Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2S8

ARMC4, Armadillo repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC4Q5T2S8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARMC4Q5T2S8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARMC4Q5T2S8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARMC4Q5T2S8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARMC4Q5T2S8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARMC4Q5T2S8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARMC4Q5T2S8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARMC4Q5T2S8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARMC4Q5T2S8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARMC4Q5T2S8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARMC4Q5T2S8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARMC4Q5T2S8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARMC4Q5T2S8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARMC4Q5T2S8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARMC4Q5T2S8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARMC4Q5T2S8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARMC4Q5T2S8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARMC4Q5T2S8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARMC4Q5T2S8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARMC4Q5T2S8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARMC4Q5T2S8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARMC4Q5T2S8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARMC4Q5T2S8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARMC4Q5T2S8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARMC4Q5T2S8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARMC4Q5T2S8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARMC4Q5T2S8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARMC4Q5T2S8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARMC4Q5T2S8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARMC4Q5T2S8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARMC4Q5T2S8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARMC4Q5T2S8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARMC4Q5T2S8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARMC4Q5T2S8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARMC4Q5T2S8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARMC4Q5T2S8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARMC4Q5T2S8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARMC4Q5T2S8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARMC4Q5T2S8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARMC4Q5T2S8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARMC4Q5T2S8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARMC4Q5T2S8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARMC4Q5T2S8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARMC4Q5T2S8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARMC4Q5T2S8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARMC4Q5T2S8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms