Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 GAS5-227ENST00000456293 583 ntTSL 38.74□□□□□ -1.011e-46■■■■■ 69.1
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AATFQ9NY61 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 68.4
AATFQ9NY61 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 68.4
AATFQ9NY61 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 68.4
AATFQ9NY61 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 68.4
AATFQ9NY61 RPS8-207ENST00000485390 1115 ntTSL 1 (best)25.72■■□□□ 1.711e-323■■■■■ 68.3
AATFQ9NY61 RPS8-204ENST00000470475 981 ntTSL 218.14■□□□□ 0.491e-323■■■■■ 68.3
AATFQ9NY61 RPS8-208ENST00000497035 694 ntTSL 317.78■□□□□ 0.441e-323■■■■■ 68.3
AATFQ9NY61 RPS8-202ENST00000396651 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.151e-323■■■■■ 68.3
AATFQ9NY61 RPS8-201ENST00000372209 685 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.331e-323■■■■■ 68.3
AATFQ9NY61 SNORD46-201ENST00000364043 104 ntBASIC9.03□□□□□ -0.961e-323■■■■■ 68.3
AATFQ9NY61 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.072e-7■■■■■ 68
AATFQ9NY61 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.792e-7■■■■■ 68
AATFQ9NY61 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 68
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AATFQ9NY61 NUMBL-206ENST00000598773 834 ntTSL 526.81■■□□□ 1.886e-10■■■■■ 67.8
AATFQ9NY61 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.016e-10■■■■■ 67.8
AATFQ9NY61 NUMBL-210ENST00000600636 555 ntTSL 419.74■□□□□ 0.756e-10■■■■■ 67.8
AATFQ9NY61 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.046e-10■■■■■ 67.8
AATFQ9NY61 GAK-208ENST00000507124 552 ntTSL 429.12■■■□□ 2.256e-8■■■■■ 67.1
AATFQ9NY61 SNORD3C-201ENST00000580533 581 ntBASIC14.09□□□□□ -0.159e-43■■■■■ 67.1
AATFQ9NY61 SNORD3C-203ENST00000625845 217 nt13.43□□□□□ -0.269e-43■■■■■ 67.1
AATFQ9NY61 SNORD3C-202ENST00000620446 218 nt13.19□□□□□ -0.39e-43■■■■■ 67.1
AATFQ9NY61 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.521e-323■■■■■ 67.1
AATFQ9NY61 SNX29-204ENST00000564791 1633 ntTSL 1 (best)13.39□□□□□ -0.274e-7■■■■■ 66.6
AATFQ9NY61 SNX29-205ENST00000566228 8171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.584e-7■■■■■ 66.6
AATFQ9NY61 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.492e-51■■■■■ 66.5
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AATFQ9NY61 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.112e-51■■■■■ 66.5
AATFQ9NY61 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.012e-51■■■■■ 66.5
AATFQ9NY61 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.982e-51■■■■■ 66.5
AATFQ9NY61 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.982e-51■■■■■ 66.5
AATFQ9NY61 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.182e-51■■■■■ 66.5
AATFQ9NY61 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.182e-51■■■■■ 66.5
AATFQ9NY61 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC0.95□□□□□ -2.261e-323■■■■■ 66.3
AATFQ9NY61 NR2F2-AS1-202ENST00000557863 515 ntTSL 319.41■□□□□ 0.77e-21■■■■■ 66.3
AATFQ9NY61 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.057e-21■■■■■ 66.3
AATFQ9NY61 NR2F2-AS1-201ENST00000502125 1930 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.417e-21■■■■■ 66.3
AATFQ9NY61 NR2F2-AS1-203ENST00000558929 574 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.597e-21■■■■■ 66.3
AATFQ9NY61 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC8.22□□□□□ -1.097e-21■■■■■ 66.3
AATFQ9NY61 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.87e-21■■■■■ 66.3
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AATFQ9NY61 SNHG16-201ENST00000448136 3607 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.623e-20■■■■■ 65.4
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AATFQ9NY61 SNHG16-206ENST00000587838 884 ntTSL 36.24□□□□□ -1.413e-20■■■■■ 65.4
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AATFQ9NY61 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.723e-6■■■■■ 64.9
AATFQ9NY61 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.493e-6■■■■■ 64.9
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AATFQ9NY61 SERPINA1-208ENST00000448921 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.793e-7■■■■■ 64.5
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AATFQ9NY61 RPL32P3-206ENST00000510078 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.561e-9■■■■■ 64.5
AATFQ9NY61 RPL32P3-208ENST00000515866 702 ntTSL 310.64□□□□□ -0.711e-9■■■■■ 64.5
AATFQ9NY61 RPL32P3-202ENST00000499631 593 ntTSL 49.83□□□□□ -0.841e-9■■■■■ 64.5
AATFQ9NY61 AGRN-202ENST00000419249 861 ntTSL 322.24■■□□□ 1.156e-14■■■■■ 64.5
AATFQ9NY61 NOP58-203ENST00000433543 714 ntTSL 33.46□□□□□ -1.862e-11■■■■■ 64.4
AATFQ9NY61 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.577e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 SEMA7A-204ENST00000567345 674 ntTSL 424.13■■□□□ 1.457e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.447e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 PALM-211ENST00000633534 879 ntTSL 323.86■■□□□ 1.417e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.397e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.337e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.327e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 PALM-210ENST00000593172 2489 ntTSL 222.78■■□□□ 1.247e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 PALM-206ENST00000589012 579 ntTSL 322.26■■□□□ 1.157e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.147e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 KLHDC8B-203ENST00000462582 832 ntTSL 521.04■□□□□ 0.967e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 PALM-205ENST00000587513 2290 ntTSL 420.72■□□□□ 0.917e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.857e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.777e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.697e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 SPPL2B-206ENST00000593243 551 ntTSL 419.06■□□□□ 0.647e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 SDC3-203ENST00000471567 589 ntTSL 318.54■□□□□ 0.567e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 C2orf48-202ENST00000619640 480 ntTSL 1 (best)18.53■□□□□ 0.567e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.527e-7■■■■■ 63.9
AATFQ9NY61 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.37e-7■■■■■ 63.9
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