RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395678.7

TYMP-202, Transcript of thymidine phosphorylase, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TYMP, Length 1,614 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMP-202ENST00000395678 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.02■■■■■ 5.76
TYMP-202ENST00000395678 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.37■■■■■ 4.85
TYMP-202ENST00000395678 ABCC9O60706 1549 aa44.17■■■■■ 4.66
TYMP-202ENST00000395678 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.59■■■■■ 4.41
TYMP-202ENST00000395678 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.51■■■■■ 4.4
TYMP-202ENST00000395678 NACADO15069 1562 aa42.48■■■■■ 4.39
TYMP-202ENST00000395678 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.42■■■■■ 4.38
TYMP-202ENST00000395678 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.23■■■■■ 4.35
TYMP-202ENST00000395678 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.16■■■■■ 4.34
TYMP-202ENST00000395678 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.88■■■■■ 4.3
TYMP-202ENST00000395678 SCRIBQ14160 1630 aa41.47■■■■■ 4.23
TYMP-202ENST00000395678 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.36■■■■■ 4.21
TYMP-202ENST00000395678 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.22■■■■■ 4.19
TYMP-202ENST00000395678 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.69■■■■■ 4.1
TYMP-202ENST00000395678 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.33■■■■■ 4.05
TYMP-202ENST00000395678 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.02
TYMP-202ENST00000395678 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.01■■■■■ 4
TYMP-202ENST00000395678 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.8■■■■□ 3.96
TYMP-202ENST00000395678 SMARCA4P51532 1647 aa39.64■■■■□ 3.94
TYMP-202ENST00000395678 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.51■■■■□ 3.92
TYMP-202ENST00000395678 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.4■■■■□ 3.9
TYMP-202ENST00000395678 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.26■■■■□ 3.88
TYMP-202ENST00000395678 SMARCA2P51531 1590 aa39.22■■■■□ 3.87
TYMP-202ENST00000395678 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.18■■■■□ 3.86
TYMP-202ENST00000395678 NCAPD3P42695 1498 aa39.15■■■■□ 3.86
TYMP-202ENST00000395678 WIZO95785 1651 aa39.07■■■■□ 3.85
TYMP-202ENST00000395678 HMGXB3Q12766 1538 aa39.07■■■■□ 3.85
TYMP-202ENST00000395678 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.96■■■■□ 3.83
TYMP-202ENST00000395678 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.92■■■■□ 3.82
TYMP-202ENST00000395678 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.55■■■■□ 3.76
TYMP-202ENST00000395678 NESP48681 1621 aa38.33■■■■□ 3.73
TYMP-202ENST00000395678 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.17■■■■□ 3.7
TYMP-202ENST00000395678 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.06■■■■□ 3.68
TYMP-202ENST00000395678 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.04■■■■□ 3.68
TYMP-202ENST00000395678 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.01■■■■□ 3.68
TYMP-202ENST00000395678 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.99■■■■□ 3.67
TYMP-202ENST00000395678 ERCC6Q03468 1493 aa37.97■■■■□ 3.67
TYMP-202ENST00000395678 PRDM2Q13029 1718 aa37.88■■■■□ 3.65
TYMP-202ENST00000395678 CFTRP13569 1480 aa37.87■■■■□ 3.65
TYMP-202ENST00000395678 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.77■■■■□ 3.64
TYMP-202ENST00000395678 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.76■■■■□ 3.64
TYMP-202ENST00000395678 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.65■■■■□ 3.62
TYMP-202ENST00000395678 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.58■■■■□ 3.61
TYMP-202ENST00000395678 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.49■■■■□ 3.59
TYMP-202ENST00000395678 CUX2O14529 1486 aa37.46■■■■□ 3.59
TYMP-202ENST00000395678 WDR62O43379 1518 aa37.41■■■■□ 3.58
TYMP-202ENST00000395678 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
TYMP-202ENST00000395678 TOPBP1Q92547 1522 aa37.11■■■■□ 3.53
TYMP-202ENST00000395678 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.09■■■■□ 3.53
TYMP-202ENST00000395678 CUX1P39880 1505 aa36.95■■■■□ 3.51
TYMP-202ENST00000395678 ABCC8Q09428 1581 aa36.95■■■■□ 3.51
TYMP-202ENST00000395678 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.81■■■■□ 3.48
TYMP-202ENST00000395678 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
TYMP-202ENST00000395678 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.76■■■■□ 3.48
TYMP-202ENST00000395678 SYNJ1O43426 1573 aa36.75■■■■□ 3.47
TYMP-202ENST00000395678 IFT140Q96RY7 1462 aa36.73■■■■□ 3.47
TYMP-202ENST00000395678 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.73■■■■□ 3.47
TYMP-202ENST00000395678 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
TYMP-202ENST00000395678 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.67■■■■□ 3.46
TYMP-202ENST00000395678 TOP2BQ02880 1626 aa36.67■■■■□ 3.46
TYMP-202ENST00000395678 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.66■■■■□ 3.46
TYMP-202ENST00000395678 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
TYMP-202ENST00000395678 WDR97A6NE52 1622 aa36.62■■■■□ 3.45
TYMP-202ENST00000395678 SOGA1O94964 1423 aa36.55■■■■□ 3.44
TYMP-202ENST00000395678 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.44■■■■□ 3.421e-6■■□□□ 14.5
TYMP-202ENST00000395678 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
TYMP-202ENST00000395678 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.36■■■■□ 3.41
TYMP-202ENST00000395678 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.33■■■■□ 3.41
TYMP-202ENST00000395678 PBRM1Q86U86 1689 aa36.32■■■■□ 3.41
TYMP-202ENST00000395678 CHD1O14646 1710 aa36.21■■■■□ 3.39
TYMP-202ENST00000395678 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.18■■■■□ 3.38
TYMP-202ENST00000395678 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.14■■■■□ 3.38
TYMP-202ENST00000395678 GRIN2BQ13224 1484 aa36.12■■■■□ 3.37
TYMP-202ENST00000395678 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
TYMP-202ENST00000395678 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.01■■■■□ 3.36
TYMP-202ENST00000395678 ADAMTS12P58397 1594 aa35.95■■■■□ 3.35
TYMP-202ENST00000395678 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.92■■■■□ 3.34
TYMP-202ENST00000395678 SYNJ2O15056 1496 aa35.89■■■■□ 3.34
TYMP-202ENST00000395678 FBLN2P98095 1184 aa35.86■■■■□ 3.33
TYMP-202ENST00000395678 OSCARQ8IYS5 282 aa35.83■■■■□ 3.33
TYMP-202ENST00000395678 KIF27Q86VH2 1401 aa35.83■■■■□ 3.33
TYMP-202ENST00000395678 TRIM41Q8WV44 630 aa35.83■■■■□ 3.33
TYMP-202ENST00000395678 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.76■■■■□ 3.32
TYMP-202ENST00000395678 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
TYMP-202ENST00000395678 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.73■■■■□ 3.31
TYMP-202ENST00000395678 GRIN2AQ12879 1464 aa35.72■■■■□ 3.31
TYMP-202ENST00000395678 CUL7Q14999 1698 aa35.71■■■■□ 3.31
TYMP-202ENST00000395678 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.67■■■■□ 3.3
TYMP-202ENST00000395678 IGF1RP08069 1367 aa35.67■■■■□ 3.3
TYMP-202ENST00000395678 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.67■■■■□ 3.3
TYMP-202ENST00000395678 CEP170Q5SW79 1584 aa35.64■■■■□ 3.3
TYMP-202ENST00000395678 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.53■■■■□ 3.28
TYMP-202ENST00000395678 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.53■■■■□ 3.28
TYMP-202ENST00000395678 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.53■■■■□ 3.28
TYMP-202ENST00000395678 NUP160Q12769 1436 aa35.53■■■■□ 3.28
TYMP-202ENST00000395678 ARHGEF11O15085 1522 aa35.47■■■■□ 3.27
TYMP-202ENST00000395678 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.45■■■■□ 3.27
TYMP-202ENST00000395678 SHROOM2Q13796 1616 aa35.36■■■■□ 3.25
TYMP-202ENST00000395678 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.3■■■■□ 3.24
TYMP-202ENST00000395678 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.3■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms