RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540264.2

NFE2-203, Transcript of nuclear factor, erythroid 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NFE2, Length 1,833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2-203ENST00000540264 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.09■■■■□ 3.21
NFE2-203ENST00000540264 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.44■■■□□ 2.46
NFE2-203ENST00000540264 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
NFE2-203ENST00000540264 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.05■■■□□ 2.24
NFE2-203ENST00000540264 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.83■■■□□ 2.21
NFE2-203ENST00000540264 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.76■■■□□ 2.19
NFE2-203ENST00000540264 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.62■■■□□ 2.17
NFE2-203ENST00000540264 ABCC9O60706 1549 aa28.52■■■□□ 2.16
NFE2-203ENST00000540264 NACADO15069 1562 aa28.32■■■□□ 2.12
NFE2-203ENST00000540264 SCRIBQ14160 1630 aa28.01■■■□□ 2.07
NFE2-203ENST00000540264 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.98■■■□□ 2.07
NFE2-203ENST00000540264 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
NFE2-203ENST00000540264 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.39■■□□□ 1.98
NFE2-203ENST00000540264 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
NFE2-203ENST00000540264 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.23■■□□□ 1.95
NFE2-203ENST00000540264 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.15■■□□□ 1.94
NFE2-203ENST00000540264 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.11■■□□□ 1.93
NFE2-203ENST00000540264 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
NFE2-203ENST00000540264 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.96■■□□□ 1.91
NFE2-203ENST00000540264 SMARCA4P51532 1647 aa26.89■■□□□ 1.9
NFE2-203ENST00000540264 WIZO95785 1651 aa26.88■■□□□ 1.89
NFE2-203ENST00000540264 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.83■■□□□ 1.89
NFE2-203ENST00000540264 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
NFE2-203ENST00000540264 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.59■■□□□ 1.85
NFE2-203ENST00000540264 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.41■■□□□ 1.82
NFE2-203ENST00000540264 SMARCA2P51531 1590 aa26.39■■□□□ 1.81
NFE2-203ENST00000540264 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.38■■□□□ 1.81
NFE2-203ENST00000540264 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
NFE2-203ENST00000540264 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
NFE2-203ENST00000540264 TRIM41Q8WV44 630 aa26.18■■□□□ 1.78
NFE2-203ENST00000540264 NCAPD3P42695 1498 aa26.15■■□□□ 1.78
NFE2-203ENST00000540264 HMGXB3Q12766 1538 aa26.12■■□□□ 1.77
NFE2-203ENST00000540264 ABCC8Q09428 1581 aa25.87■■□□□ 1.73
NFE2-203ENST00000540264 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.83■■□□□ 1.73
NFE2-203ENST00000540264 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.79■■□□□ 1.72
NFE2-203ENST00000540264 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.71
NFE2-203ENST00000540264 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
NFE2-203ENST00000540264 CFTRP13569 1480 aa25.64■■□□□ 1.7
NFE2-203ENST00000540264 SYNJ1O43426 1573 aa25.57■■□□□ 1.68
NFE2-203ENST00000540264 EEA1Q15075 1411 aa25.52■■□□□ 1.68
NFE2-203ENST00000540264 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.49■■□□□ 1.67
NFE2-203ENST00000540264 SOGA1O94964 1423 aa25.47■■□□□ 1.67
NFE2-203ENST00000540264 TOP2BQ02880 1626 aa25.47■■□□□ 1.67
NFE2-203ENST00000540264 PRDM2Q13029 1718 aa25.46■■□□□ 1.67
NFE2-203ENST00000540264 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.43■■□□□ 1.66
NFE2-203ENST00000540264 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.36■■□□□ 1.65
NFE2-203ENST00000540264 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.34■■□□□ 1.65
NFE2-203ENST00000540264 CUX1P39880 1505 aa25.33■■□□□ 1.65
NFE2-203ENST00000540264 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.24■■□□□ 1.63
NFE2-203ENST00000540264 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.19■■□□□ 1.62
NFE2-203ENST00000540264 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.18■■□□□ 1.62
NFE2-203ENST00000540264 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.15■■□□□ 1.62
NFE2-203ENST00000540264 GOLGA3Q08378 1498 aa25.15■■□□□ 1.62
NFE2-203ENST00000540264 KIF21BO75037 1637 aa25.14■■□□□ 1.62
NFE2-203ENST00000540264 NESP48681 1621 aa25.13■■□□□ 1.61
NFE2-203ENST00000540264 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.13■■□□□ 1.61
NFE2-203ENST00000540264 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.09■■□□□ 1.61
NFE2-203ENST00000540264 KIF27Q86VH2 1401 aa25.04■■□□□ 1.6
NFE2-203ENST00000540264 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.01■■□□□ 1.59
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NFE2-203ENST00000540264 CEP162Q5TB80 1403 aa25■■□□□ 1.59
NFE2-203ENST00000540264 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25■■□□□ 1.59
NFE2-203ENST00000540264 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25■■□□□ 1.59
NFE2-203ENST00000540264 PRXQ9BXM0 1461 aa24.97■■□□□ 1.59
NFE2-203ENST00000540264 TOPBP1Q92547 1522 aa24.95■■□□□ 1.59
NFE2-203ENST00000540264 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.94■■□□□ 1.58
NFE2-203ENST00000540264 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.94■■□□□ 1.58
NFE2-203ENST00000540264 CUX2O14529 1486 aa24.89■■□□□ 1.58
NFE2-203ENST00000540264 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.89■■□□□ 1.58
NFE2-203ENST00000540264 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
NFE2-203ENST00000540264 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
NFE2-203ENST00000540264 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
NFE2-203ENST00000540264 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.81■■□□□ 1.56
NFE2-203ENST00000540264 IGF1RP08069 1367 aa24.81■■□□□ 1.56
NFE2-203ENST00000540264 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.8■■□□□ 1.56
NFE2-203ENST00000540264 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.76■■□□□ 1.55
NFE2-203ENST00000540264 CLIP1P30622 1438 aa24.75■■□□□ 1.55
NFE2-203ENST00000540264 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.68■■□□□ 1.54
NFE2-203ENST00000540264 WDR97A6NE52 1622 aa24.67■■□□□ 1.54
NFE2-203ENST00000540264 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.64■■□□□ 1.53
NFE2-203ENST00000540264 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.59■■□□□ 1.53
NFE2-203ENST00000540264 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.57■■□□□ 1.52
NFE2-203ENST00000540264 CUL7Q14999 1698 aa24.56■■□□□ 1.52
NFE2-203ENST00000540264 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
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NFE2-203ENST00000540264 WDR62O43379 1518 aa24.51■■□□□ 1.51
NFE2-203ENST00000540264 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.51■■□□□ 1.51
NFE2-203ENST00000540264 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
NFE2-203ENST00000540264 ARAP1Q96P48 1450 aa24.48■■□□□ 1.51
NFE2-203ENST00000540264 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
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NFE2-203ENST00000540264 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.43■■□□□ 1.5
NFE2-203ENST00000540264 ERCC6Q03468 1493 aa24.42■■□□□ 1.5
NFE2-203ENST00000540264 IFT140Q96RY7 1462 aa24.4■■□□□ 1.5
NFE2-203ENST00000540264 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
NFE2-203ENST00000540264 APLP2Q06481 763 aa24.33■■□□□ 1.48
NFE2-203ENST00000540264 PBRM1Q86U86 1689 aa24.31■■□□□ 1.48
NFE2-203ENST00000540264 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.489e-8■■■■■ 45.8
NFE2-203ENST00000540264 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.29■■□□□ 1.48
NFE2-203ENST00000540264 GRIN2BQ13224 1484 aa24.28■■□□□ 1.48
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