Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 SCAMP2-209ENST00000567638 678 ntTSL 215.93■□□□□ 0.148e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.028e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.018e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 PYCR2-205ENST00000472798 422 ntTSL 214.81□□□□□ -0.048e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 C7orf73-201ENST00000422968 2004 ntTSL 1 (best)14.76□□□□□ -0.058e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 ERCC2-208ENST00000586737 481 ntTSL 513.72□□□□□ -0.218e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 SCAMP2-211ENST00000569251 867 ntTSL 213.64□□□□□ -0.238e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 CALM3-205ENST00000486500 2536 ntTSL 213.56□□□□□ -0.242e-10■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 WDSUB1-204ENST00000409124 1600 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.258e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 TIMM23-201ENST00000580018 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.298e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 CALM3-206ENST00000594523 540 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.312e-10■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 ERCC2-207ENST00000586441 682 ntTSL 512.99□□□□□ -0.338e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 NSD2-222ENST00000512700 1095 ntTSL 512.69□□□□□ -0.388e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 CALM3-203ENST00000477244 696 ntTSL 312.29□□□□□ -0.442e-10■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 CALM3-207ENST00000595072 721 ntTSL 212.14□□□□□ -0.472e-10■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 CCT3-212ENST00000478640 583 ntTSL 212.07□□□□□ -0.488e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 EIF4EBP1-202ENST00000520657 695 ntTSL 312.03□□□□□ -0.488e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF160-211ENST00000599729 778 ntTSL 311.94□□□□□ -0.58e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 CALM3-210ENST00000597868 927 ntTSL 311.57□□□□□ -0.562e-10■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 CCT3-202ENST00000368256 1063 ntTSL 310.64□□□□□ -0.718e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 ZRANB2-203ENST00000473260 482 ntTSL 210.39□□□□□ -0.758e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 FDPS-214ENST00000489324 475 ntTSL 210.39□□□□□ -0.758e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 PRC1-211ENST00000556982 583 ntTSL 210.37□□□□□ -0.758e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 SKP1-213ENST00000524288 732 ntTSL 1 (best)10.11□□□□□ -0.798e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 THOC2-207ENST00000438358 1137 ntTSL 59.81□□□□□ -0.848e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 CENPE-203ENST00000503705 3468 ntTSL 29.29□□□□□ -0.928e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 C7orf73-202ENST00000507606 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.948e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 CCT3-208ENST00000415548 513 ntTSL 38.96□□□□□ -0.988e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 CALM3-204ENST00000482455 650 ntTSL 48.28□□□□□ -1.082e-10■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 CCT3-210ENST00000463132 610 ntTSL 38.17□□□□□ -1.18e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 CCT3-215ENST00000496684 748 ntTSL 27.87□□□□□ -1.158e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.168e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF160-215ENST00000601982 668 ntTSL 37.67□□□□□ -1.188e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 CCT3-216ENST00000533194 581 ntTSL 37.67□□□□□ -1.188e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 PRC1-219ENST00000560914 673 ntTSL 27.31□□□□□ -1.248e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 CCT3-209ENST00000446905 593 ntTSL 36.66□□□□□ -1.348e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 CCT3-214ENST00000490221 696 ntTSL 26.66□□□□□ -1.348e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 CCT3-207ENST00000413555 842 ntTSL 56.39□□□□□ -1.398e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.458e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.558e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.598e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.958e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 FASN-210ENST00000636968 100 ntTSL 517.97■□□□□ 0.478e-8■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 ACSM3-215ENST00000614721 3311 ntTSL 1 (best)9.63□□□□□ -0.875e-7■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.239e-7■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 MYL4-208ENST00000572316 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.39e-7■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 MYL4-201ENST00000354968 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.649e-7■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 MYL4-206ENST00000571981 920 ntTSL 311.08□□□□□ -0.649e-7■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 MYL4-210ENST00000576874 641 ntTSL 310.17□□□□□ -0.789e-7■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 MYL4-203ENST00000536623 650 ntTSL 59.72□□□□□ -0.859e-7■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 MYL4-209ENST00000573747 640 ntTSL 59.17□□□□□ -0.949e-7■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 FDFT1-218ENST00000530664 1761 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.272e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 GOLGA4-207ENST00000437131 6947 ntTSL 1 (best)2.85□□□□□ -1.951e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 MAN2A2-223ENST00000560534 361 ntTSL 517.28■□□□□ 0.365e-7■■■■□ 26.5
UTP3Q9NQZ2 SMARCA4-212ENST00000586985 534 ntTSL 515.51■□□□□ 0.073e-6■■■■□ 26.5
UTP3Q9NQZ2 SMARCA4-211ENST00000586921 569 ntTSL 513.43□□□□□ -0.263e-6■■■■□ 26.5
UTP3Q9NQZ2 PIEZO1-211ENST00000495568 901 ntTSL 211.85□□□□□ -0.514e-7■■■■□ 26.5
UTP3Q9NQZ2 COMT-208ENST00000428707 724 ntTSL 315.04■□□□□ -04e-8■■■■□ 26.5
UTP3Q9NQZ2 COMT-211ENST00000493893 354 ntTSL 314.75□□□□□ -0.054e-8■■■■□ 26.5
UTP3Q9NQZ2 MATR3-225ENST00000514528 532 ntTSL 417.84■□□□□ 0.459e-8■■■■□ 26.5
UTP3Q9NQZ2 MATR3-213ENST00000508689 561 ntTSL 417.59■□□□□ 0.419e-8■■■■□ 26.5
UTP3Q9NQZ2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.453e-11■■■■□ 26.5
UTP3Q9NQZ2 TRA2B-212ENST00000480461 538 ntTSL 1 (best)13.17□□□□□ -0.33e-11■■■■□ 26.5
UTP3Q9NQZ2 TRA2B-213ENST00000485530 839 ntTSL 213.17□□□□□ -0.33e-11■■■■□ 26.5
UTP3Q9NQZ2 AC004922.1-202ENST00000441989 1702 ntTSL 216.67■□□□□ 0.266e-6■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 ARPC1A-202ENST00000432786 1516 ntTSL 515.56■□□□□ 0.086e-6■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.036e-6■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.151e-6■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.841e-6■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 MSANTD2-207ENST00000634413 599 ntTSL 522.99■■□□□ 1.271e-6■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 MSANTD2-205ENST00000527140 775 ntTSL 322.17■■□□□ 1.141e-6■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.041e-6■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 NDUFA7-202ENST00000593729 569 ntTSL 216.43■□□□□ 0.222e-10■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 NDUFA7-204ENST00000601101 414 ntTSL 416.01■□□□□ 0.152e-10■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.12e-9■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 LAMA5-207ENST00000471042 487 ntTSL 215.19■□□□□ 0.022e-10■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF672-204ENST00000502697 559 ntTSL 514.89□□□□□ -0.031e-6■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 ZNF672-202ENST00000423362 883 ntTSL 513.96□□□□□ -0.171e-6■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 ZC3H15-206ENST00000477672 304 ntTSL 313.33□□□□□ -0.282e-10■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 NDUFA7-201ENST00000301457 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.382e-10■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 ZC3H15-203ENST00000437396 556 ntTSL 411.88□□□□□ -0.512e-10■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 NDUFA7-203ENST00000595856 553 ntTSL 510.92□□□□□ -0.662e-10■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 ZC3H15-201ENST00000337859 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.822e-10■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.972e-10■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 ZC3H15-202ENST00000421536 1101 ntTSL 28.19□□□□□ -1.12e-10■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 PRPF19-202ENST00000535326 779 ntTSL 513.9□□□□□ -0.181e-6■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 PRPF19-205ENST00000540473 169 ntTSL 57.08□□□□□ -1.281e-6■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 CIZ1-215ENST00000475471 836 ntTSL 214.86□□□□□ -0.032e-6■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 CIZ1-216ENST00000476239 853 ntTSL 59.88□□□□□ -0.832e-6■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 TSSC2-206ENST00000533775 1210 ntTSL 520.6■□□□□ 0.895e-6■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.285e-6■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 TSSC2-202ENST00000526284 1244 ntTSL 1 (best)16.62■□□□□ 0.255e-6■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.012e-6■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 TSSC2-203ENST00000526488 674 ntTSL 312.73□□□□□ -0.375e-6■■■■□ 26.4
UTP3Q9NQZ2 SRRM2-224ENST00000575870 696 ntTSL 311.39□□□□□ -0.591e-9■■■■□ 26.3
UTP3Q9NQZ2 TXNIP-203ENST00000488537 1509 ntTSL 57.51□□□□□ -1.212e-6■■■■□ 26.3
UTP3Q9NQZ2 UBE2O-205ENST00000587581 545 ntTSL 415.81■□□□□ 0.123e-7■■■■□ 26.3
UTP3Q9NQZ2 UBE2O-204ENST00000587127 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.76□□□□□ -0.533e-7■■■■□ 26.3
UTP3Q9NQZ2 IST1-205ENST00000439924 1841 ntTSL 512.81□□□□□ -0.361e-13■■■■□ 26.2
UTP3Q9NQZ2 FAM50A-206ENST00000490480 346 ntTSL 512.51□□□□□ -0.411e-13■■■■□ 26.2
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