Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MMP26Q9NRE1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MMP26Q9NRE1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP26Q9NRE1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MMP26Q9NRE1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MMP26Q9NRE1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMP26Q9NRE1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMP26Q9NRE1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP26Q9NRE1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP26Q9NRE1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MMP26Q9NRE1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MMP26Q9NRE1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP26Q9NRE1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MMP26Q9NRE1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MMP26Q9NRE1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MMP26Q9NRE1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP26Q9NRE1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MMP26Q9NRE1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MMP26Q9NRE1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP26Q9NRE1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP26Q9NRE1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP26Q9NRE1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP26Q9NRE1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP26Q9NRE1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MMP26Q9NRE1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MMP26Q9NRE1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MMP26Q9NRE1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MMP26Q9NRE1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MMP26Q9NRE1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MMP26Q9NRE1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MMP26Q9NRE1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP26Q9NRE1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP26Q9NRE1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MMP26Q9NRE1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP26Q9NRE1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP26Q9NRE1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMP26Q9NRE1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MMP26Q9NRE1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMP26Q9NRE1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMP26Q9NRE1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MMP26Q9NRE1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP26Q9NRE1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MMP26Q9NRE1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MMP26Q9NRE1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP26Q9NRE1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP26Q9NRE1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP26Q9NRE1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP26Q9NRE1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP26Q9NRE1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP26Q9NRE1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP26Q9NRE1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP26Q9NRE1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP26Q9NRE1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP26Q9NRE1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP26Q9NRE1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP26Q9NRE1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP26Q9NRE1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP26Q9NRE1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP26Q9NRE1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP26Q9NRE1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP26Q9NRE1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP26Q9NRE1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP26Q9NRE1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP26Q9NRE1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP26Q9NRE1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP26Q9NRE1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP26Q9NRE1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP26Q9NRE1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP26Q9NRE1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP26Q9NRE1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP26Q9NRE1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP26Q9NRE1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MMP26Q9NRE1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MMP26Q9NRE1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MMP26Q9NRE1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MMP26Q9NRE1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP26Q9NRE1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MMP26Q9NRE1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP26Q9NRE1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP26Q9NRE1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP26Q9NRE1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP26Q9NRE1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP26Q9NRE1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMP26Q9NRE1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP26Q9NRE1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMP26Q9NRE1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP26Q9NRE1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMP26Q9NRE1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MMP26Q9NRE1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP26Q9NRE1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP26Q9NRE1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP26Q9NRE1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP26Q9NRE1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP26Q9NRE1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP26Q9NRE1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP26Q9NRE1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP26Q9NRE1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP26Q9NRE1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP26Q9NRE1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP26Q9NRE1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms