RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331289.4

ASCL2-201, Transcript of achaete-scute family bHLH transcription factor 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ASCL2, Length 1,852 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL2-201ENST00000331289 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.95■■■■■ 5.59
ASCL2-201ENST00000331289 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.05■■■■■ 4.64
ASCL2-201ENST00000331289 ABCC9O60706 1549 aa42.46■■■■■ 4.39
ASCL2-201ENST00000331289 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
ASCL2-201ENST00000331289 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.57■■■■■ 4.24
ASCL2-201ENST00000331289 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.29■■■■■ 4.2
ASCL2-201ENST00000331289 NACADO15069 1562 aa41.21■■■■■ 4.19
ASCL2-201ENST00000331289 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.14■■■■■ 4.18
ASCL2-201ENST00000331289 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.1■■■■■ 4.17
ASCL2-201ENST00000331289 SCRIBQ14160 1630 aa40.37■■■■■ 4.05
ASCL2-201ENST00000331289 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.29■■■■■ 4.04
ASCL2-201ENST00000331289 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.1■■■■■ 4.01
ASCL2-201ENST00000331289 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.85■■■■□ 3.97
ASCL2-201ENST00000331289 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.82■■■■□ 3.97
ASCL2-201ENST00000331289 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.88■■■■□ 3.81
ASCL2-201ENST00000331289 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.75■■■■□ 3.79
ASCL2-201ENST00000331289 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.67■■■■□ 3.78
ASCL2-201ENST00000331289 SMARCA4P51532 1647 aa38.63■■■■□ 3.77
ASCL2-201ENST00000331289 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.56■■■■□ 3.76
ASCL2-201ENST00000331289 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.42■■■■□ 3.74
ASCL2-201ENST00000331289 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.37■■■■□ 3.73
ASCL2-201ENST00000331289 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.24■■■■□ 3.71
ASCL2-201ENST00000331289 WIZO95785 1651 aa38.23■■■■□ 3.71
ASCL2-201ENST00000331289 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.18■■■■□ 3.7
ASCL2-201ENST00000331289 SMARCA2P51531 1590 aa38.17■■■■□ 3.7
ASCL2-201ENST00000331289 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.16■■■■□ 3.7
ASCL2-201ENST00000331289 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.11■■■■□ 3.69
ASCL2-201ENST00000331289 NCAPD3P42695 1498 aa38■■■■□ 3.67
ASCL2-201ENST00000331289 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.95■■■■□ 3.67
ASCL2-201ENST00000331289 HMGXB3Q12766 1538 aa37.91■■■■□ 3.66
ASCL2-201ENST00000331289 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.78■■■■□ 3.64
ASCL2-201ENST00000331289 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.35■■■■□ 3.57
ASCL2-201ENST00000331289 NESP48681 1621 aa36.98■■■■□ 3.51
ASCL2-201ENST00000331289 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.97■■■■□ 3.51
ASCL2-201ENST00000331289 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.91■■■■□ 3.5
ASCL2-201ENST00000331289 CFTRP13569 1480 aa36.91■■■■□ 3.5
ASCL2-201ENST00000331289 PRDM2Q13029 1718 aa36.77■■■■□ 3.48
ASCL2-201ENST00000331289 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.63■■■■□ 3.45
ASCL2-201ENST00000331289 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.58■■■■□ 3.45
ASCL2-201ENST00000331289 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.58■■■■□ 3.45
ASCL2-201ENST00000331289 ERCC6Q03468 1493 aa36.53■■■■□ 3.44
ASCL2-201ENST00000331289 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.46■■■■□ 3.43
ASCL2-201ENST00000331289 ABCC8Q09428 1581 aa36.31■■■■□ 3.4
ASCL2-201ENST00000331289 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.23■■■■□ 3.39
ASCL2-201ENST00000331289 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
ASCL2-201ENST00000331289 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
ASCL2-201ENST00000331289 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.16■■■■□ 3.38
ASCL2-201ENST00000331289 CUX1P39880 1505 aa36.12■■■■□ 3.37
ASCL2-201ENST00000331289 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.1■■■■□ 3.37
ASCL2-201ENST00000331289 WDR62O43379 1518 aa36.08■■■■□ 3.37
ASCL2-201ENST00000331289 TOPBP1Q92547 1522 aa36.08■■■■□ 3.37
ASCL2-201ENST00000331289 SYNJ1O43426 1573 aa36.08■■■■□ 3.37
ASCL2-201ENST00000331289 TOP2BQ02880 1626 aa36■■■■□ 3.35
ASCL2-201ENST00000331289 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.99■■■■□ 3.35
ASCL2-201ENST00000331289 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.94■■■■□ 3.34
ASCL2-201ENST00000331289 TRIM41Q8WV44 630 aa35.89■■■■□ 3.34
ASCL2-201ENST00000331289 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.88■■■■□ 3.33
ASCL2-201ENST00000331289 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
ASCL2-201ENST00000331289 CUX2O14529 1486 aa35.76■■■■□ 3.31
ASCL2-201ENST00000331289 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.71■■■■□ 3.31
ASCL2-201ENST00000331289 SOGA1O94964 1423 aa35.69■■■■□ 3.3
ASCL2-201ENST00000331289 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
ASCL2-201ENST00000331289 IFT140Q96RY7 1462 aa35.63■■■■□ 3.29
ASCL2-201ENST00000331289 WDR97A6NE52 1622 aa35.54■■■■□ 3.28
ASCL2-201ENST00000331289 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.52■■■■□ 3.28
ASCL2-201ENST00000331289 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
ASCL2-201ENST00000331289 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
ASCL2-201ENST00000331289 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
ASCL2-201ENST00000331289 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.37■■■■□ 3.25
ASCL2-201ENST00000331289 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.35■■■■□ 3.25
ASCL2-201ENST00000331289 KIF27Q86VH2 1401 aa35.33■■■■□ 3.25
ASCL2-201ENST00000331289 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.33■■■■□ 3.25
ASCL2-201ENST00000331289 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.3■■■■□ 3.24
ASCL2-201ENST00000331289 PBRM1Q86U86 1689 aa35.23■■■■□ 3.23
ASCL2-201ENST00000331289 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
ASCL2-201ENST00000331289 GRIN2BQ13224 1484 aa35.17■■■■□ 3.22
ASCL2-201ENST00000331289 EEA1Q15075 1411 aa35.12■■■■□ 3.21
ASCL2-201ENST00000331289 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.11■■■■□ 3.21
ASCL2-201ENST00000331289 IGF1RP08069 1367 aa35.08■■■■□ 3.21
ASCL2-201ENST00000331289 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.06■■■■□ 3.2
ASCL2-201ENST00000331289 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.02■■■■□ 3.2
ASCL2-201ENST00000331289 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
ASCL2-201ENST00000331289 CUL7Q14999 1698 aa34.97■■■■□ 3.19
ASCL2-201ENST00000331289 ADAMTS12P58397 1594 aa34.96■■■■□ 3.19
ASCL2-201ENST00000331289 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.9■■■■□ 3.18
ASCL2-201ENST00000331289 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.89■■■■□ 3.18
ASCL2-201ENST00000331289 FBLN2P98095 1184 aa34.86■■■■□ 3.17
ASCL2-201ENST00000331289 SYNJ2O15056 1496 aa34.86■■■■□ 3.17
ASCL2-201ENST00000331289 PRXQ9BXM0 1461 aa34.84■■■■□ 3.17
ASCL2-201ENST00000331289 CHD1O14646 1710 aa34.82■■■■□ 3.16
ASCL2-201ENST00000331289 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.81■■■■□ 3.16
ASCL2-201ENST00000331289 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.79■■■■□ 3.16
ASCL2-201ENST00000331289 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.78■■■■□ 3.16
ASCL2-201ENST00000331289 KIF21BO75037 1637 aa34.76■■■■□ 3.16
ASCL2-201ENST00000331289 GRIN2AQ12879 1464 aa34.74■■■■□ 3.15
ASCL2-201ENST00000331289 GOLGA3Q08378 1498 aa34.63■■■■□ 3.13
ASCL2-201ENST00000331289 CEP170Q5SW79 1584 aa34.56■■■■□ 3.12
ASCL2-201ENST00000331289 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.54■■■■□ 3.12
ASCL2-201ENST00000331289 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
ASCL2-201ENST00000331289 NUP160Q12769 1436 aa34.51■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms