RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590546.6

USP36-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,771 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-218ENST00000590546 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.88■■■■■ 5.57
USP36-218ENST00000590546 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.36■■■■■ 4.53
USP36-218ENST00000590546 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
USP36-218ENST00000590546 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.32■■■■■ 4.21
USP36-218ENST00000590546 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.04■■■■■ 4.16
USP36-218ENST00000590546 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.81■■■■■ 4.12
USP36-218ENST00000590546 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.74■■■■■ 4.11
USP36-218ENST00000590546 ABCC9O60706 1549 aa40.6■■■■■ 4.09
USP36-218ENST00000590546 NACADO15069 1562 aa40.33■■■■■ 4.05
USP36-218ENST00000590546 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.88■■■■□ 3.97
USP36-218ENST00000590546 SCRIBQ14160 1630 aa39.82■■■■□ 3.96
USP36-218ENST00000590546 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.51■■■■□ 3.91
USP36-218ENST00000590546 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.96■■■■□ 3.83
USP36-218ENST00000590546 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.81■■■■□ 3.8
USP36-218ENST00000590546 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.66■■■■□ 3.78
USP36-218ENST00000590546 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.59■■■■□ 3.77
USP36-218ENST00000590546 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.52■■■■□ 3.76
USP36-218ENST00000590546 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.49■■■■□ 3.75
USP36-218ENST00000590546 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.35■■■■□ 3.73
USP36-218ENST00000590546 SMARCA4P51532 1647 aa38.25■■■■□ 3.71
USP36-218ENST00000590546 WIZO95785 1651 aa38.18■■■■□ 3.7
USP36-218ENST00000590546 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.04■■■■□ 3.68
USP36-218ENST00000590546 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.86■■■■□ 3.65
USP36-218ENST00000590546 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.82■■■■□ 3.64
USP36-218ENST00000590546 SMARCA2P51531 1590 aa37.6■■■■□ 3.61
USP36-218ENST00000590546 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.56■■■■□ 3.6
USP36-218ENST00000590546 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.47■■■■□ 3.59
USP36-218ENST00000590546 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.43■■■■□ 3.58
USP36-218ENST00000590546 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
USP36-218ENST00000590546 NCAPD3P42695 1498 aa37.22■■■■□ 3.55
USP36-218ENST00000590546 TRIM41Q8WV44 630 aa37.2■■■■□ 3.55
USP36-218ENST00000590546 HMGXB3Q12766 1538 aa37.19■■■■□ 3.54
USP36-218ENST00000590546 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.77■■■■□ 3.48
USP36-218ENST00000590546 ABCC8Q09428 1581 aa36.72■■■■□ 3.47
USP36-218ENST00000590546 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.56■■■■□ 3.44
USP36-218ENST00000590546 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.53■■■■□ 3.44
USP36-218ENST00000590546 CFTRP13569 1480 aa36.47■■■■□ 3.43
USP36-218ENST00000590546 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
USP36-218ENST00000590546 EEA1Q15075 1411 aa36.31■■■■□ 3.4
USP36-218ENST00000590546 SYNJ1O43426 1573 aa36.31■■■■□ 3.4
USP36-218ENST00000590546 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.28■■■■□ 3.4
USP36-218ENST00000590546 PRDM2Q13029 1718 aa36.27■■■■□ 3.4
USP36-218ENST00000590546 TOP2BQ02880 1626 aa36.2■■■■□ 3.39
USP36-218ENST00000590546 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.15■■■■□ 3.38
USP36-218ENST00000590546 SOGA1O94964 1423 aa36.14■■■■□ 3.38
USP36-218ENST00000590546 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.02■■■■□ 3.36
USP36-218ENST00000590546 CUX1P39880 1505 aa35.98■■■■□ 3.35
USP36-218ENST00000590546 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.94■■■■□ 3.34
USP36-218ENST00000590546 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.89■■■■□ 3.34
USP36-218ENST00000590546 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.85■■■■□ 3.33
USP36-218ENST00000590546 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.81■■■■□ 3.32
USP36-218ENST00000590546 GOLGA3Q08378 1498 aa35.75■■■■□ 3.31
USP36-218ENST00000590546 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.73■■■■□ 3.31
USP36-218ENST00000590546 KIF21BO75037 1637 aa35.73■■■■□ 3.31
USP36-218ENST00000590546 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.72■■■■□ 3.31
USP36-218ENST00000590546 NESP48681 1621 aa35.72■■■■□ 3.31
USP36-218ENST00000590546 KIF27Q86VH2 1401 aa35.64■■■■□ 3.3
USP36-218ENST00000590546 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.64■■■■□ 3.3
USP36-218ENST00000590546 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.61■■■■□ 3.29
USP36-218ENST00000590546 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.6■■■■□ 3.29
USP36-218ENST00000590546 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
USP36-218ENST00000590546 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.55■■■■□ 3.28
USP36-218ENST00000590546 CEP162Q5TB80 1403 aa35.5■■■■□ 3.27
USP36-218ENST00000590546 TOPBP1Q92547 1522 aa35.49■■■■□ 3.27
USP36-218ENST00000590546 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.46■■■■□ 3.27
USP36-218ENST00000590546 PRXQ9BXM0 1461 aa35.45■■■■□ 3.27
USP36-218ENST00000590546 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.41■■■■□ 3.26
USP36-218ENST00000590546 CUX2O14529 1486 aa35.4■■■■□ 3.26
USP36-218ENST00000590546 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
USP36-218ENST00000590546 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
USP36-218ENST00000590546 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.31■■■■□ 3.24
USP36-218ENST00000590546 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.29■■■■□ 3.24
USP36-218ENST00000590546 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
USP36-218ENST00000590546 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.26■■■■□ 3.24
USP36-218ENST00000590546 IGF1RP08069 1367 aa35.24■■■■□ 3.23
USP36-218ENST00000590546 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.19■■■■□ 3.22
USP36-218ENST00000590546 CLIP1P30622 1438 aa35.17■■■■□ 3.22
USP36-218ENST00000590546 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.11■■■■□ 3.21
USP36-218ENST00000590546 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.1■■■■□ 3.21
USP36-218ENST00000590546 WDR97A6NE52 1622 aa35.07■■■■□ 3.21
USP36-218ENST00000590546 CUL7Q14999 1698 aa34.97■■■■□ 3.19
USP36-218ENST00000590546 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.93■■■■□ 3.18
USP36-218ENST00000590546 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.92■■■■□ 3.18
USP36-218ENST00000590546 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
USP36-218ENST00000590546 WDR62O43379 1518 aa34.89■■■■□ 3.18
USP36-218ENST00000590546 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.88■■■■□ 3.17
USP36-218ENST00000590546 ERCC6Q03468 1493 aa34.84■■■■□ 3.17
USP36-218ENST00000590546 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
USP36-218ENST00000590546 IFT140Q96RY7 1462 aa34.76■■■■□ 3.16
USP36-218ENST00000590546 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.75■■■■□ 3.15
USP36-218ENST00000590546 ARAP1Q96P48 1450 aa34.73■■■■□ 3.15
USP36-218ENST00000590546 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.72■■■■□ 3.15
USP36-218ENST00000590546 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.68■■■■□ 3.14
USP36-218ENST00000590546 APLP2Q06481 763 aa34.67■■■■□ 3.14
USP36-218ENST00000590546 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
USP36-218ENST00000590546 PBRM1Q86U86 1689 aa34.59■■■■□ 3.13
USP36-218ENST00000590546 HRCP23327 699 aa34.58■■■■□ 3.13
USP36-218ENST00000590546 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.57■■■■□ 3.13
USP36-218ENST00000590546 GRIN2BQ13224 1484 aa34.57■■■■□ 3.13
USP36-218ENST00000590546 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.55■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 235 ms