Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 PTCH1-213ENST00000546820 864 ntTSL 1 (best)14.73□□□□□ -0.051e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 INTS12-210ENST00000515819 569 ntTSL 314.62□□□□□ -0.071e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 PTCH1-215ENST00000547672 881 ntTSL 1 (best)14.36□□□□□ -0.111e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 DGUOK-205ENST00000462685 715 ntTSL 314.35□□□□□ -0.111e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 PMS1-204ENST00000409823 2795 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.221e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 TTF2-205ENST00000470935 849 ntTSL 512.65□□□□□ -0.381e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 PTCH1-222ENST00000551425 241 ntTSL 1 (best)12.64□□□□□ -0.391e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 PACSIN1-206ENST00000538621 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.451e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 AL356414.1-201ENST00000379526 686 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.491e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 TSSK3-203ENST00000574315 273 ntTSL 311.87□□□□□ -0.511e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 CYTH1-208ENST00000587308 553 ntTSL 511.56□□□□□ -0.561e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 PTCH1-225ENST00000551845 809 ntTSL 511.34□□□□□ -0.591e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 DGUOK-204ENST00000462551 573 ntTSL 210.94□□□□□ -0.661e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 DGUOK-206ENST00000489796 692 ntTSL 310.91□□□□□ -0.661e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 INTS12-201ENST00000340139 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.671e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 CYTH1-204ENST00000586043 836 ntTSL 310.33□□□□□ -0.761e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 FUCA2-203ENST00000451668 737 ntTSL 29.7□□□□□ -0.861e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 POLR1A-207ENST00000483538 593 ntTSL 49.55□□□□□ -0.881e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 PSMD2-216ENST00000488085 543 ntTSL 49.34□□□□□ -0.911e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.181e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.211e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 CYTH1-211ENST00000589768 988 ntTSL 37.12□□□□□ -1.271e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 PMS1-208ENST00000421722 2285 ntTSL 27.07□□□□□ -1.281e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 PMS1-217ENST00000450931 2817 ntTSL 27□□□□□ -1.291e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 USP2-207ENST00000532613 637 ntTSL 26.99□□□□□ -1.291e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 INTS12-204ENST00000420368 726 ntTSL 56.74□□□□□ -1.331e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 INTS12-208ENST00000503746 653 ntTSL 56.32□□□□□ -1.41e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 INTS12-205ENST00000433009 562 ntTSL 46.25□□□□□ -1.411e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 DGUOK-207ENST00000493055 593 ntTSL 25.8□□□□□ -1.481e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 PMS1-216ENST00000447734 570 ntTSL 55.48□□□□□ -1.531e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 PMS1-209ENST00000424059 2004 ntTSL 1 (best)4.84□□□□□ -1.631e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 PTCH1-223ENST00000551623 366 ntTSL 1 (best)4.27□□□□□ -1.731e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.791e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 PMS1-210ENST00000424307 2153 ntTSL 53.19□□□□□ -1.91e-16■■■■■ 250
UTP3Q9NQZ2 UBP1-205ENST00000456378 581 ntTSL 425.32■■□□□ 1.641e-15■■■■■ 249.7
UTP3Q9NQZ2 UBP1-213ENST00000496310 544 ntTSL 47.51□□□□□ -1.211e-15■■■■■ 249.7
UTP3Q9NQZ2 MAP4K2-204ENST00000433890 2410 ntTSL 520.47■□□□□ 0.876e-8■■■■■ 249.6
UTP3Q9NQZ2 WDPCP-207ENST00000409835 2277 ntTSL 1 (best)16.2■□□□□ 0.186e-13■■■■■ 249.5
UTP3Q9NQZ2 WDPCP-209ENST00000418148 576 ntTSL 412.03□□□□□ -0.486e-13■■■■■ 249.5
UTP3Q9NQZ2 WDPCP-208ENST00000417238 2883 ntTSL 211.1□□□□□ -0.636e-13■■■■■ 249.5
UTP3Q9NQZ2 WDPCP-206ENST00000409562 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.866e-13■■■■■ 249.5
UTP3Q9NQZ2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.251e-9■■■■■ 249.1
UTP3Q9NQZ2 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.011e-9■■■■■ 249.1
UTP3Q9NQZ2 HDAC4-204ENST00000446876 554 ntTSL 415.91■□□□□ 0.143e-7■■■■■ 249
UTP3Q9NQZ2 HDAC4-214ENST00000535493 2743 ntTSL 214.61□□□□□ -0.073e-7■■■■■ 249
UTP3Q9NQZ2 HDAC4-208ENST00000463007 3158 ntTSL 1 (best)13.63□□□□□ -0.233e-7■■■■■ 249
UTP3Q9NQZ2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 248.7
UTP3Q9NQZ2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.892e-27■■■■■ 248.4
UTP3Q9NQZ2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.052e-8■■■■■ 248.4
UTP3Q9NQZ2 RBSN-205ENST00000449964 1132 ntTSL 520.97■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 248.4
UTP3Q9NQZ2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.662e-27■■■■■ 248.4
UTP3Q9NQZ2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.444e-12■■■■■ 248.4
UTP3Q9NQZ2 CCAR2-205ENST00000520738 2633 ntTSL 217.28■□□□□ 0.363e-11■■■■■ 248.4
UTP3Q9NQZ2 NFS1-211ENST00000480655 2653 ntTSL 216.77■□□□□ 0.282e-14■■■■■ 248.4
UTP3Q9NQZ2 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.268e-7■■■■■ 248.4
UTP3Q9NQZ2 SERTAD3-204ENST00000599706 747 ntTSL 215.29■□□□□ 0.042e-23■■■■■ 248.4
UTP3Q9NQZ2 SPTLC2-202ENST00000554365 604 ntTSL 214.8□□□□□ -0.044e-29■■■■■ 248.4
UTP3Q9NQZ2 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 248.4
UTP3Q9NQZ2 ZC3H18-208ENST00000566496 1949 ntTSL 213.8□□□□□ -0.21e-17■■■■■ 248.4
UTP3Q9NQZ2 ZC3H18-206ENST00000565583 1068 ntTSL 213.73□□□□□ -0.211e-17■■■■■ 248.4
UTP3Q9NQZ2 NOD1-201ENST00000222823 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.262e-14■■■■■ 248.4
UTP3Q9NQZ2 BCORL1-202ENST00000441294 2221 ntTSL 1 (best)13.16□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 248.4
UTP3Q9NQZ2 MTO1-210ENST00000485082 600 ntTSL 212.88□□□□□ -0.354e-29■■■■■ 248.4
UTP3Q9NQZ2 RBSN-201ENST00000253699 6678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 248.4
UTP3Q9NQZ2 NOD1-206ENST00000434755 4610 ntTSL 212.04□□□□□ -0.482e-14■■■■■ 248.4
UTP3Q9NQZ2 SLC35F5-205ENST00000447673 725 ntTSL 39.32□□□□□ -0.922e-23■■■■■ 248.4
UTP3Q9NQZ2 MSANTD3-TMEFF1-201ENST00000502978 2069 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.942e-8■■■■■ 248.4
UTP3Q9NQZ2 AMPD3-202ENST00000396553 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.968e-7■■■■■ 248.4
UTP3Q9NQZ2 AMPD3-204ENST00000444303 3994 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.968e-7■■■■■ 248.4
UTP3Q9NQZ2 LINC00922-201ENST00000564041 1243 ntTSL 1 (best)8.94□□□□□ -0.981e-9■■■■■ 248.4
UTP3Q9NQZ2 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.058e-7■■■■■ 248.4
UTP3Q9NQZ2 NFS1-213ENST00000498084 977 ntTSL 37.71□□□□□ -1.182e-14■■■■■ 248.4
UTP3Q9NQZ2 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.21e-9■■■■■ 248.4
UTP3Q9NQZ2 LINC00922-202ENST00000568492 844 ntTSL 1 (best)7.29□□□□□ -1.241e-9■■■■■ 248.4
UTP3Q9NQZ2 SLC35F5-210ENST00000470204 523 ntTSL 57.01□□□□□ -1.292e-23■■■■■ 248.4
UTP3Q9NQZ2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.491e-11■■■■■ 248.2
UTP3Q9NQZ2 TNFRSF1B-203ENST00000492361 3583 ntTSL 1 (best)17.01■□□□□ 0.313e-7■■■■■ 247.9
UTP3Q9NQZ2 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.173e-7■■■■■ 247.9
UTP3Q9NQZ2 GALK2-216ENST00000560031 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 247.9
UTP3Q9NQZ2 GALK2-212ENST00000559454 1768 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 247.9
UTP3Q9NQZ2 GALK2-202ENST00000396509 1834 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.612e-6■■■■■ 247.9
UTP3Q9NQZ2 GALK2-217ENST00000560119 2053 ntTSL 210.72□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 247.9
UTP3Q9NQZ2 GALK2-203ENST00000544523 1950 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 247.9
UTP3Q9NQZ2 USP36-205ENST00000586531 898 ntTSL 329.51■■■□□ 2.313e-6■■■■■ 247.6
UTP3Q9NQZ2 USP36-224ENST00000592907 543 ntTSL 224.91■■□□□ 1.583e-6■■■■■ 247.6
UTP3Q9NQZ2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.443e-6■■■■■ 247.6
UTP3Q9NQZ2 USP36-209ENST00000587783 679 ntTSL 323.73■■□□□ 1.393e-6■■■■■ 247.6
UTP3Q9NQZ2 USP36-220ENST00000591942 564 ntTSL 522.99■■□□□ 1.273e-6■■■■■ 247.6
UTP3Q9NQZ2 USP36-212ENST00000588365 546 ntTSL 422.51■■□□□ 1.193e-6■■■■■ 247.6
UTP3Q9NQZ2 USP36-222ENST00000592275 594 ntTSL 414.88□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 247.6
UTP3Q9NQZ2 PLEC-215ENST00000532346 316 ntTSL 316.09■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 247.4
UTP3Q9NQZ2 PDXK-214ENST00000476084 602 ntTSL 323.75■■□□□ 1.392e-9■■■■■ 247.2
UTP3Q9NQZ2 SPSB3-203ENST00000563705 876 ntTSL 522.45■■□□□ 1.181e-7■■■■■ 247.2
UTP3Q9NQZ2 SPSB3-207ENST00000565550 898 ntTSL 220.06■□□□□ 0.81e-7■■■■■ 247.2
UTP3Q9NQZ2 SPSB3-205ENST00000564070 714 ntTSL 317.07■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 247.2
UTP3Q9NQZ2 SPSB3-212ENST00000569769 580 ntTSL 313.47□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 247.2
UTP3Q9NQZ2 PIGQ-208ENST00000443147 2054 ntTSL 223.27■■□□□ 1.326e-8■■■■■ 246.9
UTP3Q9NQZ2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.986e-8■■■■■ 246.9
UTP3Q9NQZ2 LATS1-205ENST00000542720 1096 ntTSL 1 (best)18.94■□□□□ 0.622e-8■■■■■ 246.9
UTP3Q9NQZ2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.432e-8■■■■■ 246.9
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