RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489918.1

C1orf61-220, Transcript of chromosome 1 open reading frame 61, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf61, Length 427 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61-220ENST00000489918 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.22■■■■■ 5.31
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C1orf61-220ENST00000489918 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.39■■■■■ 4.06
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C1orf61-220ENST00000489918 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.81■■■■□ 3.8
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C1orf61-220ENST00000489918 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.23■■■■□ 3.71
C1orf61-220ENST00000489918 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.99■■■■□ 3.67
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C1orf61-220ENST00000489918 SMARCA2P51531 1590 aa37.22■■■■□ 3.55
C1orf61-220ENST00000489918 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.21■■■■□ 3.55
C1orf61-220ENST00000489918 HMGXB3Q12766 1538 aa37.1■■■■□ 3.53
C1orf61-220ENST00000489918 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.08■■■■□ 3.53
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C1orf61-220ENST00000489918 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.35■■■■□ 3.41
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C1orf61-220ENST00000489918 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.1■■■■□ 3.37
C1orf61-220ENST00000489918 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.09■■■■□ 3.37
C1orf61-220ENST00000489918 CUX2O14529 1486 aa36.09■■■■□ 3.37
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C1orf61-220ENST00000489918 CFTRP13569 1480 aa35.96■■■■□ 3.35
C1orf61-220ENST00000489918 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.94■■■■□ 3.34
C1orf61-220ENST00000489918 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.81■■■■□ 3.32
C1orf61-220ENST00000489918 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.78■■■■□ 3.32
C1orf61-220ENST00000489918 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.77■■■■□ 3.32
C1orf61-220ENST00000489918 WDR62O43379 1518 aa35.67■■■■□ 3.3
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C1orf61-220ENST00000489918 TOPBP1Q92547 1522 aa35.23■■■■□ 3.23
C1orf61-220ENST00000489918 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.16■■■■□ 3.22
C1orf61-220ENST00000489918 ABCC8Q09428 1581 aa35.13■■■■□ 3.21
C1orf61-220ENST00000489918 IFT140Q96RY7 1462 aa35.03■■■■□ 3.2
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C1orf61-220ENST00000489918 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.81■■■■□ 3.16
C1orf61-220ENST00000489918 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.8■■■■□ 3.16
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C1orf61-220ENST00000489918 SOGA1O94964 1423 aa34.74■■■■□ 3.15
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C1orf61-220ENST00000489918 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
C1orf61-220ENST00000489918 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.56■■■■□ 3.12
C1orf61-220ENST00000489918 OSCARQ8IYS5 282 aa34.55■■■■□ 3.12
C1orf61-220ENST00000489918 SYNJ1O43426 1573 aa34.54■■■■□ 3.12
C1orf61-220ENST00000489918 WDR97A6NE52 1622 aa34.53■■■■□ 3.12
C1orf61-220ENST00000489918 TOP2BQ02880 1626 aa34.52■■■■□ 3.12
C1orf61-220ENST00000489918 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.52■■■■□ 3.12
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C1orf61-220ENST00000489918 GRIN2BQ13224 1484 aa34.35■■■■□ 3.09
C1orf61-220ENST00000489918 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.34■■■■□ 3.09
C1orf61-220ENST00000489918 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.33■■■■□ 3.09
C1orf61-220ENST00000489918 FBLN2P98095 1184 aa34.32■■■■□ 3.08
C1orf61-220ENST00000489918 PBRM1Q86U86 1689 aa34.31■■■■□ 3.08
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C1orf61-220ENST00000489918 SYNJ2O15056 1496 aa34.17■■■■□ 3.06
C1orf61-220ENST00000489918 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
C1orf61-220ENST00000489918 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.08■■■■□ 3.05
C1orf61-220ENST00000489918 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.08■■■■□ 3.05
C1orf61-220ENST00000489918 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.08■■■■□ 3.05
C1orf61-220ENST00000489918 TRIM41Q8WV44 630 aa34.05■■■■□ 3.04
C1orf61-220ENST00000489918 ARHGEF11O15085 1522 aa34.04■■■■□ 3.04
C1orf61-220ENST00000489918 ADAMTS12P58397 1594 aa34.02■■■■□ 3.04
C1orf61-220ENST00000489918 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34■■■■□ 3.03
C1orf61-220ENST00000489918 CLASP1Q7Z460 1538 aa34■■■■□ 3.03
C1orf61-220ENST00000489918 GRIN2AQ12879 1464 aa33.94■■■■□ 3.02
C1orf61-220ENST00000489918 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.93■■■■□ 3.02
C1orf61-220ENST00000489918 KIF27Q86VH2 1401 aa33.83■■■■□ 3.01
C1orf61-220ENST00000489918 CEP170Q5SW79 1584 aa33.81■■■■□ 3
C1orf61-220ENST00000489918 NUP160Q12769 1436 aa33.79■■■■□ 3
C1orf61-220ENST00000489918 ARAP1Q96P48 1450 aa33.78■■■■□ 3
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C1orf61-220ENST00000489918 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.74■■■□□ 2.99
C1orf61-220ENST00000489918 CUL7Q14999 1698 aa33.64■■■□□ 2.98
C1orf61-220ENST00000489918 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.58■■■□□ 2.97
C1orf61-220ENST00000489918 SHROOM2Q13796 1616 aa33.57■■■□□ 2.96
C1orf61-220ENST00000489918 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.56■■■□□ 2.96
C1orf61-220ENST00000489918 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.54■■■□□ 2.96
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