Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2S8

ARMC4, Armadillo repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC4Q5T2S8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
ARMC4Q5T2S8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARMC4Q5T2S8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARMC4Q5T2S8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARMC4Q5T2S8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARMC4Q5T2S8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ARMC4Q5T2S8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARMC4Q5T2S8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARMC4Q5T2S8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARMC4Q5T2S8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARMC4Q5T2S8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARMC4Q5T2S8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARMC4Q5T2S8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARMC4Q5T2S8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARMC4Q5T2S8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARMC4Q5T2S8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARMC4Q5T2S8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARMC4Q5T2S8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARMC4Q5T2S8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARMC4Q5T2S8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARMC4Q5T2S8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARMC4Q5T2S8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARMC4Q5T2S8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARMC4Q5T2S8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARMC4Q5T2S8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARMC4Q5T2S8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARMC4Q5T2S8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARMC4Q5T2S8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARMC4Q5T2S8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARMC4Q5T2S8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARMC4Q5T2S8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARMC4Q5T2S8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARMC4Q5T2S8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARMC4Q5T2S8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARMC4Q5T2S8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARMC4Q5T2S8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARMC4Q5T2S8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARMC4Q5T2S8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ARMC4Q5T2S8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARMC4Q5T2S8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARMC4Q5T2S8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARMC4Q5T2S8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARMC4Q5T2S8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARMC4Q5T2S8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARMC4Q5T2S8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARMC4Q5T2S8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARMC4Q5T2S8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARMC4Q5T2S8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARMC4Q5T2S8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARMC4Q5T2S8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARMC4Q5T2S8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARMC4Q5T2S8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARMC4Q5T2S8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARMC4Q5T2S8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARMC4Q5T2S8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARMC4Q5T2S8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARMC4Q5T2S8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARMC4Q5T2S8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARMC4Q5T2S8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARMC4Q5T2S8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARMC4Q5T2S8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARMC4Q5T2S8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARMC4Q5T2S8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARMC4Q5T2S8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARMC4Q5T2S8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARMC4Q5T2S8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARMC4Q5T2S8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARMC4Q5T2S8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARMC4Q5T2S8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARMC4Q5T2S8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARMC4Q5T2S8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARMC4Q5T2S8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARMC4Q5T2S8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARMC4Q5T2S8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARMC4Q5T2S8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARMC4Q5T2S8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARMC4Q5T2S8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARMC4Q5T2S8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARMC4Q5T2S8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARMC4Q5T2S8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARMC4Q5T2S8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARMC4Q5T2S8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARMC4Q5T2S8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARMC4Q5T2S8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARMC4Q5T2S8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARMC4Q5T2S8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARMC4Q5T2S8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARMC4Q5T2S8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARMC4Q5T2S8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARMC4Q5T2S8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARMC4Q5T2S8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARMC4Q5T2S8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARMC4Q5T2S8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ARMC4Q5T2S8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARMC4Q5T2S8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARMC4Q5T2S8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARMC4Q5T2S8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARMC4Q5T2S8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARMC4Q5T2S8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARMC4Q5T2S8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms