Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB16Q9NRJ7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB16Q9NRJ7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB16Q9NRJ7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB16Q9NRJ7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB16Q9NRJ7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB16Q9NRJ7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB16Q9NRJ7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB16Q9NRJ7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB16Q9NRJ7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB16Q9NRJ7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB16Q9NRJ7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB16Q9NRJ7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB16Q9NRJ7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB16Q9NRJ7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB16Q9NRJ7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB16Q9NRJ7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB16Q9NRJ7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB16Q9NRJ7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB16Q9NRJ7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB16Q9NRJ7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB16Q9NRJ7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB16Q9NRJ7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB16Q9NRJ7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB16Q9NRJ7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB16Q9NRJ7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB16Q9NRJ7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB16Q9NRJ7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB16Q9NRJ7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB16Q9NRJ7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB16Q9NRJ7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB16Q9NRJ7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB16Q9NRJ7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB16Q9NRJ7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB16Q9NRJ7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB16Q9NRJ7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB16Q9NRJ7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB16Q9NRJ7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB16Q9NRJ7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB16Q9NRJ7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB16Q9NRJ7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB16Q9NRJ7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB16Q9NRJ7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB16Q9NRJ7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB16Q9NRJ7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB16Q9NRJ7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB16Q9NRJ7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB16Q9NRJ7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB16Q9NRJ7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB16Q9NRJ7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB16Q9NRJ7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB16Q9NRJ7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB16Q9NRJ7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB16Q9NRJ7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB16Q9NRJ7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB16Q9NRJ7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB16Q9NRJ7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB16Q9NRJ7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB16Q9NRJ7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB16Q9NRJ7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB16Q9NRJ7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB16Q9NRJ7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB16Q9NRJ7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB16Q9NRJ7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB16Q9NRJ7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB16Q9NRJ7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB16Q9NRJ7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB16Q9NRJ7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB16Q9NRJ7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB16Q9NRJ7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB16Q9NRJ7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB16Q9NRJ7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB16Q9NRJ7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB16Q9NRJ7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB16Q9NRJ7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB16Q9NRJ7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB16Q9NRJ7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB16Q9NRJ7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB16Q9NRJ7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHB16Q9NRJ7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHB16Q9NRJ7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHB16Q9NRJ7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHB16Q9NRJ7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHB16Q9NRJ7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHB16Q9NRJ7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHB16Q9NRJ7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHB16Q9NRJ7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHB16Q9NRJ7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHB16Q9NRJ7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHB16Q9NRJ7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHB16Q9NRJ7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHB16Q9NRJ7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHB16Q9NRJ7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB16Q9NRJ7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHB16Q9NRJ7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB16Q9NRJ7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB16Q9NRJ7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHB16Q9NRJ7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms