Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.632e-8■■■■□ 20.8
ILF3Q12906 NEDD4L-218ENST00000587547 889 ntTSL 1 (best)8.23□□□□□ -1.094e-6■■■■□ 20.8
ILF3Q12906 AFF4-209ENST00000491831 1667 ntTSL 1 (best)16.64■□□□□ 0.253e-6■■■■□ 20.8
ILF3Q12906 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.023e-6■■■■□ 20.8
ILF3Q12906 AFF4-203ENST00000378595 3348 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.653e-6■■■■□ 20.8
ILF3Q12906 SMYD3-216ENST00000492487 634 ntTSL 38.21□□□□□ -1.13e-7■■■■□ 20.8
ILF3Q12906 AFF4-206ENST00000465484 1729 ntTSL 1 (best)16.53■□□□□ 0.242e-6■■■■□ 20.8
ILF3Q12906 CCNY-209ENST00000493157 816 ntTSL 516.93■□□□□ 0.32e-9■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.14e-8■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CCNY-207ENST00000490012 793 ntTSL 315.47■□□□□ 0.072e-9■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.074e-8■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.414e-8■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CCNY-204ENST00000374706 3940 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.854e-8■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CCNY-208ENST00000492478 809 ntTSL 58.78□□□□□ -14e-8■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 RAB30-AS1-203ENST00000527627 504 ntTSL 312.01□□□□□ -0.492e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 RAB30-AS1-206ENST00000533528 340 ntTSL 510.18□□□□□ -0.782e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 FTX-218ENST00000641360 3897 nt4.95□□□□□ -1.621e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.75e-7■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.48e-8■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 QPRT-204ENST00000564967 2199 nt12.24□□□□□ -0.455e-7■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 SOGA1-202ENST00000279034 3703 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.768e-8■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 SUMO2-201ENST00000314523 809 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.875e-7■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 SUMO2-202ENST00000420826 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.045e-7■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 FBXW11-207ENST00000519693 758 ntTSL 225.82■■□□□ 1.722e-10■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 FBXW11-208ENST00000520376 686 ntTSL 224.07■■□□□ 1.442e-10■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CAPRIN1-205ENST00000528856 595 ntTSL 523.25■■□□□ 1.313e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 FBXW11-204ENST00000517395 636 ntTSL 321.23■□□□□ 0.992e-10■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 ZNF26-203ENST00000537956 733 ntTSL 321.02■□□□□ 0.963e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 FBXW11-210ENST00000522507 306 ntTSL 320.83■□□□□ 0.932e-10■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 FBXW11-212ENST00000523843 2099 ntTSL 520.35■□□□□ 0.852e-10■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.812e-10■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.71e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.343e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.322e-10■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 ZNF26-206ENST00000545101 590 ntTSL 417.02■□□□□ 0.323e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 IQSEC2-208ENST00000638630 861 ntTSL 1 (best)16.91■□□□□ 0.33e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.193e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.133e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.081e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 UBE2B-207ENST00000510021 415 ntTSL 215.27■□□□□ 0.041e-6■■■■□ 20.7
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ILF3Q12906 ZNF26-205ENST00000544181 834 ntTSL 314.99□□□□□ -0.013e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.023e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 SLCO2B1-207ENST00000526660 582 ntTSL 314.65□□□□□ -0.063e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.093e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 TRAPPC8-207ENST00000580104 5014 ntTSL 212.87□□□□□ -0.353e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.373e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.383e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.383e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 IQSEC2-212ENST00000639543 588 ntTSL 312.64□□□□□ -0.393e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.423e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.443e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 IQSEC2-203ENST00000462054 730 ntTSL 312.05□□□□□ -0.483e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.582e-10■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CAPRIN1-202ENST00000389645 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.613e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 UBE2B-208ENST00000511807 818 ntTSL 311.14□□□□□ -0.631e-6■■■■□ 20.7
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ILF3Q12906 TRAPPC8-211ENST00000582539 4391 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.833e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CAPRIN1-201ENST00000341394 4108 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.853e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CDYL-208ENST00000483019 773 ntTSL 29.65□□□□□ -0.863e-6■■■■□ 20.7
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ILF3Q12906 ANK3-205ENST00000373827 7202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.983e-6■■■■□ 20.7
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ILF3Q12906 CAPRIN1-209ENST00000530820 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.023e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 LINC01572-202ENST00000563770 568 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.053e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CAPRIN1-206ENST00000528948 585 ntTSL 28.49□□□□□ -1.053e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 LINC01572-201ENST00000561611 2194 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.073e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 LINC01572-203ENST00000563823 563 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.143e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 LINC01572-204ENST00000570035 831 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.233e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CDYL-209ENST00000491864 614 ntTSL 56.54□□□□□ -1.363e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 POLG2-207ENST00000581355 652 ntTSL 36.41□□□□□ -1.381e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 POLG2-202ENST00000577506 472 ntTSL 56.41□□□□□ -1.381e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 TRAPPC8-208ENST00000581057 623 ntTSL 26.33□□□□□ -1.43e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 IQSEC2-211ENST00000639485 475 ntTSL 56.17□□□□□ -1.423e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.443e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.443e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 ANK3-232ENST00000622427 5071 ntTSL 25.87□□□□□ -1.473e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.543e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.543e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 MPHOSPH9-223ENST00000606704 553 ntTSL 55.04□□□□□ -1.63e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CHD9-212ENST00000564641 589 ntTSL 44.46□□□□□ -1.73e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 MPHOSPH9-213ENST00000541603 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)4.29□□□□□ -1.723e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CHD9-201ENST00000219084 8739 ntTSL 1 (best)4.27□□□□□ -1.733e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.773e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 ANK3-211ENST00000474360 761 ntTSL 53.48□□□□□ -1.853e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.886e-9■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CHD9-211ENST00000564600 539 ntTSL 43.15□□□□□ -1.913e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.954e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.976e-9■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 FBXW11-206ENST00000518752 310 ntTSL 52.57□□□□□ -22e-10■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 RMND1-203ENST00000444024 743 ntTSL 314.91□□□□□ -0.023e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.043e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.083e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 RMND1-201ENST00000336451 1413 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.93e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 VGLL4-206ENST00000418000 792 ntTSL 325.03■■□□□ 1.64e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 EFHC1-204ENST00000491749 496 ntTSL 424.69■■□□□ 1.544e-6■■■■□ 20.7
ILF3Q12906 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.354e-6■■■■□ 20.7
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