Protein–RNA interactions for Protein: P62280

RPS11, 40S ribosomal protein S11, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS11P62280 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)18.98■□□□□ 0.638e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 216.77■□□□□ 0.288e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 216.09■□□□□ 0.178e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.128e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.198e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.628e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.888e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 37.63□□□□□ -1.198e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 57.63□□□□□ -1.198e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 37.22□□□□□ -1.258e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 42.27□□□□□ -2.058e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 51.43□□□□□ -2.188e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 51.23□□□□□ -2.218e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.46□□□□□ -2.348e-17■■■■■ 578.9
RPS11P62280 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.651e-323■■■■■ 440.9
RPS11P62280 ANKRD30BL-204ENST00000470729 1425 ntTSL 1 (best)15.17■□□□□ 0.025e-8■■■■■ 129.3
RPS11P62280 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.656e-9■■■■■ 113.4
RPS11P62280 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)16.74■□□□□ 0.271e-26■■■■■ 104.6
RPS11P62280 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.841e-26■■■■■ 104.6
RPS11P62280 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.491e-8■■■■■ 96.8
RPS11P62280 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.531e-8■■■■■ 96.8
RPS11P62280 PID1-206ENST00000534952 553 ntTSL 411.68□□□□□ -0.541e-8■■■■■ 96.8
RPS11P62280 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.561e-8■■■■■ 96.8
RPS11P62280 PID1-201ENST00000354069 839 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.331e-8■■■■■ 96.8
RPS11P62280 PID1-205ENST00000482518 479 ntTSL 24.1□□□□□ -1.751e-8■■■■■ 96.8
RPS11P62280 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.441e-12■■■■■ 95
RPS11P62280 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC11.57□□□□□ -0.561e-35■■■■■ 95
RPS11P62280 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt9.55□□□□□ -0.881e-35■■■■■ 95
RPS11P62280 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt9.47□□□□□ -0.891e-35■■■■■ 95
RPS11P62280 CDC14B-209ENST00000474602 4960 ntTSL 1 (best)18.5■□□□□ 0.557e-11■■■■■ 82.3
RPS11P62280 HOXC10-205ENST00000515593 526 ntTSL 47.32□□□□□ -1.242e-12■■■■■ 81.6
RPS11P62280 EIF2AK2-203ENST00000395127 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.847e-20■■■■■ 74.8
RPS11P62280 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.737e-20■■■■■ 74.8
RPS11P62280 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.137e-20■■■■■ 74.8
RPS11P62280 NHSL2-205ENST00000631833 452 ntTSL 512.01□□□□□ -0.493e-9■■■■■ 69.7
RPS11P62280 AGO2-205ENST00000519980 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.563e-9■■■■■ 69.7
RPS11P62280 AGO2-209ENST00000523609 3050 ntTSL 1 (best)10.7□□□□□ -0.73e-9■■■■■ 69.7
RPS11P62280 NHSL2-207ENST00000633930 13660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.093e-9■■■■■ 69.7
RPS11P62280 LINC01830-201ENST00000450551 636 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.373e-9■■■■■ 69.7
RPS11P62280 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.63e-9■■■■■ 69.7
RPS11P62280 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 68.3
RPS11P62280 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.622e-8■■■■■ 63.3
RPS11P62280 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.222e-8■■■■■ 63.3
RPS11P62280 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.142e-8■■■■■ 63.3
RPS11P62280 KCNQ1-205ENST00000496887 582 ntTSL 513.82□□□□□ -0.22e-8■■■■■ 63.3
RPS11P62280 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.016e-7■■■■■ 59.6
RPS11P62280 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.248e-9■■■■■ 57.6
RPS11P62280 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.051e-7■■■■■ 57
RPS11P62280 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.281e-7■■■■■ 57
RPS11P62280 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 57
RPS11P62280 ZFP64-212ENST00000477786 909 ntTSL 511.41□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 57
RPS11P62280 ZFP64-202ENST00000346617 2876 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.681e-7■■■■■ 57
RPS11P62280 ZFP64-204ENST00000371515 3040 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.811e-7■■■■■ 57
RPS11P62280 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.521e-7■■■■■ 57
RPS11P62280 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.641e-7■■■■■ 57
RPS11P62280 AL162726.3-217ENST00000590791 662 ntTSL 53.96□□□□□ -1.781e-7■■■■■ 57
RPS11P62280 AL162726.3-212ENST00000591257 662 ntTSL 53.73□□□□□ -1.811e-7■■■■■ 57
RPS11P62280 AL162726.3-213ENST00000590298 552 ntTSL 52.34□□□□□ -2.031e-7■■■■■ 57
RPS11P62280 AL162726.3-219ENST00000589973 651 ntTSL 52.33□□□□□ -2.041e-7■■■■■ 57
RPS11P62280 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.13e-19■■■■■ 52.8
RPS11P62280 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.683e-19■■■■■ 52.8
RPS11P62280 FAM238C-203ENST00000640121 3620 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.873e-19■■■■■ 52.8
RPS11P62280 FAM238C-201ENST00000638416 868 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.013e-19■■■■■ 52.8
RPS11P62280 FAM238C-205ENST00000640641 391 ntBASIC7.25□□□□□ -1.253e-19■■■■■ 52.8
RPS11P62280 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.699e-7■■■■■ 50.7
RPS11P62280 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.59e-7■■■■■ 50.7
RPS11P62280 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.389e-7■■■■■ 50.7
RPS11P62280 TESC-208ENST00000552139 307 ntTSL 216.99■□□□□ 0.319e-7■■■■■ 50.7
RPS11P62280 TESC-203ENST00000470612 1057 ntTSL 216.95■□□□□ 0.39e-7■■■■■ 50.7
RPS11P62280 TESC-202ENST00000462502 854 ntTSL 516.57■□□□□ 0.249e-7■■■■■ 50.7
RPS11P62280 TESC-204ENST00000482176 841 ntTSL 315.43■□□□□ 0.069e-7■■■■■ 50.7
RPS11P62280 CHST12-203ENST00000432336 921 ntTSL 211.74□□□□□ -0.539e-7■■■■■ 50.7
RPS11P62280 CBR3-AS1-214ENST00000624080 822 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.949e-7■■■■■ 50.7
RPS11P62280 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.399e-7■■■■■ 50.7
RPS11P62280 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.522e-7■■■■■ 48
RPS11P62280 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 46.6
RPS11P62280 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.313e-6■■■■■ 46.6
RPS11P62280 CUX1-202ENST00000292538 2930 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.756e-6■■■■■ 44.3
RPS11P62280 CUX1-204ENST00000393824 2331 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.796e-6■■■■■ 44.3
RPS11P62280 CUX1-210ENST00000497815 947 ntTSL 210.09□□□□□ -0.796e-6■■■■■ 44.3
RPS11P62280 CUX1-212ENST00000547394 2878 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.86e-6■■■■■ 44.3
RPS11P62280 CUX1-205ENST00000425244 2776 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.856e-6■■■■■ 44.3
RPS11P62280 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.876e-6■■■■■ 44.3
RPS11P62280 RYR2-202ENST00000366574 16562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.936e-6■■■■■ 44.3
RPS11P62280 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.036e-6■■■■■ 44.3
RPS11P62280 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.086e-6■■■■■ 44.3
RPS11P62280 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.546e-6■■■■■ 44.3
RPS11P62280 CUX1-220ENST00000607092 559 ntTSL 34.76□□□□□ -1.656e-6■■■■■ 44.3
RPS11P62280 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 43.2
RPS11P62280 NPAS2-204ENST00000448812 774 ntTSL 58.42□□□□□ -1.061e-6■■■■■ 43.2
RPS11P62280 NPAS2-202ENST00000427413 625 ntTSL 36.15□□□□□ -1.421e-6■■■■■ 43.2
RPS11P62280 NPAS2-209ENST00000486017 764 ntTSL 34.88□□□□□ -1.631e-6■■■■■ 43.2
RPS11P62280 NPAS2-211ENST00000492373 552 ntTSL 43.52□□□□□ -1.851e-6■■■■■ 43.2
RPS11P62280 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.166e-6■■■■■ 42.4
RPS11P62280 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.316e-6■■■■■ 42.4
RPS11P62280 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.376e-6■■■■■ 42.4
RPS11P62280 SLC29A4-205ENST00000439491 805 ntTSL 311.92□□□□□ -0.56e-6■■■■■ 42.4
RPS11P62280 C19orf60-206ENST00000598375 1792 ntTSL 520.13■□□□□ 0.816e-6■■■■■ 38.4
RPS11P62280 C19orf60-207ENST00000600997 2275 ntTSL 218.95■□□□□ 0.626e-6■■■■■ 38.4
RPS11P62280 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.546e-6■■■■■ 38.4
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