Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF354BQ96LW1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF354BQ96LW1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF354BQ96LW1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF354BQ96LW1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF354BQ96LW1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF354BQ96LW1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF354BQ96LW1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF354BQ96LW1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF354BQ96LW1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF354BQ96LW1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF354BQ96LW1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF354BQ96LW1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF354BQ96LW1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF354BQ96LW1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF354BQ96LW1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF354BQ96LW1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF354BQ96LW1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF354BQ96LW1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF354BQ96LW1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF354BQ96LW1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF354BQ96LW1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF354BQ96LW1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF354BQ96LW1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF354BQ96LW1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF354BQ96LW1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF354BQ96LW1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF354BQ96LW1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF354BQ96LW1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF354BQ96LW1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF354BQ96LW1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF354BQ96LW1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF354BQ96LW1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF354BQ96LW1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF354BQ96LW1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF354BQ96LW1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF354BQ96LW1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF354BQ96LW1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF354BQ96LW1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF354BQ96LW1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF354BQ96LW1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF354BQ96LW1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF354BQ96LW1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF354BQ96LW1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF354BQ96LW1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF354BQ96LW1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF354BQ96LW1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF354BQ96LW1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF354BQ96LW1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF354BQ96LW1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF354BQ96LW1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF354BQ96LW1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF354BQ96LW1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF354BQ96LW1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF354BQ96LW1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF354BQ96LW1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF354BQ96LW1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF354BQ96LW1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF354BQ96LW1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF354BQ96LW1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF354BQ96LW1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF354BQ96LW1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF354BQ96LW1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF354BQ96LW1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF354BQ96LW1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF354BQ96LW1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF354BQ96LW1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF354BQ96LW1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF354BQ96LW1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF354BQ96LW1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF354BQ96LW1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF354BQ96LW1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF354BQ96LW1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF354BQ96LW1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF354BQ96LW1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF354BQ96LW1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF354BQ96LW1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF354BQ96LW1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF354BQ96LW1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF354BQ96LW1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF354BQ96LW1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF354BQ96LW1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF354BQ96LW1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF354BQ96LW1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF354BQ96LW1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF354BQ96LW1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF354BQ96LW1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF354BQ96LW1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF354BQ96LW1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF354BQ96LW1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF354BQ96LW1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF354BQ96LW1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF354BQ96LW1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF354BQ96LW1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF354BQ96LW1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF354BQ96LW1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF354BQ96LW1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF354BQ96LW1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF354BQ96LW1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF354BQ96LW1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms