RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449964.6

RBSN-205, Transcript of rabenosyn, RAB effector, humanhuman

TSL 5

Gene RBSN, Length 1,132 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBSN-205ENST00000449964 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.31■■■■■ 5.48
RBSN-205ENST00000449964 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.07■■■■■ 4.65
RBSN-205ENST00000449964 ABCC9O60706 1549 aa43.99■■■■■ 4.63
RBSN-205ENST00000449964 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.95■■■■■ 4.31
RBSN-205ENST00000449964 NACADO15069 1562 aa41.73■■■■■ 4.27
RBSN-205ENST00000449964 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.69■■■■■ 4.26
RBSN-205ENST00000449964 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.23■■■■■ 4.19
RBSN-205ENST00000449964 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.19■■■■■ 4.18
RBSN-205ENST00000449964 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.07■■■■■ 4.17
RBSN-205ENST00000449964 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
RBSN-205ENST00000449964 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.84■■■■■ 4.13
RBSN-205ENST00000449964 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.76■■■■■ 4.12
RBSN-205ENST00000449964 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.67■■■■■ 4.1
RBSN-205ENST00000449964 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.22■■■■■ 4.03
RBSN-205ENST00000449964 SCRIBQ14160 1630 aa40.17■■■■■ 4.02
RBSN-205ENST00000449964 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.71■■■■□ 3.95
RBSN-205ENST00000449964 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
RBSN-205ENST00000449964 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.63■■■■□ 3.94
RBSN-205ENST00000449964 NCAPD3P42695 1498 aa38.57■■■■□ 3.76
RBSN-205ENST00000449964 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.44■■■■□ 3.74
RBSN-205ENST00000449964 SMARCA4P51532 1647 aa38.37■■■■□ 3.73
RBSN-205ENST00000449964 SMARCA2P51531 1590 aa38.32■■■■□ 3.73
RBSN-205ENST00000449964 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.26■■■■□ 3.72
RBSN-205ENST00000449964 HMGXB3Q12766 1538 aa38.21■■■■□ 3.71
RBSN-205ENST00000449964 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.06■■■■□ 3.68
RBSN-205ENST00000449964 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.03■■■■□ 3.68
RBSN-205ENST00000449964 ERCC6Q03468 1493 aa38■■■■□ 3.67
RBSN-205ENST00000449964 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.96■■■■□ 3.67
RBSN-205ENST00000449964 CUX2O14529 1486 aa37.88■■■■□ 3.65
RBSN-205ENST00000449964 NESP48681 1621 aa37.82■■■■□ 3.64
RBSN-205ENST00000449964 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.76■■■■□ 3.64
RBSN-205ENST00000449964 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.61■■■■□ 3.61
RBSN-205ENST00000449964 WIZO95785 1651 aa37.47■■■■□ 3.59
RBSN-205ENST00000449964 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.47■■■■□ 3.59
RBSN-205ENST00000449964 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.42■■■■□ 3.58
RBSN-205ENST00000449964 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
RBSN-205ENST00000449964 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.3■■■■□ 3.56
RBSN-205ENST00000449964 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.25■■■■□ 3.55
RBSN-205ENST00000449964 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.06■■■■□ 3.52
RBSN-205ENST00000449964 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.05■■■■□ 3.52
RBSN-205ENST00000449964 CFTRP13569 1480 aa37■■■■□ 3.51
RBSN-205ENST00000449964 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.94■■■■□ 3.5
RBSN-205ENST00000449964 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.94■■■■□ 3.5
RBSN-205ENST00000449964 WDR62O43379 1518 aa36.93■■■■□ 3.5
RBSN-205ENST00000449964 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.69■■■■□ 3.46
RBSN-205ENST00000449964 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
RBSN-205ENST00000449964 PRDM2Q13029 1718 aa36.44■■■■□ 3.42
RBSN-205ENST00000449964 OSCARQ8IYS5 282 aa36.3■■■■□ 3.4
RBSN-205ENST00000449964 ABCC8Q09428 1581 aa36.26■■■■□ 3.39
RBSN-205ENST00000449964 IFT140Q96RY7 1462 aa36.24■■■■□ 3.39
RBSN-205ENST00000449964 TOPBP1Q92547 1522 aa36.24■■■■□ 3.39
RBSN-205ENST00000449964 TRIM41Q8WV44 630 aa36.13■■■■□ 3.37
RBSN-205ENST00000449964 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
RBSN-205ENST00000449964 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.09■■■■□ 3.37
RBSN-205ENST00000449964 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
RBSN-205ENST00000449964 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
RBSN-205ENST00000449964 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.86■■■■□ 3.332e-6■■■□□ 15.7
RBSN-205ENST00000449964 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
RBSN-205ENST00000449964 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
RBSN-205ENST00000449964 SOGA1O94964 1423 aa35.8■■■■□ 3.32
RBSN-205ENST00000449964 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.75■■■■□ 3.31
RBSN-205ENST00000449964 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
RBSN-205ENST00000449964 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.67■■■■□ 3.3
RBSN-205ENST00000449964 FBLN2P98095 1184 aa35.66■■■■□ 3.3
RBSN-205ENST00000449964 CUX1P39880 1505 aa35.65■■■■□ 3.3
RBSN-205ENST00000449964 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.61■■■■□ 3.29
RBSN-205ENST00000449964 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.61■■■■□ 3.29
RBSN-205ENST00000449964 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.61■■■■□ 3.29
RBSN-205ENST00000449964 ARHGEF11O15085 1522 aa35.55■■■■□ 3.28
RBSN-205ENST00000449964 WDR97A6NE52 1622 aa35.54■■■■□ 3.28
RBSN-205ENST00000449964 CHD1O14646 1710 aa35.51■■■■□ 3.27
RBSN-205ENST00000449964 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
RBSN-205ENST00000449964 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.45■■■■□ 3.27
RBSN-205ENST00000449964 GRIN2BQ13224 1484 aa35.43■■■■□ 3.26
RBSN-205ENST00000449964 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.42■■■■□ 3.26
RBSN-205ENST00000449964 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
RBSN-205ENST00000449964 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.33■■■■□ 3.25
RBSN-205ENST00000449964 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.31■■■■□ 3.24
RBSN-205ENST00000449964 SYNJ2O15056 1496 aa35.29■■■■□ 3.24
RBSN-205ENST00000449964 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.25■■■■□ 3.23
RBSN-205ENST00000449964 SYNJ1O43426 1573 aa35.21■■■■□ 3.23
RBSN-205ENST00000449964 ARAP1Q96P48 1450 aa35.21■■■■□ 3.23
RBSN-205ENST00000449964 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.19■■■■□ 3.22
RBSN-205ENST00000449964 PBRM1Q86U86 1689 aa35.15■■■■□ 3.22
RBSN-205ENST00000449964 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.15■■■■□ 3.22
RBSN-205ENST00000449964 TOP2BQ02880 1626 aa35.13■■■■□ 3.21
RBSN-205ENST00000449964 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.09■■■■□ 3.21
RBSN-205ENST00000449964 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
RBSN-205ENST00000449964 GRIN2AQ12879 1464 aa34.94■■■■□ 3.18
RBSN-205ENST00000449964 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.9■■■■□ 3.18
RBSN-205ENST00000449964 ADAMTS12P58397 1594 aa34.87■■■■□ 3.17
RBSN-205ENST00000449964 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.86■■■■□ 3.17
RBSN-205ENST00000449964 NUP160Q12769 1436 aa34.83■■■■□ 3.17
RBSN-205ENST00000449964 CEP170Q5SW79 1584 aa34.75■■■■□ 3.15
RBSN-205ENST00000449964 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.63■■■■□ 3.13
RBSN-205ENST00000449964 JPH4Q96JJ6 628 aa34.6■■■■□ 3.13
RBSN-205ENST00000449964 SHROOM2Q13796 1616 aa34.59■■■■□ 3.13
RBSN-205ENST00000449964 KIF27Q86VH2 1401 aa34.55■■■■□ 3.12
RBSN-205ENST00000449964 IGF1RP08069 1367 aa34.54■■■■□ 3.12
RBSN-205ENST00000449964 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
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