Protein–RNA interactions for Protein: Q9H714

RUBCNL, Protein RUBCNL-like, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNLQ9H714 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUBCNLQ9H714 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUBCNLQ9H714 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUBCNLQ9H714 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUBCNLQ9H714 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUBCNLQ9H714 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUBCNLQ9H714 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUBCNLQ9H714 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUBCNLQ9H714 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUBCNLQ9H714 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUBCNLQ9H714 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUBCNLQ9H714 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUBCNLQ9H714 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUBCNLQ9H714 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUBCNLQ9H714 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUBCNLQ9H714 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUBCNLQ9H714 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUBCNLQ9H714 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUBCNLQ9H714 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUBCNLQ9H714 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUBCNLQ9H714 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RUBCNLQ9H714 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUBCNLQ9H714 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUBCNLQ9H714 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUBCNLQ9H714 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUBCNLQ9H714 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUBCNLQ9H714 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUBCNLQ9H714 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUBCNLQ9H714 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUBCNLQ9H714 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUBCNLQ9H714 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUBCNLQ9H714 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUBCNLQ9H714 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUBCNLQ9H714 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUBCNLQ9H714 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUBCNLQ9H714 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUBCNLQ9H714 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUBCNLQ9H714 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUBCNLQ9H714 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUBCNLQ9H714 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUBCNLQ9H714 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RUBCNLQ9H714 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RUBCNLQ9H714 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RUBCNLQ9H714 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUBCNLQ9H714 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUBCNLQ9H714 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUBCNLQ9H714 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUBCNLQ9H714 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUBCNLQ9H714 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUBCNLQ9H714 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUBCNLQ9H714 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUBCNLQ9H714 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUBCNLQ9H714 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUBCNLQ9H714 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUBCNLQ9H714 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUBCNLQ9H714 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RUBCNLQ9H714 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUBCNLQ9H714 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUBCNLQ9H714 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUBCNLQ9H714 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUBCNLQ9H714 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RUBCNLQ9H714 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUBCNLQ9H714 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUBCNLQ9H714 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUBCNLQ9H714 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUBCNLQ9H714 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RUBCNLQ9H714 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RUBCNLQ9H714 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUBCNLQ9H714 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RUBCNLQ9H714 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RUBCNLQ9H714 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUBCNLQ9H714 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUBCNLQ9H714 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RUBCNLQ9H714 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUBCNLQ9H714 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUBCNLQ9H714 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUBCNLQ9H714 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RUBCNLQ9H714 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUBCNLQ9H714 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RUBCNLQ9H714 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUBCNLQ9H714 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RUBCNLQ9H714 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUBCNLQ9H714 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUBCNLQ9H714 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RUBCNLQ9H714 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RUBCNLQ9H714 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RUBCNLQ9H714 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RUBCNLQ9H714 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUBCNLQ9H714 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUBCNLQ9H714 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RUBCNLQ9H714 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUBCNLQ9H714 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUBCNLQ9H714 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUBCNLQ9H714 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUBCNLQ9H714 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RUBCNLQ9H714 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUBCNLQ9H714 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUBCNLQ9H714 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUBCNLQ9H714 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RUBCNLQ9H714 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms