Protein–RNA interactions for Protein: Q9H714

RUBCNL, Protein RUBCNL-like, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNLQ9H714 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RUBCNLQ9H714 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RUBCNLQ9H714 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
RUBCNLQ9H714 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RUBCNLQ9H714 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
RUBCNLQ9H714 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RUBCNLQ9H714 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RUBCNLQ9H714 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RUBCNLQ9H714 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RUBCNLQ9H714 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RUBCNLQ9H714 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RUBCNLQ9H714 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RUBCNLQ9H714 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RUBCNLQ9H714 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RUBCNLQ9H714 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RUBCNLQ9H714 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RUBCNLQ9H714 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RUBCNLQ9H714 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RUBCNLQ9H714 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RUBCNLQ9H714 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RUBCNLQ9H714 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RUBCNLQ9H714 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RUBCNLQ9H714 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RUBCNLQ9H714 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RUBCNLQ9H714 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RUBCNLQ9H714 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RUBCNLQ9H714 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RUBCNLQ9H714 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RUBCNLQ9H714 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RUBCNLQ9H714 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RUBCNLQ9H714 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RUBCNLQ9H714 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RUBCNLQ9H714 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUBCNLQ9H714 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RUBCNLQ9H714 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RUBCNLQ9H714 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RUBCNLQ9H714 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RUBCNLQ9H714 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RUBCNLQ9H714 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RUBCNLQ9H714 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RUBCNLQ9H714 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RUBCNLQ9H714 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RUBCNLQ9H714 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUBCNLQ9H714 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RUBCNLQ9H714 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RUBCNLQ9H714 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RUBCNLQ9H714 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUBCNLQ9H714 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RUBCNLQ9H714 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RUBCNLQ9H714 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUBCNLQ9H714 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RUBCNLQ9H714 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RUBCNLQ9H714 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUBCNLQ9H714 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUBCNLQ9H714 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RUBCNLQ9H714 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RUBCNLQ9H714 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUBCNLQ9H714 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUBCNLQ9H714 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUBCNLQ9H714 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RUBCNLQ9H714 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RUBCNLQ9H714 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RUBCNLQ9H714 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RUBCNLQ9H714 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RUBCNLQ9H714 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RUBCNLQ9H714 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RUBCNLQ9H714 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RUBCNLQ9H714 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RUBCNLQ9H714 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RUBCNLQ9H714 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RUBCNLQ9H714 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RUBCNLQ9H714 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RUBCNLQ9H714 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RUBCNLQ9H714 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUBCNLQ9H714 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RUBCNLQ9H714 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RUBCNLQ9H714 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RUBCNLQ9H714 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUBCNLQ9H714 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RUBCNLQ9H714 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RUBCNLQ9H714 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RUBCNLQ9H714 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RUBCNLQ9H714 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RUBCNLQ9H714 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUBCNLQ9H714 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RUBCNLQ9H714 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RUBCNLQ9H714 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUBCNLQ9H714 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RUBCNLQ9H714 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUBCNLQ9H714 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUBCNLQ9H714 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RUBCNLQ9H714 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUBCNLQ9H714 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RUBCNLQ9H714 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RUBCNLQ9H714 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RUBCNLQ9H714 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUBCNLQ9H714 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUBCNLQ9H714 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUBCNLQ9H714 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUBCNLQ9H714 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms