Protein–RNA interactions for Protein: Q96KH6

C18orf12, Uncharacterized protein C18orf12, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf12Q96KH6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C18orf12Q96KH6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C18orf12Q96KH6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C18orf12Q96KH6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C18orf12Q96KH6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C18orf12Q96KH6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C18orf12Q96KH6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C18orf12Q96KH6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C18orf12Q96KH6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C18orf12Q96KH6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C18orf12Q96KH6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C18orf12Q96KH6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C18orf12Q96KH6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C18orf12Q96KH6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C18orf12Q96KH6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C18orf12Q96KH6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C18orf12Q96KH6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C18orf12Q96KH6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C18orf12Q96KH6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C18orf12Q96KH6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C18orf12Q96KH6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C18orf12Q96KH6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C18orf12Q96KH6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C18orf12Q96KH6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C18orf12Q96KH6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C18orf12Q96KH6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C18orf12Q96KH6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C18orf12Q96KH6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C18orf12Q96KH6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C18orf12Q96KH6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C18orf12Q96KH6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C18orf12Q96KH6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C18orf12Q96KH6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C18orf12Q96KH6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C18orf12Q96KH6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C18orf12Q96KH6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C18orf12Q96KH6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C18orf12Q96KH6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C18orf12Q96KH6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C18orf12Q96KH6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C18orf12Q96KH6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C18orf12Q96KH6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C18orf12Q96KH6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C18orf12Q96KH6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C18orf12Q96KH6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C18orf12Q96KH6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C18orf12Q96KH6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C18orf12Q96KH6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C18orf12Q96KH6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C18orf12Q96KH6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C18orf12Q96KH6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C18orf12Q96KH6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C18orf12Q96KH6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C18orf12Q96KH6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C18orf12Q96KH6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C18orf12Q96KH6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C18orf12Q96KH6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C18orf12Q96KH6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C18orf12Q96KH6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C18orf12Q96KH6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C18orf12Q96KH6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C18orf12Q96KH6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C18orf12Q96KH6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C18orf12Q96KH6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C18orf12Q96KH6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C18orf12Q96KH6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C18orf12Q96KH6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C18orf12Q96KH6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C18orf12Q96KH6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C18orf12Q96KH6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C18orf12Q96KH6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C18orf12Q96KH6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C18orf12Q96KH6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C18orf12Q96KH6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C18orf12Q96KH6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C18orf12Q96KH6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C18orf12Q96KH6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C18orf12Q96KH6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C18orf12Q96KH6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C18orf12Q96KH6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf12Q96KH6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf12Q96KH6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf12Q96KH6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf12Q96KH6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf12Q96KH6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf12Q96KH6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf12Q96KH6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf12Q96KH6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf12Q96KH6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf12Q96KH6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C18orf12Q96KH6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C18orf12Q96KH6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C18orf12Q96KH6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C18orf12Q96KH6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C18orf12Q96KH6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C18orf12Q96KH6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C18orf12Q96KH6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
C18orf12Q96KH6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
C18orf12Q96KH6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C18orf12Q96KH6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms