Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL9A2Q14055 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL9A2Q14055 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL9A2Q14055 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL9A2Q14055 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
COL9A2Q14055 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
COL9A2Q14055 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL9A2Q14055 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL9A2Q14055 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL9A2Q14055 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL9A2Q14055 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL9A2Q14055 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL9A2Q14055 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL9A2Q14055 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL9A2Q14055 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL9A2Q14055 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL9A2Q14055 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL9A2Q14055 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL9A2Q14055 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL9A2Q14055 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL9A2Q14055 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL9A2Q14055 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL9A2Q14055 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL9A2Q14055 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL9A2Q14055 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL9A2Q14055 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
COL9A2Q14055 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL9A2Q14055 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL9A2Q14055 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL9A2Q14055 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
COL9A2Q14055 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL9A2Q14055 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL9A2Q14055 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL9A2Q14055 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL9A2Q14055 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL9A2Q14055 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL9A2Q14055 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL9A2Q14055 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL9A2Q14055 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL9A2Q14055 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL9A2Q14055 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL9A2Q14055 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL9A2Q14055 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL9A2Q14055 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
COL9A2Q14055 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL9A2Q14055 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL9A2Q14055 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL9A2Q14055 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL9A2Q14055 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL9A2Q14055 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL9A2Q14055 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL9A2Q14055 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL9A2Q14055 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL9A2Q14055 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL9A2Q14055 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL9A2Q14055 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
COL9A2Q14055 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL9A2Q14055 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL9A2Q14055 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL9A2Q14055 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL9A2Q14055 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL9A2Q14055 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL9A2Q14055 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL9A2Q14055 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL9A2Q14055 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL9A2Q14055 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL9A2Q14055 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
COL9A2Q14055 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL9A2Q14055 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL9A2Q14055 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL9A2Q14055 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL9A2Q14055 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL9A2Q14055 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL9A2Q14055 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL9A2Q14055 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
COL9A2Q14055 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
COL9A2Q14055 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL9A2Q14055 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL9A2Q14055 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL9A2Q14055 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL9A2Q14055 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL9A2Q14055 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL9A2Q14055 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL9A2Q14055 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL9A2Q14055 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL9A2Q14055 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL9A2Q14055 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL9A2Q14055 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL9A2Q14055 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL9A2Q14055 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL9A2Q14055 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL9A2Q14055 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
COL9A2Q14055 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL9A2Q14055 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL9A2Q14055 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
COL9A2Q14055 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL9A2Q14055 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL9A2Q14055 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL9A2Q14055 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL9A2Q14055 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
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