Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCP1P17987 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCP1P17987 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TCP1P17987 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCP1P17987 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCP1P17987 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCP1P17987 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCP1P17987 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCP1P17987 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCP1P17987 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCP1P17987 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCP1P17987 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCP1P17987 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCP1P17987 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCP1P17987 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TCP1P17987 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCP1P17987 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCP1P17987 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCP1P17987 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TCP1P17987 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCP1P17987 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCP1P17987 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCP1P17987 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCP1P17987 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCP1P17987 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCP1P17987 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCP1P17987 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCP1P17987 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCP1P17987 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TCP1P17987 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCP1P17987 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCP1P17987 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TCP1P17987 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TCP1P17987 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCP1P17987 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCP1P17987 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCP1P17987 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCP1P17987 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCP1P17987 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCP1P17987 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCP1P17987 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCP1P17987 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCP1P17987 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCP1P17987 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCP1P17987 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCP1P17987 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCP1P17987 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCP1P17987 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCP1P17987 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCP1P17987 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCP1P17987 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCP1P17987 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TCP1P17987 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCP1P17987 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCP1P17987 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCP1P17987 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCP1P17987 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCP1P17987 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCP1P17987 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCP1P17987 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCP1P17987 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCP1P17987 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TCP1P17987 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCP1P17987 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCP1P17987 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCP1P17987 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCP1P17987 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCP1P17987 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCP1P17987 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCP1P17987 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCP1P17987 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCP1P17987 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TCP1P17987 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TCP1P17987 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCP1P17987 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCP1P17987 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCP1P17987 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TCP1P17987 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCP1P17987 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCP1P17987 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCP1P17987 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCP1P17987 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCP1P17987 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCP1P17987 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCP1P17987 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCP1P17987 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCP1P17987 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCP1P17987 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCP1P17987 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCP1P17987 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCP1P17987 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TCP1P17987 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCP1P17987 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCP1P17987 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCP1P17987 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCP1P17987 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCP1P17987 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCP1P17987 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCP1P17987 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TCP1P17987 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms