RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373228.5

FPGS-202, Transcript of folylpolyglutamate synthase, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene FPGS, Length 1,383 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGS-202ENST00000373228 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.69■■■■■ 6.18
FPGS-202ENST00000373228 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.15■■■■■ 5.3
FPGS-202ENST00000373228 ABCC9O60706 1549 aa48.14■■■■■ 5.3
FPGS-202ENST00000373228 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.83■■■■■ 4.93
FPGS-202ENST00000373228 NACADO15069 1562 aa45.53■■■■■ 4.88
FPGS-202ENST00000373228 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.29■■■■■ 4.84
FPGS-202ENST00000373228 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.13■■■■■ 4.82
FPGS-202ENST00000373228 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.92■■■■■ 4.78
FPGS-202ENST00000373228 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.82■■■■■ 4.772e-7■■■□□ 15
FPGS-202ENST00000373228 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.77■■■■■ 4.76
FPGS-202ENST00000373228 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.51■■■■■ 4.72
FPGS-202ENST00000373228 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.5■■■■■ 4.71
FPGS-202ENST00000373228 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.35■■■■■ 4.69
FPGS-202ENST00000373228 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.92■■■■■ 4.62
FPGS-202ENST00000373228 SCRIBQ14160 1630 aa43.89■■■■■ 4.62
FPGS-202ENST00000373228 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.49■■■■■ 4.55
FPGS-202ENST00000373228 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.41■■■■■ 4.54
FPGS-202ENST00000373228 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.36■■■■■ 4.53
FPGS-202ENST00000373228 NCAPD3P42695 1498 aa42.03■■■■■ 4.32
FPGS-202ENST00000373228 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.92■■■■■ 4.3
FPGS-202ENST00000373228 SMARCA4P51532 1647 aa41.87■■■■■ 4.29
FPGS-202ENST00000373228 SMARCA2P51531 1590 aa41.79■■■■■ 4.28
FPGS-202ENST00000373228 HMGXB3Q12766 1538 aa41.73■■■■■ 4.27
FPGS-202ENST00000373228 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.68■■■■■ 4.26
FPGS-202ENST00000373228 ERCC6Q03468 1493 aa41.56■■■■■ 4.24
FPGS-202ENST00000373228 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
FPGS-202ENST00000373228 CUX2O14529 1486 aa41.48■■■■■ 4.23
FPGS-202ENST00000373228 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.47■■■■■ 4.23
FPGS-202ENST00000373228 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.41■■■■■ 4.22
FPGS-202ENST00000373228 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.38■■■■■ 4.21
FPGS-202ENST00000373228 NESP48681 1621 aa41.37■■■■■ 4.21
FPGS-202ENST00000373228 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.08■■■■■ 4.17
FPGS-202ENST00000373228 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
FPGS-202ENST00000373228 WIZO95785 1651 aa40.86■■■■■ 4.13
FPGS-202ENST00000373228 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.84■■■■■ 4.13
FPGS-202ENST00000373228 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.82■■■■■ 4.12
FPGS-202ENST00000373228 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.76■■■■■ 4.12
FPGS-202ENST00000373228 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
FPGS-202ENST00000373228 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.49■■■■■ 4.07
FPGS-202ENST00000373228 WDR62O43379 1518 aa40.4■■■■■ 4.06
FPGS-202ENST00000373228 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
FPGS-202ENST00000373228 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.34■■■■■ 4.05
FPGS-202ENST00000373228 CFTRP13569 1480 aa40.3■■■■■ 4.04
FPGS-202ENST00000373228 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.3■■■■■ 4.04
FPGS-202ENST00000373228 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.96■■■■□ 3.99
FPGS-202ENST00000373228 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.91■■■■□ 3.98
FPGS-202ENST00000373228 PRDM2Q13029 1718 aa39.87■■■■□ 3.97
FPGS-202ENST00000373228 TRIM41Q8WV44 630 aa39.62■■■■□ 3.93
FPGS-202ENST00000373228 OSCARQ8IYS5 282 aa39.58■■■■□ 3.93
FPGS-202ENST00000373228 TOPBP1Q92547 1522 aa39.54■■■■□ 3.92
FPGS-202ENST00000373228 IFT140Q96RY7 1462 aa39.53■■■■□ 3.92
FPGS-202ENST00000373228 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.47■■■■□ 3.91
FPGS-202ENST00000373228 ABCC8Q09428 1581 aa39.45■■■■□ 3.91
FPGS-202ENST00000373228 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.41■■■■□ 3.9
FPGS-202ENST00000373228 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.39■■■■□ 3.9
FPGS-202ENST00000373228 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
FPGS-202ENST00000373228 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.18■■■■□ 3.86
FPGS-202ENST00000373228 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.14■■■■□ 3.86
FPGS-202ENST00000373228 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.12■■■■□ 3.854e-7■■■■■ 31.5
FPGS-202ENST00000373228 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.07■■■■□ 3.84
FPGS-202ENST00000373228 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.07■■■■□ 3.84
FPGS-202ENST00000373228 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.07■■■■□ 3.84
FPGS-202ENST00000373228 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39■■■■□ 3.83
FPGS-202ENST00000373228 ARHGEF11O15085 1522 aa38.96■■■■□ 3.83
FPGS-202ENST00000373228 SOGA1O94964 1423 aa38.95■■■■□ 3.83
FPGS-202ENST00000373228 CHD1O14646 1710 aa38.94■■■■□ 3.82
FPGS-202ENST00000373228 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.9■■■■□ 3.82
FPGS-202ENST00000373228 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.88■■■■□ 3.81
FPGS-202ENST00000373228 CUX1P39880 1505 aa38.87■■■■□ 3.81
FPGS-202ENST00000373228 FBLN2P98095 1184 aa38.84■■■■□ 3.81
FPGS-202ENST00000373228 WDR97A6NE52 1622 aa38.79■■■■□ 3.8
FPGS-202ENST00000373228 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.73■■■■□ 3.79
FPGS-202ENST00000373228 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.66■■■■□ 3.78
FPGS-202ENST00000373228 GRIN2BQ13224 1484 aa38.62■■■■□ 3.77
FPGS-202ENST00000373228 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.62■■■■□ 3.77
FPGS-202ENST00000373228 ARAP1Q96P48 1450 aa38.59■■■■□ 3.77
FPGS-202ENST00000373228 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.57■■■■□ 3.76
FPGS-202ENST00000373228 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.52■■■■□ 3.76
FPGS-202ENST00000373228 SYNJ2O15056 1496 aa38.49■■■■□ 3.75
FPGS-202ENST00000373228 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.49■■■■□ 3.75
FPGS-202ENST00000373228 SYNJ1O43426 1573 aa38.49■■■■□ 3.75
FPGS-202ENST00000373228 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.46■■■■□ 3.75
FPGS-202ENST00000373228 PBRM1Q86U86 1689 aa38.45■■■■□ 3.75
FPGS-202ENST00000373228 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.4■■■■□ 3.74
FPGS-202ENST00000373228 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.31■■■■□ 3.72
FPGS-202ENST00000373228 TOP2BQ02880 1626 aa38.25■■■■□ 3.71
FPGS-202ENST00000373228 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.25■■■■□ 3.71
FPGS-202ENST00000373228 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.21■■■■□ 3.71
FPGS-202ENST00000373228 GRIN2AQ12879 1464 aa38.13■■■■□ 3.69
FPGS-202ENST00000373228 ADAMTS12P58397 1594 aa38.12■■■■□ 3.69
FPGS-202ENST00000373228 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.01■■■■□ 3.67
FPGS-202ENST00000373228 NUP160Q12769 1436 aa38■■■■□ 3.67
FPGS-202ENST00000373228 CEP170Q5SW79 1584 aa37.99■■■■□ 3.67
FPGS-202ENST00000373228 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.97■■■■□ 3.67
FPGS-202ENST00000373228 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.92■■■■□ 3.66
FPGS-202ENST00000373228 SHROOM2Q13796 1616 aa37.82■■■■□ 3.64
FPGS-202ENST00000373228 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.63■■■■□ 3.61
FPGS-202ENST00000373228 JPH4Q96JJ6 628 aa37.59■■■■□ 3.61
FPGS-202ENST00000373228 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.58■■■■□ 3.61
FPGS-202ENST00000373228 KIF27Q86VH2 1401 aa37.51■■■■□ 3.6
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