Protein–RNA interactions for Protein: P62280

RPS11, 40S ribosomal protein S11, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS11P62280 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.095e-6■□□□□ 9.6
RPS11P62280 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.113e-13■□□□□ 9.6
RPS11P62280 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.133e-13■□□□□ 9.6
RPS11P62280 MICALL2-206ENST00000470807 668 ntTSL 314.03□□□□□ -0.161e-7■□□□□ 9.6
RPS11P62280 PRSS21-203ENST00000570594 809 ntTSL 313.95□□□□□ -0.185e-6■□□□□ 9.6
RPS11P62280 FUS-213ENST00000570090 544 ntTSL 213.9□□□□□ -0.182e-8■□□□□ 9.6
RPS11P62280 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.275e-6■□□□□ 9.6
RPS11P62280 MICALL2-207ENST00000471899 899 ntTSL 212.67□□□□□ -0.381e-7■□□□□ 9.6
RPS11P62280 MICALL2-202ENST00000413446 3046 ntTSL 212.41□□□□□ -0.421e-7■□□□□ 9.6
RPS11P62280 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.517e-7■□□□□ 9.6
RPS11P62280 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.527e-7■□□□□ 9.6
RPS11P62280 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.635e-6■□□□□ 9.6
RPS11P62280 SLC6A8-207ENST00000466243 544 ntTSL 211.06□□□□□ -0.643e-13■□□□□ 9.6
RPS11P62280 MICALL2-214ENST00000493998 404 ntTSL 210.26□□□□□ -0.771e-7■□□□□ 9.6
RPS11P62280 PRSS21-204ENST00000570629 626 ntTSL 210.19□□□□□ -0.785e-6■□□□□ 9.6
RPS11P62280 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.87e-7■□□□□ 9.6
RPS11P62280 RPL38-206ENST00000533498 532 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.887e-7■□□□□ 9.6
RPS11P62280 SYNCRIP-203ENST00000444272 610 ntTSL 39.36□□□□□ -0.915e-6■□□□□ 9.6
RPS11P62280 RPL38-201ENST00000311111 1170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.027e-7■□□□□ 9.6
RPS11P62280 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.797e-7■□□□□ 9.6
RPS11P62280 OAZ1-210ENST00000593012 1357 ntTSL 216.3■□□□□ 0.22e-6■□□□□ 9.5
RPS11P62280 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.142e-6■□□□□ 9.5
RPS11P62280 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.042e-6■□□□□ 9.5
RPS11P62280 OAZ1-201ENST00000581150 1131 ntTSL 514.29□□□□□ -0.122e-6■□□□□ 9.5
RPS11P62280 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.162e-6■□□□□ 9.5
RPS11P62280 OAZ1-209ENST00000592787 857 ntTSL 213.82□□□□□ -0.22e-6■□□□□ 9.5
RPS11P62280 OAZ1-207ENST00000590943 1012 ntTSL 213.44□□□□□ -0.262e-6■□□□□ 9.5
RPS11P62280 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.461e-323■□□□□ 9.4
RPS11P62280 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.333e-11■□□□□ 9.1
RPS11P62280 SNHG22-202ENST00000615535 421 nt11.11□□□□□ -0.633e-11■□□□□ 9.1
RPS11P62280 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1□□□□□ -2.573e-11■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.11e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.041e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-215ENST00000531558 565 ntTSL 521.33■■□□□ 1.011e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-218ENST00000532041 699 ntTSL 318.33■□□□□ 0.521e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.031e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.081e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-210ENST00000528411 586 ntTSL 512.18□□□□□ -0.461e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-201ENST00000356360 1958 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.351e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-203ENST00000525162 548 ntTSL 46.32□□□□□ -1.41e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-223ENST00000534412 811 ntTSL 54.42□□□□□ -1.71e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-208ENST00000528256 563 ntTSL 43.96□□□□□ -1.781e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-217ENST00000531930 703 ntTSL 52.52□□□□□ -2.011e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.151e-15■□□□□ 9.1
RPS11P62280 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.417e-8■□□□□ 9.1
RPS11P62280 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.287e-8■□□□□ 9.1
RPS11P62280 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.227e-8■□□□□ 9.1
RPS11P62280 TMC6-224ENST00000593044 3070 ntTSL 214.62□□□□□ -0.077e-8■□□□□ 9.1
RPS11P62280 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.257e-8■□□□□ 9.1
RPS11P62280 TMC6-222ENST00000592076 693 ntTSL 313.21□□□□□ -0.297e-8■□□□□ 9.1
RPS11P62280 TMC6-215ENST00000590494 702 ntTSL 29.81□□□□□ -0.847e-8■□□□□ 9.1
RPS11P62280 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.657e-8■□□□□ 9.1
RPS11P62280 ACTB-211ENST00000480301 657 ntTSL 1 (best)17.24■□□□□ 0.351e-9■□□□□ 9
RPS11P62280 ACTB-210ENST00000477812 820 ntTSL 216.96■□□□□ 0.311e-9■□□□□ 9
RPS11P62280 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.161e-9■□□□□ 9
RPS11P62280 ACTB-212ENST00000484841 1032 ntTSL 515.89■□□□□ 0.131e-9■□□□□ 9
RPS11P62280 ACTB-207ENST00000462494 2245 ntTSL 515.51■□□□□ 0.071e-9■□□□□ 9
RPS11P62280 ACTB-204ENST00000425660 1845 ntTSL 1 (best)13.52□□□□□ -0.251e-9■□□□□ 9
RPS11P62280 ACTB-206ENST00000443528 569 ntTSL 412.98□□□□□ -0.331e-9■□□□□ 9
RPS11P62280 ACTB-205ENST00000432588 568 ntTSL 412.69□□□□□ -0.381e-9■□□□□ 9
RPS11P62280 ACTB-202ENST00000414620 561 ntTSL 412.31□□□□□ -0.441e-9■□□□□ 9
RPS11P62280 ACTB-209ENST00000473257 556 ntTSL 38.66□□□□□ -1.021e-9■□□□□ 9
RPS11P62280 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.373e-6■□□□□ 8.9
RPS11P62280 TALDO1-206ENST00000530666 587 ntTSL 211.49□□□□□ -0.573e-6■□□□□ 8.9
RPS11P62280 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.693e-6■□□□□ 8.9
RPS11P62280 PGK1-201ENST00000373316 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.933e-6■□□□□ 8.9
RPS11P62280 TALDO1-207ENST00000532202 270 ntTSL 38.38□□□□□ -1.073e-6■□□□□ 8.9
RPS11P62280 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.346e-8■□□□□ 8.8
RPS11P62280 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.366e-8■□□□□ 8.8
RPS11P62280 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.566e-8■□□□□ 8.8
RPS11P62280 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.178e-6■□□□□ 8.7
RPS11P62280 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.038e-6■□□□□ 8.7
RPS11P62280 UBAC1-204ENST00000478485 773 ntTSL 219.82■□□□□ 0.768e-6■□□□□ 8.7
RPS11P62280 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.548e-6■□□□□ 8.7
RPS11P62280 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.288e-6■□□□□ 8.7
RPS11P62280 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.198e-6■□□□□ 8.7
RPS11P62280 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.018e-6■□□□□ 8.7
RPS11P62280 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.158e-6■□□□□ 8.7
RPS11P62280 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.178e-6■□□□□ 8.7
RPS11P62280 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.198e-6■□□□□ 8.7
RPS11P62280 UBAC1-203ENST00000471163 838 ntTSL 313.18□□□□□ -0.38e-6■□□□□ 8.7
RPS11P62280 NFE2-205ENST00000553198 1208 ntTSL 513.09□□□□□ -0.318e-6■□□□□ 8.7
RPS11P62280 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.418e-6■□□□□ 8.7
RPS11P62280 ALAS2-208ENST00000498636 959 ntTSL 311.22□□□□□ -0.618e-6■□□□□ 8.7
RPS11P62280 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.374e-8■□□□□ 8.6
RPS11P62280 SRRM2-218ENST00000574331 1759 ntTSL 215.81■□□□□ 0.124e-8■□□□□ 8.6
RPS11P62280 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.024e-8■□□□□ 8.6
RPS11P62280 SRRM2-217ENST00000573692 459 ntTSL 314.84□□□□□ -0.034e-8■□□□□ 8.6
RPS11P62280 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.384e-8■□□□□ 8.6
RPS11P62280 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.674e-8■□□□□ 8.6
RPS11P62280 IFITM2-201ENST00000399815 382 ntTSL 310.84□□□□□ -0.674e-8■□□□□ 8.6
RPS11P62280 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.674e-8■□□□□ 8.6
RPS11P62280 SRRM2-202ENST00000570539 431 ntTSL 28.04□□□□□ -1.124e-8■□□□□ 8.6
RPS11P62280 HIST1H3H-201ENST00000369163 1237 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.672e-7■□□□□ 8.6
RPS11P62280 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.713e-7■□□□□ 8.5
RPS11P62280 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.013e-7■□□□□ 8.5
RPS11P62280 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.013e-7■□□□□ 8.5
RPS11P62280 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.243e-7■□□□□ 8.5
RPS11P62280 PYCR2-206ENST00000478402 3149 ntTSL 213.24□□□□□ -0.293e-7■□□□□ 8.5
RPS11P62280 PSMB1-201ENST00000262193 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.933e-7■□□□□ 8.5
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