RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506787.5

UBE2B-205, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 500 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-205ENST00000506787 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
UBE2B-205ENST00000506787 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.6■■■□□ 2.97
UBE2B-205ENST00000506787 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
UBE2B-205ENST00000506787 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
UBE2B-205ENST00000506787 FOXD1Q16676 465 aa28.6■■■□□ 2.17
UBE2B-205ENST00000506787 POTEDQ86YR6 584 aa27.09■■□□□ 1.93
UBE2B-205ENST00000506787 MSH5O43196 834 aa27.03■■□□□ 1.92
UBE2B-205ENST00000506787 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.68■■□□□ 1.86
UBE2B-205ENST00000506787 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
UBE2B-205ENST00000506787 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.35■■□□□ 1.81
UBE2B-205ENST00000506787 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.35■■□□□ 1.81
UBE2B-205ENST00000506787 ADRA2BP18089 450 aa26.25■■□□□ 1.79
UBE2B-205ENST00000506787 ABCC9O60706 1549 aa24.79■■□□□ 1.56
UBE2B-205ENST00000506787 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.25■■□□□ 1.47
UBE2B-205ENST00000506787 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
UBE2B-205ENST00000506787 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
UBE2B-205ENST00000506787 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.05■■□□□ 1.44
UBE2B-205ENST00000506787 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.95■■□□□ 1.42
UBE2B-205ENST00000506787 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
UBE2B-205ENST00000506787 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.28■■□□□ 1.32
UBE2B-205ENST00000506787 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.25■■□□□ 1.31
UBE2B-205ENST00000506787 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.19■■□□□ 1.3
UBE2B-205ENST00000506787 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
UBE2B-205ENST00000506787 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2B-205ENST00000506787 RNF39Q9H2S5 420 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2B-205ENST00000506787 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
UBE2B-205ENST00000506787 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
UBE2B-205ENST00000506787 NACADO15069 1562 aa22.84■■□□□ 1.25
UBE2B-205ENST00000506787 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.69■■□□□ 1.22
UBE2B-205ENST00000506787 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
UBE2B-205ENST00000506787 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.62■■□□□ 1.21
UBE2B-205ENST00000506787 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2B-205ENST00000506787 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22.55■■□□□ 1.2
UBE2B-205ENST00000506787 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.41■■□□□ 1.18
UBE2B-205ENST00000506787 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.35■■□□□ 1.17
UBE2B-205ENST00000506787 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
UBE2B-205ENST00000506787 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.28■■□□□ 1.16
UBE2B-205ENST00000506787 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2B-205ENST00000506787 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
UBE2B-205ENST00000506787 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
UBE2B-205ENST00000506787 NPM3O75607 178 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
UBE2B-205ENST00000506787 SCRIBQ14160 1630 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2B-205ENST00000506787 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.7■■□□□ 1.07
UBE2B-205ENST00000506787 CUX2O14529 1486 aa21.67■■□□□ 1.06
UBE2B-205ENST00000506787 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
UBE2B-205ENST00000506787 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
UBE2B-205ENST00000506787 ERCC6Q03468 1493 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2B-205ENST00000506787 CAPN15O75808 1086 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2B-205ENST00000506787 DSG3P32926 999 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2B-205ENST00000506787 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
UBE2B-205ENST00000506787 TRIM41Q8WV44 630 aa21.26■□□□□ 0.99
UBE2B-205ENST00000506787 POTEHQ6S545 545 aa21.15■□□□□ 0.98
UBE2B-205ENST00000506787 NCAPD3P42695 1498 aa21.13■□□□□ 0.97
UBE2B-205ENST00000506787 NESP48681 1621 aa21.09■□□□□ 0.97
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UBE2B-205ENST00000506787 SLC4A2P04920 1241 aa21.04■□□□□ 0.96
UBE2B-205ENST00000506787 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.95
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UBE2B-205ENST00000506787 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
UBE2B-205ENST00000506787 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
UBE2B-205ENST00000506787 HMGXB3Q12766 1538 aa20.88■□□□□ 0.93
UBE2B-205ENST00000506787 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
UBE2B-205ENST00000506787 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
UBE2B-205ENST00000506787 SMARCA2P51531 1590 aa20.82■□□□□ 0.92
UBE2B-205ENST00000506787 ABCB7O75027 752 aa20.79■□□□□ 0.92
UBE2B-205ENST00000506787 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.76■□□□□ 0.91
UBE2B-205ENST00000506787 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.74■□□□□ 0.91
UBE2B-205ENST00000506787 SMARCA4P51532 1647 aa20.71■□□□□ 0.91
UBE2B-205ENST00000506787 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
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UBE2B-205ENST00000506787 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.67■□□□□ 0.9
UBE2B-205ENST00000506787 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
UBE2B-205ENST00000506787 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.55■□□□□ 0.88
UBE2B-205ENST00000506787 OSCARQ8IYS5 282 aa20.54■□□□□ 0.88
UBE2B-205ENST00000506787 WDR62O43379 1518 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2B-205ENST00000506787 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.53■□□□□ 0.88
UBE2B-205ENST00000506787 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-205ENST00000506787 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
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UBE2B-205ENST00000506787 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2B-205ENST00000506787 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2B-205ENST00000506787 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
UBE2B-205ENST00000506787 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2B-205ENST00000506787 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-205ENST00000506787 POLA2Q14181 598 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2B-205ENST00000506787 ARHGEF11O15085 1522 aa20.24■□□□□ 0.83
UBE2B-205ENST00000506787 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2B-205ENST00000506787 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2B-205ENST00000506787 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.14■□□□□ 0.81
UBE2B-205ENST00000506787 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
UBE2B-205ENST00000506787 CFTRP13569 1480 aa20.05■□□□□ 0.8
UBE2B-205ENST00000506787 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
UBE2B-205ENST00000506787 WIZO95785 1651 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-205ENST00000506787 ARAP1Q96P48 1450 aa20.01■□□□□ 0.79
UBE2B-205ENST00000506787 IFT140Q96RY7 1462 aa19.92■□□□□ 0.78
UBE2B-205ENST00000506787 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
UBE2B-205ENST00000506787 AKT1S1Q96B36 256 aa19.86■□□□□ 0.77
UBE2B-205ENST00000506787 FOXD4L1Q9NU39 408 aa19.86■□□□□ 0.77
UBE2B-205ENST00000506787 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
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