RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510021.5

UBE2B-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 415 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-207ENST00000510021 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.47■■■■■ 4.07
UBE2B-207ENST00000510021 ABCC9O60706 1549 aa38.44■■■■□ 3.74
UBE2B-207ENST00000510021 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.43■■■■□ 3.58
UBE2B-207ENST00000510021 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37■■■■□ 3.51
UBE2B-207ENST00000510021 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.93■■■■□ 3.34
UBE2B-207ENST00000510021 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.5■■■■□ 3.27
UBE2B-207ENST00000510021 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.46■■■■□ 3.27
UBE2B-207ENST00000510021 NACADO15069 1562 aa35.31■■■■□ 3.24
UBE2B-207ENST00000510021 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.16■■■■□ 3.22
UBE2B-207ENST00000510021 BICRAQ9NZM4 1560 aa35■■■■□ 3.19
UBE2B-207ENST00000510021 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.79■■■■□ 3.16
UBE2B-207ENST00000510021 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.66■■■■□ 3.14
UBE2B-207ENST00000510021 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.66■■■■□ 3.14
UBE2B-207ENST00000510021 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.35■■■■□ 3.09
UBE2B-207ENST00000510021 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.35■■■■□ 3.09
UBE2B-207ENST00000510021 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
UBE2B-207ENST00000510021 CUX2O14529 1486 aa33.77■■■■□ 3
UBE2B-207ENST00000510021 SCRIBQ14160 1630 aa33.58■■■□□ 2.97
UBE2B-207ENST00000510021 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.35■■■□□ 2.93
UBE2B-207ENST00000510021 ERCC6Q03468 1493 aa33.26■■■□□ 2.92
UBE2B-207ENST00000510021 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.24■■■□□ 2.91
UBE2B-207ENST00000510021 TRIM41Q8WV44 630 aa33.22■■■□□ 2.91
UBE2B-207ENST00000510021 NCAPD3P42695 1498 aa32.63■■■□□ 2.81
UBE2B-207ENST00000510021 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.62■■■□□ 2.81
UBE2B-207ENST00000510021 NESP48681 1621 aa32.61■■■□□ 2.81
UBE2B-207ENST00000510021 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.31■■■□□ 2.76
UBE2B-207ENST00000510021 SMARCA2P51531 1590 aa32.27■■■□□ 2.76
UBE2B-207ENST00000510021 HMGXB3Q12766 1538 aa32.26■■■□□ 2.76
UBE2B-207ENST00000510021 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.15■■■□□ 2.74
UBE2B-207ENST00000510021 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.13■■■□□ 2.73
UBE2B-207ENST00000510021 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
UBE2B-207ENST00000510021 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.96■■■□□ 2.71
UBE2B-207ENST00000510021 SMARCA4P51532 1647 aa31.91■■■□□ 2.7
UBE2B-207ENST00000510021 OSCARQ8IYS5 282 aa31.9■■■□□ 2.7
UBE2B-207ENST00000510021 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
UBE2B-207ENST00000510021 WDR62O43379 1518 aa31.81■■■□□ 2.68
UBE2B-207ENST00000510021 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.81■■■□□ 2.68
UBE2B-207ENST00000510021 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.75■■■□□ 2.67
UBE2B-207ENST00000510021 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.75■■■□□ 2.67
UBE2B-207ENST00000510021 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.75■■■□□ 2.67
UBE2B-207ENST00000510021 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.63■■■□□ 2.65
UBE2B-207ENST00000510021 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
UBE2B-207ENST00000510021 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.54■■■□□ 2.64
UBE2B-207ENST00000510021 ARHGEF11O15085 1522 aa31.49■■■□□ 2.63
UBE2B-207ENST00000510021 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
UBE2B-207ENST00000510021 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.36■■■□□ 2.61
UBE2B-207ENST00000510021 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.26■■■□□ 2.59
UBE2B-207ENST00000510021 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.2■■■□□ 2.58
UBE2B-207ENST00000510021 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.17■■■□□ 2.58
UBE2B-207ENST00000510021 ARAP1Q96P48 1450 aa31.08■■■□□ 2.57
UBE2B-207ENST00000510021 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
UBE2B-207ENST00000510021 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
UBE2B-207ENST00000510021 CFTRP13569 1480 aa30.89■■■□□ 2.53
UBE2B-207ENST00000510021 IFT140Q96RY7 1462 aa30.8■■■□□ 2.52
UBE2B-207ENST00000510021 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
UBE2B-207ENST00000510021 CHD1O14646 1710 aa30.74■■■□□ 2.51
UBE2B-207ENST00000510021 WIZO95785 1651 aa30.71■■■□□ 2.51
UBE2B-207ENST00000510021 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
UBE2B-207ENST00000510021 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
UBE2B-207ENST00000510021 PRDM2Q13029 1718 aa30.47■■■□□ 2.47
UBE2B-207ENST00000510021 TOPBP1Q92547 1522 aa30.45■■■□□ 2.47
UBE2B-207ENST00000510021 FBLN2P98095 1184 aa30.44■■■□□ 2.46
UBE2B-207ENST00000510021 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.42■■■□□ 2.461e-7■■■□□ 17.1
UBE2B-207ENST00000510021 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.37■■■□□ 2.45
UBE2B-207ENST00000510021 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
UBE2B-207ENST00000510021 ABCC8Q09428 1581 aa30.24■■■□□ 2.43
UBE2B-207ENST00000510021 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
UBE2B-207ENST00000510021 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.2■■■□□ 2.43
UBE2B-207ENST00000510021 SYNJ1O43426 1573 aa30.16■■■□□ 2.42
UBE2B-207ENST00000510021 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.13■■■□□ 2.41
UBE2B-207ENST00000510021 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.07■■■□□ 2.4
UBE2B-207ENST00000510021 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
UBE2B-207ENST00000510021 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
UBE2B-207ENST00000510021 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
UBE2B-207ENST00000510021 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.94■■■□□ 2.38
UBE2B-207ENST00000510021 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
UBE2B-207ENST00000510021 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.92■■■□□ 2.38
UBE2B-207ENST00000510021 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.91■■■□□ 2.38
UBE2B-207ENST00000510021 WDR97A6NE52 1622 aa29.89■■■□□ 2.37
UBE2B-207ENST00000510021 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.87■■■□□ 2.37
UBE2B-207ENST00000510021 SYNJ2O15056 1496 aa29.87■■■□□ 2.37
UBE2B-207ENST00000510021 SOGA1O94964 1423 aa29.83■■■□□ 2.37
UBE2B-207ENST00000510021 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.78■■■□□ 2.36
UBE2B-207ENST00000510021 GRIN2BQ13224 1484 aa29.77■■■□□ 2.36
UBE2B-207ENST00000510021 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.62■■■□□ 2.33
UBE2B-207ENST00000510021 PBRM1Q86U86 1689 aa29.57■■■□□ 2.32
UBE2B-207ENST00000510021 CEP170Q5SW79 1584 aa29.57■■■□□ 2.32
UBE2B-207ENST00000510021 KDM6BO15054 1643 aa29.53■■■□□ 2.32
UBE2B-207ENST00000510021 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.51■■■□□ 2.31
UBE2B-207ENST00000510021 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.49■■■□□ 2.31
UBE2B-207ENST00000510021 SHROOM2Q13796 1616 aa29.45■■■□□ 2.3
UBE2B-207ENST00000510021 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.43■■■□□ 2.3
UBE2B-207ENST00000510021 DIP2BQ9P265 1576 aa29.42■■■□□ 2.3
UBE2B-207ENST00000510021 GRIN2AQ12879 1464 aa29.4■■■□□ 2.3
UBE2B-207ENST00000510021 NUP160Q12769 1436 aa29.38■■■□□ 2.29
UBE2B-207ENST00000510021 CUX1P39880 1505 aa29.37■■■□□ 2.29
UBE2B-207ENST00000510021 MAPKBP1O60336 1514 aa29.35■■■□□ 2.29
UBE2B-207ENST00000510021 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.33■■■□□ 2.29
UBE2B-207ENST00000510021 ADGRL1O94910 1474 aa29.32■■■□□ 2.28
UBE2B-207ENST00000510021 FBXO41Q8TF61 875 aa29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms