILF3Q12906 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.124e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.124e-6■■■■□ 20.7
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ILF3Q12906 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.134e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.142e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.144e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 GAK-213ENST00000510799 763 ntTSL 1 (best)14.18□□□□□ -0.144e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 WIPF2-206ENST00000582781 3163 ntTSL 1 (best)14.12□□□□□ -0.155e-6■■■■□ 20.7
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ILF3Q12906 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.174e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 EBP-202ENST00000414061 609 ntTSL 313.94□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.184e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 VGLL4-207ENST00000419541 466 ntTSL 313.89□□□□□ -0.194e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 GAK-211ENST00000509566 3126 ntTSL 213.85□□□□□ -0.194e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.194e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 ARPC1A-204ENST00000471960 741 ntTSL 313.78□□□□□ -0.24e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CALD1-207ENST00000430085 1938 ntTSL 213.72□□□□□ -0.214e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.214e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.235e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 NDUFAF5-213ENST00000481249 676 ntTSL 513.5□□□□□ -0.254e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 NDUFAF5-206ENST00000475968 933 ntTSL 513.5□□□□□ -0.254e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.264e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.274e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CHEK2-213ENST00000433028 1349 ntTSL 513.3□□□□□ -0.285e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 KBTBD2-207ENST00000485611 537 ntTSL 413.22□□□□□ -0.294e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 SUMF1-204ENST00000448413 3150 ntTSL 213.16□□□□□ -0.34e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 PAQR8-203ENST00000512121 582 ntTSL 313.01□□□□□ -0.334e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.371e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CHEK2-210ENST00000416671 2560 ntTSL 1 (best)12.62□□□□□ -0.395e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 LCMT1-201ENST00000380962 1529 ntTSL 212.54□□□□□ -0.44e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 KDM6A-201ENST00000377967 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.431e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 PANK3-201ENST00000239231 10506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.464e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.484e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 RPRD2-204ENST00000492220 4780 ntTSL 512.03□□□□□ -0.484e-6■■■■□ 20.7
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