Protein–RNA interactions for Protein: Q96DA2

RAB39B, Ras-related protein Rab-39B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39BQ96DA2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB39BQ96DA2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB39BQ96DA2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB39BQ96DA2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB39BQ96DA2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB39BQ96DA2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB39BQ96DA2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB39BQ96DA2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB39BQ96DA2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB39BQ96DA2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB39BQ96DA2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB39BQ96DA2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB39BQ96DA2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB39BQ96DA2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB39BQ96DA2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB39BQ96DA2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB39BQ96DA2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB39BQ96DA2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB39BQ96DA2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB39BQ96DA2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB39BQ96DA2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB39BQ96DA2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB39BQ96DA2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB39BQ96DA2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB39BQ96DA2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB39BQ96DA2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB39BQ96DA2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB39BQ96DA2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB39BQ96DA2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB39BQ96DA2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB39BQ96DA2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB39BQ96DA2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB39BQ96DA2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB39BQ96DA2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB39BQ96DA2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB39BQ96DA2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB39BQ96DA2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB39BQ96DA2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB39BQ96DA2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB39BQ96DA2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB39BQ96DA2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB39BQ96DA2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB39BQ96DA2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB39BQ96DA2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB39BQ96DA2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB39BQ96DA2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB39BQ96DA2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB39BQ96DA2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB39BQ96DA2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB39BQ96DA2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB39BQ96DA2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB39BQ96DA2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB39BQ96DA2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB39BQ96DA2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB39BQ96DA2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB39BQ96DA2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB39BQ96DA2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB39BQ96DA2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB39BQ96DA2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB39BQ96DA2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB39BQ96DA2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB39BQ96DA2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB39BQ96DA2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB39BQ96DA2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB39BQ96DA2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB39BQ96DA2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB39BQ96DA2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB39BQ96DA2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB39BQ96DA2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB39BQ96DA2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB39BQ96DA2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB39BQ96DA2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB39BQ96DA2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB39BQ96DA2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB39BQ96DA2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB39BQ96DA2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB39BQ96DA2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB39BQ96DA2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB39BQ96DA2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB39BQ96DA2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB39BQ96DA2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB39BQ96DA2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB39BQ96DA2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB39BQ96DA2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB39BQ96DA2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB39BQ96DA2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB39BQ96DA2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB39BQ96DA2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB39BQ96DA2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB39BQ96DA2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB39BQ96DA2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB39BQ96DA2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB39BQ96DA2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB39BQ96DA2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB39BQ96DA2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms