Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.723e-13■■■■□ 19.8
UTP3Q9NQZ2 VIM-206ENST00000487938 2272 ntTSL 519.46■□□□□ 0.713e-13■■■■□ 19.8
UTP3Q9NQZ2 VIM-209ENST00000544301 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)19.46■□□□□ 0.713e-13■■■■□ 19.8
UTP3Q9NQZ2 SPAG5-213ENST00000581133 743 ntTSL 310.47□□□□□ -0.736e-7■■■■□ 19.7
UTP3Q9NQZ2 ATXN2L-210ENST00000562867 609 ntTSL 219.27■□□□□ 0.683e-6■■■■□ 19.7
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-222ENST00000582050 576 ntTSL 519.23■□□□□ 0.671e-8■■■■□ 19.7
UTP3Q9NQZ2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.421e-8■■■■□ 19.7
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-207ENST00000578324 1577 ntTSL 517.21■□□□□ 0.351e-8■■■■□ 19.7
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-228ENST00000583389 951 ntTSL 315.54■□□□□ 0.081e-8■■■■□ 19.7
UTP3Q9NQZ2 SNRPF-203ENST00000551316 787 ntTSL 214.13□□□□□ -0.151e-8■■■■□ 19.7
UTP3Q9NQZ2 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.31e-8■■■■□ 19.7
UTP3Q9NQZ2 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.421e-8■■■■□ 19.7
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-221ENST00000581841 621 ntTSL 210.68□□□□□ -0.71e-8■■■■□ 19.7
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-210ENST00000578569 583 ntTSL 27.69□□□□□ -1.181e-8■■■■□ 19.7
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-220ENST00000581808 205 ntTSL 34.23□□□□□ -1.731e-8■■■■□ 19.7
UTP3Q9NQZ2 BRD2-213ENST00000495733 3404 ntTSL 215.75■□□□□ 0.119e-8■■■■□ 19.7
UTP3Q9NQZ2 BRD2-219ENST00000607833 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)14.09□□□□□ -0.159e-8■■■■□ 19.7
UTP3Q9NQZ2 SRSF1-207ENST00000584668 758 ntTSL 39.01□□□□□ -0.974e-6■■■■□ 19.7
UTP3Q9NQZ2 MAN2A2-211ENST00000559132 583 ntTSL 316.06■□□□□ 0.162e-7■■■■□ 19.7
UTP3Q9NQZ2 CEP57-210ENST00000538658 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.314e-6■■■■□ 19.7
UTP3Q9NQZ2 HDLBP-233ENST00000470710 578 ntTSL 29.35□□□□□ -0.916e-9■■■■□ 19.7
UTP3Q9NQZ2 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.272e-7■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 FAM219B-206ENST00000563671 865 ntTSL 224.17■■□□□ 1.462e-6■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 CTSZ-202ENST00000472025 564 ntTSL 220.71■□□□□ 0.912e-6■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.762e-6■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 FAM219B-215ENST00000566894 4706 ntTSL 217.36■□□□□ 0.372e-6■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 FAM219B-217ENST00000569524 3219 ntTSL 216.57■□□□□ 0.242e-6■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.22e-6■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.072e-6■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 TMBIM1-218ENST00000453776 561 ntTSL 314.28□□□□□ -0.122e-6■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 TMBIM1-219ENST00000465082 2874 ntTSL 213.9□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 TMBIM1-207ENST00000429501 677 ntTSL 513.28□□□□□ -0.282e-6■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 TMBIM1-210ENST00000439306 631 ntTSL 513.2□□□□□ -0.32e-6■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 TMBIM1-206ENST00000425694 569 ntTSL 213.02□□□□□ -0.332e-6■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 TMBIM1-216ENST00000451181 464 ntTSL 513.02□□□□□ -0.332e-6■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 TMBIM1-214ENST00000444881 2936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.452e-6■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 TMBIM1-212ENST00000444000 571 ntTSL 411.62□□□□□ -0.552e-6■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 TMBIM1-204ENST00000418569 589 ntTSL 311.44□□□□□ -0.582e-6■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 FAM219B-213ENST00000566132 624 ntTSL 310.79□□□□□ -0.682e-6■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.092e-9■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.082e-9■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.992e-9■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.92e-9■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.842e-9■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.692e-9■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.672e-9■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.672e-9■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.542e-9■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.492e-9■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.472e-9■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.472e-9■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.22e-9■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.22e-9■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.132e-9■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.222e-9■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.252e-9■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 ANAPC11-205ENST00000571570 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.672e-9■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.862e-9■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 LONP1-214ENST00000591321 913 ntTSL 319.34■□□□□ 0.692e-7■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.021e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-206ENST00000537925 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.461e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-209ENST00000538654 2768 ntTSL 29.93□□□□□ -0.821e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.821e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-224ENST00000545688 610 ntTSL 39.85□□□□□ -0.831e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-223ENST00000545440 754 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.961e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.191e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.241e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.31e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-201ENST00000535076 849 ntTSL 26.6□□□□□ -1.351e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.371e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.451e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.531e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.551e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 SNHG1-220ENST00000544550 636 ntTSL 25.12□□□□□ -1.591e-323■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.621e-6■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.621e-6■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.091e-6■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.941e-6■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.383e-9■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 HNRNPL-204ENST00000595443 2122 ntTSL 212.5□□□□□ -0.413e-9■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 AC008982.1-202ENST00000602021 342 ntTSL 58.5□□□□□ -1.053e-9■■■■□ 19.6
UTP3Q9NQZ2 FDFT1-221ENST00000532266 583 ntTSL 59.38□□□□□ -0.913e-6■■■■□ 19.5
UTP3Q9NQZ2 PTBP1-207ENST00000585932 1030 ntTSL 322.25■■□□□ 1.158e-7■■■■□ 19.5
UTP3Q9NQZ2 PSMC2-204ENST00000457587 682 ntTSL 311.15□□□□□ -0.624e-7■■■■□ 19.5
UTP3Q9NQZ2 NUMA1-216ENST00000540588 216 ntTSL 29.55□□□□□ -0.884e-7■■■■□ 19.5
UTP3Q9NQZ2 PSMC2-206ENST00000640277 1357 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.94e-7■■■■□ 19.5
UTP3Q9NQZ2 PSMC2-201ENST00000292644 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.924e-7■■■■□ 19.5
UTP3Q9NQZ2 PSMC2-202ENST00000425206 656 ntTSL 38.91□□□□□ -0.984e-7■■■■□ 19.5
UTP3Q9NQZ2 PSMC2-203ENST00000435765 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.024e-7■■■■□ 19.5
UTP3Q9NQZ2 PSMC2-205ENST00000460021 733 ntTSL 27.98□□□□□ -1.134e-7■■■■□ 19.5
UTP3Q9NQZ2 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.142e-6■■■■□ 19.5
UTP3Q9NQZ2 TROVE2-203ENST00000367444 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 19.5
UTP3Q9NQZ2 TROVE2-202ENST00000367443 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.722e-6■■■■□ 19.5
UTP3Q9NQZ2 TROVE2-204ENST00000367445 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.822e-6■■■■□ 19.5
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH1-231ENST00000519033 832 ntTSL 318.14■□□□□ 0.491e-7■■■■□ 19.5
UTP3Q9NQZ2 EEF1B2-211ENST00000482103 587 ntTSL 29.54□□□□□ -0.883e-12■■■■□ 19.5
UTP3Q9NQZ2 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC5.42□□□□□ -1.543e-12■■■■□ 19.5
UTP3Q9NQZ2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.378e-7■■■■□ 19.4
UTP3Q9NQZ2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.668e-7■■■■□ 19.4
UTP3Q9NQZ2 CDK5RAP3-218ENST00000580391 1957 ntTSL 516.09■□□□□ 0.172e-6■■■■□ 19.4
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 3781.1 ms