RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368242.7

C1orf61-203, Transcript of chromosome 1 open reading frame 61, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene C1orf61, Length 867 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61-203ENST00000368242 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.85■■■■■ 5.09
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C1orf61-203ENST00000368242 ABCC9O60706 1549 aa41.28■■■■■ 4.2
C1orf61-203ENST00000368242 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.51■■■■□ 3.92
C1orf61-203ENST00000368242 NACADO15069 1562 aa39.39■■■■□ 3.9
C1orf61-203ENST00000368242 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.08■■■■□ 3.85
C1orf61-203ENST00000368242 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39■■■■□ 3.83
C1orf61-203ENST00000368242 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.98■■■■□ 3.83
C1orf61-203ENST00000368242 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.85■■■■□ 3.81
C1orf61-203ENST00000368242 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.76■■■■□ 3.8
C1orf61-203ENST00000368242 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.53■■■■□ 3.76
C1orf61-203ENST00000368242 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.45■■■■□ 3.75
C1orf61-203ENST00000368242 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.38■■■■□ 3.73
C1orf61-203ENST00000368242 SCRIBQ14160 1630 aa38.14■■■■□ 3.7
C1orf61-203ENST00000368242 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.92■■■■□ 3.66
C1orf61-203ENST00000368242 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.44■■■■□ 3.58
C1orf61-203ENST00000368242 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.39■■■■□ 3.58
C1orf61-203ENST00000368242 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.13■■■■□ 3.53
C1orf61-203ENST00000368242 SMARCA4P51532 1647 aa36.48■■■■□ 3.43
C1orf61-203ENST00000368242 NCAPD3P42695 1498 aa36.37■■■■□ 3.41
C1orf61-203ENST00000368242 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.35■■■■□ 3.41
C1orf61-203ENST00000368242 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
C1orf61-203ENST00000368242 SMARCA2P51531 1590 aa36.21■■■■□ 3.39
C1orf61-203ENST00000368242 HMGXB3Q12766 1538 aa36.18■■■■□ 3.38
C1orf61-203ENST00000368242 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.16■■■■□ 3.38
C1orf61-203ENST00000368242 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.15■■■■□ 3.38
C1orf61-203ENST00000368242 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
C1orf61-203ENST00000368242 WIZO95785 1651 aa35.75■■■■□ 3.31
C1orf61-203ENST00000368242 NESP48681 1621 aa35.68■■■■□ 3.3
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C1orf61-203ENST00000368242 ERCC6Q03468 1493 aa35.49■■■■□ 3.27
C1orf61-203ENST00000368242 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.47■■■■□ 3.27
C1orf61-203ENST00000368242 CUX2O14529 1486 aa35.36■■■■□ 3.25
C1orf61-203ENST00000368242 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
C1orf61-203ENST00000368242 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
C1orf61-203ENST00000368242 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.29■■■■□ 3.24
C1orf61-203ENST00000368242 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.23■■■■□ 3.23
C1orf61-203ENST00000368242 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.13■■■■□ 3.21
C1orf61-203ENST00000368242 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.1■■■■□ 3.21
C1orf61-203ENST00000368242 CFTRP13569 1480 aa35■■■■□ 3.19
C1orf61-203ENST00000368242 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.89■■■■□ 3.18
C1orf61-203ENST00000368242 WDR62O43379 1518 aa34.86■■■■□ 3.17
C1orf61-203ENST00000368242 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.86■■■■□ 3.17
C1orf61-203ENST00000368242 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.85■■■■□ 3.17
C1orf61-203ENST00000368242 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.82■■■■□ 3.16
C1orf61-203ENST00000368242 PRDM2Q13029 1718 aa34.79■■■■□ 3.16
C1orf61-203ENST00000368242 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
C1orf61-203ENST00000368242 TOPBP1Q92547 1522 aa34.29■■■■□ 3.08
C1orf61-203ENST00000368242 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.21■■■■□ 3.07
C1orf61-203ENST00000368242 ABCC8Q09428 1581 aa34.13■■■■□ 3.05
C1orf61-203ENST00000368242 IFT140Q96RY7 1462 aa34.11■■■■□ 3.05
C1orf61-203ENST00000368242 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
C1orf61-203ENST00000368242 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
C1orf61-203ENST00000368242 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
C1orf61-203ENST00000368242 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.98■■■■□ 3.03
C1orf61-203ENST00000368242 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.03
C1orf61-203ENST00000368242 CUX1P39880 1505 aa33.93■■■■□ 3.02
C1orf61-203ENST00000368242 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.83■■■■□ 3.01
C1orf61-203ENST00000368242 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.82■■■■□ 3.01
C1orf61-203ENST00000368242 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.78■■■■□ 3
C1orf61-203ENST00000368242 SOGA1O94964 1423 aa33.73■■■□□ 2.99
C1orf61-203ENST00000368242 WDR97A6NE52 1622 aa33.7■■■□□ 2.99
C1orf61-203ENST00000368242 OSCARQ8IYS5 282 aa33.69■■■□□ 2.98
C1orf61-203ENST00000368242 CHD1O14646 1710 aa33.63■■■□□ 2.97
C1orf61-203ENST00000368242 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.62■■■□□ 2.97
C1orf61-203ENST00000368242 TRIM41Q8WV44 630 aa33.56■■■□□ 2.96
C1orf61-203ENST00000368242 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.54■■■□□ 2.96
C1orf61-203ENST00000368242 SYNJ1O43426 1573 aa33.52■■■□□ 2.96
C1orf61-203ENST00000368242 TOP2BQ02880 1626 aa33.5■■■□□ 2.95
C1orf61-203ENST00000368242 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.48■■■□□ 2.95
C1orf61-203ENST00000368242 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.47■■■□□ 2.95
C1orf61-203ENST00000368242 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.46■■■□□ 2.95
C1orf61-203ENST00000368242 PBRM1Q86U86 1689 aa33.44■■■□□ 2.94
C1orf61-203ENST00000368242 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.44■■■□□ 2.94
C1orf61-203ENST00000368242 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.42■■■□□ 2.94
C1orf61-203ENST00000368242 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.42■■■□□ 2.94
C1orf61-203ENST00000368242 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.42■■■□□ 2.94
C1orf61-203ENST00000368242 GRIN2BQ13224 1484 aa33.41■■■□□ 2.94
C1orf61-203ENST00000368242 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.38■■■□□ 2.93
C1orf61-203ENST00000368242 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.36■■■□□ 2.93
C1orf61-203ENST00000368242 ARHGEF11O15085 1522 aa33.33■■■□□ 2.93
C1orf61-203ENST00000368242 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.27■■■□□ 2.92
C1orf61-203ENST00000368242 SYNJ2O15056 1496 aa33.26■■■□□ 2.92
C1orf61-203ENST00000368242 FBLN2P98095 1184 aa33.24■■■□□ 2.91
C1orf61-203ENST00000368242 ADAMTS12P58397 1594 aa33.14■■■□□ 2.9
C1orf61-203ENST00000368242 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.12■■■□□ 2.89
C1orf61-203ENST00000368242 ARAP1Q96P48 1450 aa33.08■■■□□ 2.89
C1orf61-203ENST00000368242 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.05■■■□□ 2.88
C1orf61-203ENST00000368242 GRIN2AQ12879 1464 aa33.02■■■□□ 2.88
C1orf61-203ENST00000368242 CEP170Q5SW79 1584 aa32.96■■■□□ 2.87
C1orf61-203ENST00000368242 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.95■■■□□ 2.87
C1orf61-203ENST00000368242 NUP160Q12769 1436 aa32.94■■■□□ 2.86
C1orf61-203ENST00000368242 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.88■■■□□ 2.85
C1orf61-203ENST00000368242 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.81■■■□□ 2.84
C1orf61-203ENST00000368242 SHROOM2Q13796 1616 aa32.8■■■□□ 2.84
C1orf61-203ENST00000368242 IGF1RP08069 1367 aa32.72■■■□□ 2.83
C1orf61-203ENST00000368242 KIF27Q86VH2 1401 aa32.7■■■□□ 2.83
C1orf61-203ENST00000368242 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.68■■■□□ 2.82
C1orf61-203ENST00000368242 CUL7Q14999 1698 aa32.67■■■□□ 2.82
C1orf61-203ENST00000368242 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.47■■■□□ 2.79
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