RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590546.6

USP36-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,771 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-218ENST00000590546 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.88■■■■■ 5.57
USP36-218ENST00000590546 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.36■■■■■ 4.53
USP36-218ENST00000590546 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
USP36-218ENST00000590546 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.32■■■■■ 4.21
USP36-218ENST00000590546 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.04■■■■■ 4.16
USP36-218ENST00000590546 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.81■■■■■ 4.12
USP36-218ENST00000590546 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.74■■■■■ 4.11
USP36-218ENST00000590546 ABCC9O60706 1549 aa40.6■■■■■ 4.09
USP36-218ENST00000590546 NACADO15069 1562 aa40.33■■■■■ 4.05
USP36-218ENST00000590546 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.88■■■■□ 3.97
USP36-218ENST00000590546 SCRIBQ14160 1630 aa39.82■■■■□ 3.96
USP36-218ENST00000590546 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.51■■■■□ 3.91
USP36-218ENST00000590546 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.96■■■■□ 3.83
USP36-218ENST00000590546 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.81■■■■□ 3.8
USP36-218ENST00000590546 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.66■■■■□ 3.78
USP36-218ENST00000590546 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.59■■■■□ 3.77
USP36-218ENST00000590546 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.52■■■■□ 3.76
USP36-218ENST00000590546 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.49■■■■□ 3.75
USP36-218ENST00000590546 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.35■■■■□ 3.73
USP36-218ENST00000590546 SMARCA4P51532 1647 aa38.25■■■■□ 3.71
USP36-218ENST00000590546 WIZO95785 1651 aa38.18■■■■□ 3.7
USP36-218ENST00000590546 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.04■■■■□ 3.68
USP36-218ENST00000590546 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.86■■■■□ 3.65
USP36-218ENST00000590546 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.82■■■■□ 3.64
USP36-218ENST00000590546 SMARCA2P51531 1590 aa37.6■■■■□ 3.61
USP36-218ENST00000590546 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.56■■■■□ 3.6
USP36-218ENST00000590546 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.47■■■■□ 3.59
USP36-218ENST00000590546 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.43■■■■□ 3.58
USP36-218ENST00000590546 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
USP36-218ENST00000590546 NCAPD3P42695 1498 aa37.22■■■■□ 3.55
USP36-218ENST00000590546 TRIM41Q8WV44 630 aa37.2■■■■□ 3.55
USP36-218ENST00000590546 HMGXB3Q12766 1538 aa37.19■■■■□ 3.54
USP36-218ENST00000590546 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.77■■■■□ 3.48
USP36-218ENST00000590546 ABCC8Q09428 1581 aa36.72■■■■□ 3.47
USP36-218ENST00000590546 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.56■■■■□ 3.44
USP36-218ENST00000590546 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.53■■■■□ 3.44
USP36-218ENST00000590546 CFTRP13569 1480 aa36.47■■■■□ 3.43
USP36-218ENST00000590546 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
USP36-218ENST00000590546 EEA1Q15075 1411 aa36.31■■■■□ 3.4
USP36-218ENST00000590546 SYNJ1O43426 1573 aa36.31■■■■□ 3.4
USP36-218ENST00000590546 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.28■■■■□ 3.4
USP36-218ENST00000590546 PRDM2Q13029 1718 aa36.27■■■■□ 3.4
USP36-218ENST00000590546 TOP2BQ02880 1626 aa36.2■■■■□ 3.39
USP36-218ENST00000590546 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.15■■■■□ 3.38
USP36-218ENST00000590546 SOGA1O94964 1423 aa36.14■■■■□ 3.38
USP36-218ENST00000590546 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.02■■■■□ 3.36
USP36-218ENST00000590546 CUX1P39880 1505 aa35.98■■■■□ 3.35
USP36-218ENST00000590546 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.94■■■■□ 3.34
USP36-218ENST00000590546 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.89■■■■□ 3.34
USP36-218ENST00000590546 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.85■■■■□ 3.33
USP36-218ENST00000590546 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.81■■■■□ 3.32
USP36-218ENST00000590546 GOLGA3Q08378 1498 aa35.75■■■■□ 3.31
USP36-218ENST00000590546 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.73■■■■□ 3.31
USP36-218ENST00000590546 KIF21BO75037 1637 aa35.73■■■■□ 3.31
USP36-218ENST00000590546 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.72■■■■□ 3.31
USP36-218ENST00000590546 NESP48681 1621 aa35.72■■■■□ 3.31
USP36-218ENST00000590546 KIF27Q86VH2 1401 aa35.64■■■■□ 3.3
USP36-218ENST00000590546 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.64■■■■□ 3.3
USP36-218ENST00000590546 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.61■■■■□ 3.29
USP36-218ENST00000590546 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.6■■■■□ 3.29
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USP36-218ENST00000590546 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.55■■■■□ 3.28
USP36-218ENST00000590546 CEP162Q5TB80 1403 aa35.5■■■■□ 3.27
USP36-218ENST00000590546 TOPBP1Q92547 1522 aa35.49■■■■□ 3.27
USP36-218ENST00000590546 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.46■■■■□ 3.27
USP36-218ENST00000590546 PRXQ9BXM0 1461 aa35.45■■■■□ 3.27
USP36-218ENST00000590546 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.41■■■■□ 3.26
USP36-218ENST00000590546 CUX2O14529 1486 aa35.4■■■■□ 3.26
USP36-218ENST00000590546 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
USP36-218ENST00000590546 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
USP36-218ENST00000590546 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.31■■■■□ 3.24
USP36-218ENST00000590546 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.29■■■■□ 3.24
USP36-218ENST00000590546 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
USP36-218ENST00000590546 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.26■■■■□ 3.24
USP36-218ENST00000590546 IGF1RP08069 1367 aa35.24■■■■□ 3.23
USP36-218ENST00000590546 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.19■■■■□ 3.22
USP36-218ENST00000590546 CLIP1P30622 1438 aa35.17■■■■□ 3.22
USP36-218ENST00000590546 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.11■■■■□ 3.21
USP36-218ENST00000590546 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.1■■■■□ 3.21
USP36-218ENST00000590546 WDR97A6NE52 1622 aa35.07■■■■□ 3.21
USP36-218ENST00000590546 CUL7Q14999 1698 aa34.97■■■■□ 3.19
USP36-218ENST00000590546 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.93■■■■□ 3.18
USP36-218ENST00000590546 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.92■■■■□ 3.18
USP36-218ENST00000590546 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
USP36-218ENST00000590546 WDR62O43379 1518 aa34.89■■■■□ 3.18
USP36-218ENST00000590546 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.88■■■■□ 3.17
USP36-218ENST00000590546 ERCC6Q03468 1493 aa34.84■■■■□ 3.17
USP36-218ENST00000590546 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
USP36-218ENST00000590546 IFT140Q96RY7 1462 aa34.76■■■■□ 3.16
USP36-218ENST00000590546 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.75■■■■□ 3.15
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USP36-218ENST00000590546 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.72■■■■□ 3.15
USP36-218ENST00000590546 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.68■■■■□ 3.14
USP36-218ENST00000590546 APLP2Q06481 763 aa34.67■■■■□ 3.14
USP36-218ENST00000590546 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
USP36-218ENST00000590546 PBRM1Q86U86 1689 aa34.59■■■■□ 3.13
USP36-218ENST00000590546 HRCP23327 699 aa34.58■■■■□ 3.13
USP36-218ENST00000590546 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.57■■■■□ 3.13
USP36-218ENST00000590546 GRIN2BQ13224 1484 aa34.57■■■■□ 3.13
USP36-218ENST00000590546 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.55■■■■□ 3.12
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