Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE0

EDAR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member EDAR, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDARQ9UNE0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDARQ9UNE0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDARQ9UNE0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EDARQ9UNE0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDARQ9UNE0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDARQ9UNE0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDARQ9UNE0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDARQ9UNE0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDARQ9UNE0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDARQ9UNE0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDARQ9UNE0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDARQ9UNE0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDARQ9UNE0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDARQ9UNE0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EDARQ9UNE0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDARQ9UNE0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EDARQ9UNE0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDARQ9UNE0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EDARQ9UNE0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDARQ9UNE0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDARQ9UNE0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EDARQ9UNE0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EDARQ9UNE0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDARQ9UNE0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDARQ9UNE0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EDARQ9UNE0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EDARQ9UNE0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDARQ9UNE0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDARQ9UNE0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDARQ9UNE0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDARQ9UNE0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDARQ9UNE0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EDARQ9UNE0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EDARQ9UNE0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDARQ9UNE0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDARQ9UNE0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDARQ9UNE0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EDARQ9UNE0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDARQ9UNE0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDARQ9UNE0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDARQ9UNE0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDARQ9UNE0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDARQ9UNE0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDARQ9UNE0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDARQ9UNE0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDARQ9UNE0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDARQ9UNE0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDARQ9UNE0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDARQ9UNE0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDARQ9UNE0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDARQ9UNE0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDARQ9UNE0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EDARQ9UNE0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDARQ9UNE0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDARQ9UNE0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDARQ9UNE0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDARQ9UNE0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EDARQ9UNE0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDARQ9UNE0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDARQ9UNE0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EDARQ9UNE0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDARQ9UNE0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDARQ9UNE0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDARQ9UNE0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDARQ9UNE0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDARQ9UNE0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDARQ9UNE0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDARQ9UNE0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDARQ9UNE0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDARQ9UNE0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDARQ9UNE0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDARQ9UNE0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDARQ9UNE0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDARQ9UNE0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDARQ9UNE0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDARQ9UNE0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDARQ9UNE0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDARQ9UNE0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDARQ9UNE0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EDARQ9UNE0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDARQ9UNE0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDARQ9UNE0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EDARQ9UNE0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDARQ9UNE0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EDARQ9UNE0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDARQ9UNE0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDARQ9UNE0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDARQ9UNE0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EDARQ9UNE0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDARQ9UNE0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDARQ9UNE0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDARQ9UNE0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDARQ9UNE0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDARQ9UNE0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDARQ9UNE0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EDARQ9UNE0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDARQ9UNE0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDARQ9UNE0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDARQ9UNE0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDARQ9UNE0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms