Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 APP-215ENST00000474136 1309 ntTSL 1 (best)21.9■■□□□ 1.11e-11■■□□□ 11.7
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NOLC1Q14978 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.244e-8■■□□□ 11.7
NOLC1Q14978 CAP1-201ENST00000340450 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.014e-8■■□□□ 11.7
NOLC1Q14978 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.08□□□□□ -2.084e-20■■□□□ 11.7
NOLC1Q14978 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.343e-8■■□□□ 11.7
NOLC1Q14978 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.171e-6■■□□□ 11.7
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NOLC1Q14978 RPLP0-205ENST00000546989 993 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.261e-6■■□□□ 11.7
NOLC1Q14978 RPLP0-203ENST00000392514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.411e-6■■□□□ 11.7
NOLC1Q14978 RPLP0-214ENST00000549098 1106 ntTSL 212.18□□□□□ -0.461e-6■■□□□ 11.7
NOLC1Q14978 RPLP0-202ENST00000313104 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.61e-6■■□□□ 11.7
NOLC1Q14978 RPLP0-221ENST00000551258 966 ntTSL 511.28□□□□□ -0.61e-6■■□□□ 11.7
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NOLC1Q14978 AC087632.1-211ENST00000560278 595 ntTSL 48.04□□□□□ -1.125e-16■■□□□ 11.7
NOLC1Q14978 AC087632.1-201ENST00000634251 1973 ntTSL 1 (best)7.26□□□□□ -1.255e-16■■□□□ 11.7
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NOLC1Q14978 SNORA5C-201ENST00000364902 137 ntBASIC11.29□□□□□ -0.61e-323■■□□□ 11.7
NOLC1Q14978 FN1-220ENST00000480024 576 ntTSL 27.32□□□□□ -1.242e-59■■□□□ 11.7
NOLC1Q14978 ATP1A1-205ENST00000440951 579 ntTSL 57.68□□□□□ -1.184e-9■■□□□ 11.7
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NOLC1Q14978 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.652e-6■■□□□ 11.7
NOLC1Q14978 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.552e-6■■□□□ 11.7
NOLC1Q14978 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.552e-6■■□□□ 11.7
NOLC1Q14978 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.492e-6■■□□□ 11.7
NOLC1Q14978 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.322e-6■■□□□ 11.7
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NOLC1Q14978 NSD2-222ENST00000512700 1095 ntTSL 513.06□□□□□ -0.322e-6■■□□□ 11.7
NOLC1Q14978 NSD2-227ENST00000515806 816 ntTSL 311.94□□□□□ -0.52e-6■■□□□ 11.7
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NOLC1Q14978 APLP2-212ENST00000529483 323 ntTSL 56.52□□□□□ -1.372e-12■■□□□ 11.7
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NOLC1Q14978 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.833e-7■■□□□ 11.7
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NOLC1Q14978 SLC25A37-204ENST00000518881 3404 ntTSL 1 (best)17.17■□□□□ 0.341e-8■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 SLC25A37-211ENST00000523883 3651 ntTSL 211.97□□□□□ -0.491e-8■■□□□ 11.6
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NOLC1Q14978 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.083e-7■■□□□ 11.6
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NOLC1Q14978 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.975e-7■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.575e-7■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.525e-7■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.395e-7■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 APP-201ENST00000346798 3467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.145e-7■■□□□ 11.6
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NOLC1Q14978 APP-209ENST00000440126 2846 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.965e-7■■□□□ 11.6
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NOLC1Q14978 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.23e-9■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.473e-9■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.623e-9■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.973e-10■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.863e-10■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.173e-10■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 AP2M1-212ENST00000461733 1470 ntTSL 216.11■□□□□ 0.173e-10■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 PCLAF-204ENST00000558043 689 ntTSL 28.17□□□□□ -1.12e-10■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 C2-215ENST00000486124 2800 ntTSL 512.73□□□□□ -0.371e-6■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.189e-12■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.139e-12■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.739e-12■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.679e-12■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 PKM-214ENST00000565143 2301 ntTSL 1 (best)15.07■□□□□ 03e-8■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 PKM-222ENST00000568883 1863 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.039e-12■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 PKM-202ENST00000335181 2318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.079e-12■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 PKM-219ENST00000567118 2254 ntTSL 213.09□□□□□ -0.319e-12■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 PKM-212ENST00000564440 3016 ntTSL 1 (best)10.9□□□□□ -0.673e-8■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 NUCB1-204ENST00000424608 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 521.98■■□□□ 1.119e-8■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 NUCB1-207ENST00000452087 864 ntTSL 320.66■□□□□ 0.99e-8■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.79e-8■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 P4HA2-215ENST00000453286 819 ntTSL 518.14■□□□□ 0.499e-8■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.379e-8■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 NUCB1-209ENST00000465524 839 ntTSL 517.18■□□□□ 0.349e-8■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 NUCB1-211ENST00000485798 938 ntTSL 316.6■□□□□ 0.259e-8■■□□□ 11.6
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