Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP26Q9NRE1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP26Q9NRE1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP26Q9NRE1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP26Q9NRE1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP26Q9NRE1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MMP26Q9NRE1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP26Q9NRE1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP26Q9NRE1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP26Q9NRE1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP26Q9NRE1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP26Q9NRE1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP26Q9NRE1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP26Q9NRE1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP26Q9NRE1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP26Q9NRE1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP26Q9NRE1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP26Q9NRE1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP26Q9NRE1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP26Q9NRE1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MMP26Q9NRE1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP26Q9NRE1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP26Q9NRE1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP26Q9NRE1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP26Q9NRE1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP26Q9NRE1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP26Q9NRE1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP26Q9NRE1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP26Q9NRE1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP26Q9NRE1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP26Q9NRE1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP26Q9NRE1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP26Q9NRE1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP26Q9NRE1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP26Q9NRE1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP26Q9NRE1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP26Q9NRE1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MMP26Q9NRE1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP26Q9NRE1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MMP26Q9NRE1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP26Q9NRE1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP26Q9NRE1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MMP26Q9NRE1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP26Q9NRE1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MMP26Q9NRE1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP26Q9NRE1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP26Q9NRE1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP26Q9NRE1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP26Q9NRE1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP26Q9NRE1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP26Q9NRE1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP26Q9NRE1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP26Q9NRE1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP26Q9NRE1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP26Q9NRE1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP26Q9NRE1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP26Q9NRE1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP26Q9NRE1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP26Q9NRE1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP26Q9NRE1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP26Q9NRE1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP26Q9NRE1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP26Q9NRE1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP26Q9NRE1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP26Q9NRE1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MMP26Q9NRE1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MMP26Q9NRE1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP26Q9NRE1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP26Q9NRE1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP26Q9NRE1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MMP26Q9NRE1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP26Q9NRE1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP26Q9NRE1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MMP26Q9NRE1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP26Q9NRE1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP26Q9NRE1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MMP26Q9NRE1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP26Q9NRE1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP26Q9NRE1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP26Q9NRE1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MMP26Q9NRE1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP26Q9NRE1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP26Q9NRE1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP26Q9NRE1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MMP26Q9NRE1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP26Q9NRE1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP26Q9NRE1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP26Q9NRE1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP26Q9NRE1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MMP26Q9NRE1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MMP26Q9NRE1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MMP26Q9NRE1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP26Q9NRE1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MMP26Q9NRE1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP26Q9NRE1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP26Q9NRE1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP26Q9NRE1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP26Q9NRE1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP26Q9NRE1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MMP26Q9NRE1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms