Protein–RNA interactions for Protein: P24386

CHM, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP24386 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP24386 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP24386 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP24386 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP24386 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP24386 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHMP24386 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP24386 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHMP24386 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHMP24386 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP24386 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP24386 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP24386 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHMP24386 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHMP24386 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP24386 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP24386 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP24386 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP24386 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP24386 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP24386 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP24386 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP24386 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP24386 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP24386 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP24386 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP24386 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP24386 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP24386 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP24386 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP24386 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP24386 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP24386 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHMP24386 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHMP24386 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP24386 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP24386 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP24386 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP24386 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP24386 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP24386 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP24386 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP24386 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP24386 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP24386 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP24386 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP24386 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP24386 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP24386 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP24386 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP24386 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP24386 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP24386 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP24386 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP24386 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP24386 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP24386 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP24386 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP24386 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP24386 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP24386 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP24386 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP24386 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP24386 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP24386 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP24386 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP24386 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP24386 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP24386 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP24386 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP24386 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP24386 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP24386 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP24386 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP24386 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP24386 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP24386 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP24386 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP24386 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHMP24386 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP24386 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP24386 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP24386 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP24386 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP24386 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP24386 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP24386 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP24386 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP24386 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP24386 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP24386 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP24386 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP24386 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHMP24386 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHMP24386 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHMP24386 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHMP24386 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP24386 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP24386 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP24386 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms