Protein–RNA interactions for Protein: A6NLX3

SPDYE4, Speedy protein E4, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE4A6NLX3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SPDYE4A6NLX3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SPDYE4A6NLX3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SPDYE4A6NLX3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SPDYE4A6NLX3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SPDYE4A6NLX3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SPDYE4A6NLX3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SPDYE4A6NLX3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SPDYE4A6NLX3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPDYE4A6NLX3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPDYE4A6NLX3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPDYE4A6NLX3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SPDYE4A6NLX3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SPDYE4A6NLX3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SPDYE4A6NLX3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPDYE4A6NLX3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SPDYE4A6NLX3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPDYE4A6NLX3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPDYE4A6NLX3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPDYE4A6NLX3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPDYE4A6NLX3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPDYE4A6NLX3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPDYE4A6NLX3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPDYE4A6NLX3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPDYE4A6NLX3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPDYE4A6NLX3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPDYE4A6NLX3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPDYE4A6NLX3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPDYE4A6NLX3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPDYE4A6NLX3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPDYE4A6NLX3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPDYE4A6NLX3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPDYE4A6NLX3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPDYE4A6NLX3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPDYE4A6NLX3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPDYE4A6NLX3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPDYE4A6NLX3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPDYE4A6NLX3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPDYE4A6NLX3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPDYE4A6NLX3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SPDYE4A6NLX3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPDYE4A6NLX3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPDYE4A6NLX3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPDYE4A6NLX3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SPDYE4A6NLX3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPDYE4A6NLX3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPDYE4A6NLX3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SPDYE4A6NLX3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SPDYE4A6NLX3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SPDYE4A6NLX3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPDYE4A6NLX3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SPDYE4A6NLX3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPDYE4A6NLX3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SPDYE4A6NLX3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPDYE4A6NLX3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPDYE4A6NLX3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPDYE4A6NLX3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPDYE4A6NLX3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPDYE4A6NLX3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPDYE4A6NLX3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPDYE4A6NLX3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SPDYE4A6NLX3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPDYE4A6NLX3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPDYE4A6NLX3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPDYE4A6NLX3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPDYE4A6NLX3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPDYE4A6NLX3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SPDYE4A6NLX3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SPDYE4A6NLX3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPDYE4A6NLX3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPDYE4A6NLX3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPDYE4A6NLX3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPDYE4A6NLX3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPDYE4A6NLX3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SPDYE4A6NLX3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SPDYE4A6NLX3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SPDYE4A6NLX3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SPDYE4A6NLX3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPDYE4A6NLX3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPDYE4A6NLX3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPDYE4A6NLX3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPDYE4A6NLX3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPDYE4A6NLX3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPDYE4A6NLX3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPDYE4A6NLX3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPDYE4A6NLX3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPDYE4A6NLX3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPDYE4A6NLX3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPDYE4A6NLX3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPDYE4A6NLX3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.24
SPDYE4A6NLX3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPDYE4A6NLX3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPDYE4A6NLX3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPDYE4A6NLX3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPDYE4A6NLX3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPDYE4A6NLX3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPDYE4A6NLX3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPDYE4A6NLX3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPDYE4A6NLX3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPDYE4A6NLX3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.3 ms