RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592907.5

USP36-224, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 2

Gene USP36, Length 543 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-224ENST00000592907 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.95■■■■■ 7.03
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USP36-224ENST00000592907 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.79■■■■■ 5.4
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USP36-224ENST00000592907 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.36■■■■■ 5.17
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USP36-224ENST00000592907 ERCC6Q03468 1493 aa45.37■■■■■ 4.85
USP36-224ENST00000592907 CUX2O14529 1486 aa45.3■■■■■ 4.84
USP36-224ENST00000592907 NESP48681 1621 aa45.18■■■■■ 4.82
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USP36-224ENST00000592907 WIZO95785 1651 aa44.76■■■■■ 4.76
USP36-224ENST00000592907 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.75■■■■■ 4.76
USP36-224ENST00000592907 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.7■■■■■ 4.75
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USP36-224ENST00000592907 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.32■■■■■ 4.69
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USP36-224ENST00000592907 CFTRP13569 1480 aa44.23■■■■■ 4.67
USP36-224ENST00000592907 WDR62O43379 1518 aa44.19■■■■■ 4.66
USP36-224ENST00000592907 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.16■■■■■ 4.66
USP36-224ENST00000592907 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.15■■■■■ 4.66
USP36-224ENST00000592907 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.82■■■■■ 4.6
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USP36-224ENST00000592907 TOPBP1Q92547 1522 aa43.32■■■■■ 4.52
USP36-224ENST00000592907 IFT140Q96RY7 1462 aa43.32■■■■■ 4.52
USP36-224ENST00000592907 OSCARQ8IYS5 282 aa43.27■■■■■ 4.52
USP36-224ENST00000592907 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.16■■■■■ 4.5
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USP36-224ENST00000592907 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.63■■■■■ 4.42
USP36-224ENST00000592907 CUX1P39880 1505 aa42.62■■■■■ 4.41
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USP36-224ENST00000592907 WDR97A6NE52 1622 aa42.55■■■■■ 4.4
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USP36-224ENST00000592907 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.55■■■■■ 4.4
USP36-224ENST00000592907 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.55■■■■■ 4.4
USP36-224ENST00000592907 ARHGEF11O15085 1522 aa42.51■■■■■ 4.39
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USP36-224ENST00000592907 CHD1O14646 1710 aa42.44■■■■■ 4.38
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USP36-224ENST00000592907 GRIN2BQ13224 1484 aa42.35■■■■■ 4.37
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USP36-224ENST00000592907 CEP170Q5SW79 1584 aa41.56■■■■■ 4.24
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USP36-224ENST00000592907 SHROOM2Q13796 1616 aa41.39■■■■■ 4.22
USP36-224ENST00000592907 KIF27Q86VH2 1401 aa41.25■■■■■ 4.19
USP36-224ENST00000592907 JPH4Q96JJ6 628 aa41.24■■■■■ 4.19
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USP36-224ENST00000592907 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
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