RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542720.1

LATS1-205, Transcript of large tumor suppressor kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LATS1, Length 1,096 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATS1-205ENST00000542720 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.51■■■■■ 4.39
LATS1-205ENST00000542720 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.62■■■■□ 3.61
LATS1-205ENST00000542720 ABCC9O60706 1549 aa37.58■■■■□ 3.61
LATS1-205ENST00000542720 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.12■■■■□ 3.37
LATS1-205ENST00000542720 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.6■■■■□ 3.29
LATS1-205ENST00000542720 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
LATS1-205ENST00000542720 NACADO15069 1562 aa35.37■■■■□ 3.25
LATS1-205ENST00000542720 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.37■■■■□ 3.25
LATS1-205ENST00000542720 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.16■■■■□ 3.22
LATS1-205ENST00000542720 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.1■■■■□ 3.21
LATS1-205ENST00000542720 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.94■■■■□ 3.18
LATS1-205ENST00000542720 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.61■■■■□ 3.13
LATS1-205ENST00000542720 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.46■■■■□ 3.11
LATS1-205ENST00000542720 SCRIBQ14160 1630 aa34.45■■■■□ 3.11
LATS1-205ENST00000542720 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.94■■■■□ 3.02
LATS1-205ENST00000542720 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.87■■■■□ 3.01
LATS1-205ENST00000542720 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.86■■■■□ 3.01
LATS1-205ENST00000542720 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.67■■■□□ 2.98
LATS1-205ENST00000542720 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.63■■■□□ 2.97
LATS1-205ENST00000542720 SMARCA4P51532 1647 aa32.93■■■□□ 2.86
LATS1-205ENST00000542720 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.88■■■□□ 2.85
LATS1-205ENST00000542720 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.81■■■□□ 2.84
LATS1-205ENST00000542720 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.74■■■□□ 2.83
LATS1-205ENST00000542720 CUX2O14529 1486 aa32.68■■■□□ 2.82
LATS1-205ENST00000542720 NCAPD3P42695 1498 aa32.67■■■□□ 2.82
LATS1-205ENST00000542720 SMARCA2P51531 1590 aa32.64■■■□□ 2.82
LATS1-205ENST00000542720 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.56■■■□□ 2.8
LATS1-205ENST00000542720 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.49■■■□□ 2.79
LATS1-205ENST00000542720 HMGXB3Q12766 1538 aa32.47■■■□□ 2.79
LATS1-205ENST00000542720 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
LATS1-205ENST00000542720 WIZO95785 1651 aa32.46■■■□□ 2.79
LATS1-205ENST00000542720 ERCC6Q03468 1493 aa32.43■■■□□ 2.78
LATS1-205ENST00000542720 NESP48681 1621 aa32.09■■■□□ 2.73
LATS1-205ENST00000542720 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
LATS1-205ENST00000542720 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
LATS1-205ENST00000542720 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
LATS1-205ENST00000542720 TRIM41Q8WV44 630 aa31.76■■■□□ 2.67
LATS1-205ENST00000542720 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.76■■■□□ 2.67
LATS1-205ENST00000542720 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.76■■■□□ 2.67
LATS1-205ENST00000542720 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.74■■■□□ 2.67
LATS1-205ENST00000542720 CFTRP13569 1480 aa31.58■■■□□ 2.65
LATS1-205ENST00000542720 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.57■■■□□ 2.64
LATS1-205ENST00000542720 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.51■■■□□ 2.63
LATS1-205ENST00000542720 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.39■■■□□ 2.62
LATS1-205ENST00000542720 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.32■■■□□ 2.6
LATS1-205ENST00000542720 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.3■■■□□ 2.6
LATS1-205ENST00000542720 PRDM2Q13029 1718 aa31.27■■■□□ 2.6
LATS1-205ENST00000542720 WDR62O43379 1518 aa31.27■■■□□ 2.6
LATS1-205ENST00000542720 OSCARQ8IYS5 282 aa31.14■■■□□ 2.58
LATS1-205ENST00000542720 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
LATS1-205ENST00000542720 TOPBP1Q92547 1522 aa30.91■■■□□ 2.54
LATS1-205ENST00000542720 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.84■■■□□ 2.53
LATS1-205ENST00000542720 ABCC8Q09428 1581 aa30.83■■■□□ 2.53
LATS1-205ENST00000542720 CUX1P39880 1505 aa30.75■■■□□ 2.51
LATS1-205ENST00000542720 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.71■■■□□ 2.51
LATS1-205ENST00000542720 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.71■■■□□ 2.51
LATS1-205ENST00000542720 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.71■■■□□ 2.51
LATS1-205ENST00000542720 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
LATS1-205ENST00000542720 IFT140Q96RY7 1462 aa30.63■■■□□ 2.49
LATS1-205ENST00000542720 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.62■■■□□ 2.49
LATS1-205ENST00000542720 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.59■■■□□ 2.49
LATS1-205ENST00000542720 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.58■■■□□ 2.49
LATS1-205ENST00000542720 ARHGEF11O15085 1522 aa30.57■■■□□ 2.49
LATS1-205ENST00000542720 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
LATS1-205ENST00000542720 SOGA1O94964 1423 aa30.56■■■□□ 2.48
LATS1-205ENST00000542720 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
LATS1-205ENST00000542720 SYNJ1O43426 1573 aa30.53■■■□□ 2.48
LATS1-205ENST00000542720 TOP2BQ02880 1626 aa30.48■■■□□ 2.47
LATS1-205ENST00000542720 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.47■■■□□ 2.47
LATS1-205ENST00000542720 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.46■■■□□ 2.47
LATS1-205ENST00000542720 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.43■■■□□ 2.467e-7■■■■■ 32.5
LATS1-205ENST00000542720 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
LATS1-205ENST00000542720 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
LATS1-205ENST00000542720 WDR97A6NE52 1622 aa30.3■■■□□ 2.44
LATS1-205ENST00000542720 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
LATS1-205ENST00000542720 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.29■■■□□ 2.44
LATS1-205ENST00000542720 ARAP1Q96P48 1450 aa30.25■■■□□ 2.43
LATS1-205ENST00000542720 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.18■■■□□ 2.42
LATS1-205ENST00000542720 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.14■■■□□ 2.42
LATS1-205ENST00000542720 GRIN2BQ13224 1484 aa30.13■■■□□ 2.41
LATS1-205ENST00000542720 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.1■■■□□ 2.41
LATS1-205ENST00000542720 FBLN2P98095 1184 aa30.08■■■□□ 2.41
LATS1-205ENST00000542720 CHD1O14646 1710 aa30.08■■■□□ 2.41
LATS1-205ENST00000542720 PBRM1Q86U86 1689 aa30.07■■■□□ 2.4
LATS1-205ENST00000542720 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
LATS1-205ENST00000542720 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
LATS1-205ENST00000542720 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
LATS1-205ENST00000542720 KIF27Q86VH2 1401 aa29.93■■■□□ 2.38
LATS1-205ENST00000542720 SYNJ2O15056 1496 aa29.91■■■□□ 2.38
LATS1-205ENST00000542720 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.9■■■□□ 2.38
LATS1-205ENST00000542720 IGF1RP08069 1367 aa29.85■■■□□ 2.37
LATS1-205ENST00000542720 ADAMTS12P58397 1594 aa29.85■■■□□ 2.37
LATS1-205ENST00000542720 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.84■■■□□ 2.37
LATS1-205ENST00000542720 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.84■■■□□ 2.37
LATS1-205ENST00000542720 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.83■■■□□ 2.37
LATS1-205ENST00000542720 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.82■■■□□ 2.36
LATS1-205ENST00000542720 GRIN2AQ12879 1464 aa29.75■■■□□ 2.35
LATS1-205ENST00000542720 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.66■■■□□ 2.34
LATS1-205ENST00000542720 CUL7Q14999 1698 aa29.64■■■□□ 2.34
LATS1-205ENST00000542720 CEP170Q5SW79 1584 aa29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms