Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 ZDHHC8P1-205ENST00000456279 435 ntTSL 530.11■■■□□ 2.412e-9■■■■■ 72.5
DROSHAQ9NRR4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.312e-9■■■■■ 72.5
DROSHAQ9NRR4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.672e-9■■■■■ 72.5
DROSHAQ9NRR4 POFUT2-210ENST00000485190 616 ntTSL 217.85■□□□□ 0.452e-9■■■■■ 72.5
DROSHAQ9NRR4 GSE1-215ENST00000635906 666 ntTSL 318.66■□□□□ 0.584e-7■■■■■ 72.5
DROSHAQ9NRR4 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)32.83■■■□□ 2.853e-9■■■■■ 72.1
DROSHAQ9NRR4 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 228.51■■■□□ 2.163e-9■■■■■ 72.1
DROSHAQ9NRR4 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 227.23■■□□□ 1.953e-9■■■■■ 72.1
DROSHAQ9NRR4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.683e-9■■■■■ 72.1
DROSHAQ9NRR4 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.063e-9■■■■■ 72.1
DROSHAQ9NRR4 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.13e-9■■■■■ 72.1
DROSHAQ9NRR4 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 314.09□□□□□ -0.153e-9■■■■■ 72.1
DROSHAQ9NRR4 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 513.9□□□□□ -0.183e-9■■■■■ 72.1
DROSHAQ9NRR4 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 43.22□□□□□ -1.893e-9■■■■■ 72.1
DROSHAQ9NRR4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.41■■□□□ 1.981e-39■■■■■ 71.2
DROSHAQ9NRR4 CAMK2G-209ENST00000441192 1224 ntTSL 523.87■■□□□ 1.411e-7■■■■■ 70.9
DROSHAQ9NRR4 CAMK2G-208ENST00000433289 1618 ntTSL 1 (best)20.97■□□□□ 0.951e-7■■■■■ 70.9
DROSHAQ9NRR4 CAMK2G-211ENST00000474131 512 ntTSL 1 (best)14.13□□□□□ -0.151e-7■■■■■ 70.9
DROSHAQ9NRR4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.014e-8■■■■■ 70.4
DROSHAQ9NRR4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.957e-10■■■■■ 69.8
DROSHAQ9NRR4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.927e-10■■■■■ 69.8
DROSHAQ9NRR4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.527e-10■■■■■ 69.8
DROSHAQ9NRR4 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.37e-10■■■■■ 69.8
DROSHAQ9NRR4 SNAP47-204ENST00000418653 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)18.79■□□□□ 0.67e-10■■■■■ 69.8
DROSHAQ9NRR4 SNAP47-205ENST00000426344 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.2■□□□□ 0.347e-10■■■■■ 69.8
DROSHAQ9NRR4 SNAP47-208ENST00000478768 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.32■□□□□ 0.27e-10■■■■■ 69.8
DROSHAQ9NRR4 LRP8-209ENST00000480045 3231 ntTSL 526.86■■□□□ 1.895e-10■■■■■ 69.7
DROSHAQ9NRR4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.715e-10■■■■■ 69.7
DROSHAQ9NRR4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.515e-10■■■■■ 69.7
DROSHAQ9NRR4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.065e-10■■■■■ 69.7
DROSHAQ9NRR4 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.695e-10■■■■■ 69.7
DROSHAQ9NRR4 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.375e-10■■■■■ 69.7
DROSHAQ9NRR4 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC3.24□□□□□ -1.892e-14■■■■■ 69.5
DROSHAQ9NRR4 CCDC61-208ENST00000601763 291 ntTSL 324.62■■□□□ 1.533e-10■■■■■ 69
DROSHAQ9NRR4 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.461e-49■■■■■ 68.2
DROSHAQ9NRR4 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.83□□□□□ -2.283e-12■■■■■ 67.5
DROSHAQ9NRR4 C9orf3-215ENST00000478473 895 ntTSL 336.15■■■■□ 3.382e-9■■■■■ 67.4
DROSHAQ9NRR4 C9orf3-213ENST00000471978 478 ntTSL 235.04■■■■□ 3.22e-9■■■■■ 67.4
DROSHAQ9NRR4 C9orf3-211ENST00000463372 919 ntTSL 322.81■■□□□ 1.242e-9■■■■■ 67.4
DROSHAQ9NRR4 C9orf3-206ENST00000428313 2288 ntTSL 1 (best)21.64■■□□□ 1.052e-9■■■■■ 67.4
DROSHAQ9NRR4 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.012e-9■■■■■ 67.4
DROSHAQ9NRR4 C9orf3-212ENST00000468164 849 ntTSL 520.81■□□□□ 0.922e-9■■■■■ 67.4
DROSHAQ9NRR4 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.262e-9■■■■■ 67.4
DROSHAQ9NRR4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.455e-7■■■■■ 67.4
DROSHAQ9NRR4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.312e-9■■■■■ 67
DROSHAQ9NRR4 GAK-220ENST00000513935 573 ntTSL 222.34■■□□□ 1.172e-9■■■■■ 67
DROSHAQ9NRR4 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.481e-7■■■■■ 66.9
DROSHAQ9NRR4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.528e-14■■■■■ 66.9
DROSHAQ9NRR4 NADSYN1-214ENST00000529120 574 ntTSL 524.48■■□□□ 1.518e-14■■■■■ 66.9
DROSHAQ9NRR4 NADSYN1-203ENST00000524949 839 ntTSL 223.68■■□□□ 1.388e-14■■■■■ 66.9
DROSHAQ9NRR4 NADSYN1-221ENST00000533769 559 ntTSL 422.76■■□□□ 1.238e-14■■■■■ 66.9
DROSHAQ9NRR4 NADSYN1-209ENST00000527538 720 ntTSL 322.46■■□□□ 1.198e-14■■■■■ 66.9
DROSHAQ9NRR4 NADSYN1-213ENST00000528509 2999 ntTSL 1 (best)20.67■□□□□ 0.98e-14■■■■■ 66.9
DROSHAQ9NRR4 NADSYN1-205ENST00000525245 603 ntTSL 515.11■□□□□ 0.018e-14■■■■■ 66.9
DROSHAQ9NRR4 NADSYN1-204ENST00000525200 3616 ntTSL 213.35□□□□□ -0.278e-14■■■■■ 66.9
DROSHAQ9NRR4 GAK-218ENST00000511983 558 ntTSL 418.33■□□□□ 0.532e-9■■■■■ 66.8
DROSHAQ9NRR4 DGCR8-204ENST00000457069 770 ntTSL 329.09■■■□□ 2.252e-8■■■■■ 66.6
DROSHAQ9NRR4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.012e-8■■■■■ 65.9
DROSHAQ9NRR4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.662e-8■■■■■ 65.9
DROSHAQ9NRR4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC37.09■■■■□ 3.532e-8■■■■■ 65.9
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DROSHAQ9NRR4 EXT2-209ENST00000532479 580 ntTSL 429.22■■■□□ 2.272e-8■■■■■ 65.9
DROSHAQ9NRR4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.89■■□□□ 1.892e-8■■■■■ 65.9
DROSHAQ9NRR4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.562e-8■■■■■ 65.9
DROSHAQ9NRR4 PNCK-217ENST00000460106 586 ntTSL 424.56■■□□□ 1.522e-8■■■■■ 65.9
DROSHAQ9NRR4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.482e-8■■■■■ 65.9
DROSHAQ9NRR4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.312e-8■■■■■ 65.9
DROSHAQ9NRR4 PACS2-214ENST00000552138 765 ntTSL 221.7■■□□□ 1.062e-8■■■■■ 65.9
DROSHAQ9NRR4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.622e-8■■■■■ 65.9
DROSHAQ9NRR4 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.512e-8■■■■■ 65.9
DROSHAQ9NRR4 MAGEC1-201ENST00000285879 4270 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.542e-8■■■■■ 65.9
DROSHAQ9NRR4 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.54□□□□□ -2.163e-13■■■■■ 65.8
DROSHAQ9NRR4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.776e-7■■■■■ 65.8
DROSHAQ9NRR4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.466e-7■■■■■ 65.8
DROSHAQ9NRR4 HUWE1-202ENST00000262854 14739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.489e-8■■■■■ 64.9
DROSHAQ9NRR4 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.289e-8■■■■■ 64.9
DROSHAQ9NRR4 ADD2-207ENST00000425976 721 ntTSL 433.4■■■□□ 2.944e-9■■■■■ 64.8
DROSHAQ9NRR4 ADD2-211ENST00000473232 582 ntTSL 424.86■■□□□ 1.574e-9■■■■■ 64.8
DROSHAQ9NRR4 ADD2-209ENST00000447731 582 ntTSL 423.64■■□□□ 1.374e-9■■■■■ 64.8
DROSHAQ9NRR4 ADD2-213ENST00000496178 551 ntTSL 423.58■■□□□ 1.374e-9■■■■■ 64.8
DROSHAQ9NRR4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.224e-9■■■■■ 64.8
DROSHAQ9NRR4 TMEM164-207ENST00000471255 418 ntTSL 327.61■■■□□ 2.011e-6■■■■■ 64.4
DROSHAQ9NRR4 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 64.4
DROSHAQ9NRR4 SPACA6-201ENST00000571328 459 ntTSL 316.15■□□□□ 0.181e-7■■■■■ 64.4
DROSHAQ9NRR4 SPACA6-209ENST00000574072 480 ntTSL 314.6□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 64.4
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-220ENST00000489918 427 ntTSL 330.14■■■□□ 2.418e-7■■■■■ 64.2
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-203ENST00000368242 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 329.02■■■□□ 2.248e-7■■■■■ 64.2
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-221ENST00000492750 475 ntTSL 511.45□□□□□ -0.588e-7■■■■■ 64.2
DROSHAQ9NRR4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.661e-7■■■■■ 64.1
DROSHAQ9NRR4 CAMK2G-210ENST00000472912 2629 ntTSL 221.16■□□□□ 0.981e-7■■■■■ 64.1
DROSHAQ9NRR4 CAMK2G-201ENST00000305762 1820 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 64.1
DROSHAQ9NRR4 CAMK2G-202ENST00000322635 3720 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 64.1
DROSHAQ9NRR4 CAMK2G-206ENST00000394762 3767 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 64.1
DROSHAQ9NRR4 CAMK2G-203ENST00000322680 3818 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.171e-7■■■■■ 64.1
DROSHAQ9NRR4 CAMK2G-207ENST00000423381 3824 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.171e-7■■■■■ 64.1
DROSHAQ9NRR4 CAMK2G-204ENST00000351293 3563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 64.1
DROSHAQ9NRR4 CTDSP1-208ENST00000482272 984 ntTSL 220.85■□□□□ 0.937e-9■■■■■ 63.9
DROSHAQ9NRR4 ITGB2-202ENST00000320216 966 ntTSL 525.69■■□□□ 1.77e-9■■■■■ 63.8
DROSHAQ9NRR4 ITGB2-222ENST00000523323 2823 ntTSL 222.18■■□□□ 1.147e-9■■■■■ 63.8
DROSHAQ9NRR4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.027e-9■■■■■ 63.8
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