RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580018.3

TIMM23-201, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 23, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMM23, Length 1,222 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23-201ENST00000580018 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.36■■■□□ 2.45
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TIMM23-201ENST00000580018 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
TIMM23-201ENST00000580018 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.37■■□□□ 1.81
TIMM23-201ENST00000580018 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.17■■□□□ 1.78
TIMM23-201ENST00000580018 NACADO15069 1562 aa25.92■■□□□ 1.74
TIMM23-201ENST00000580018 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.79■■□□□ 1.72
TIMM23-201ENST00000580018 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.78■■□□□ 1.72
TIMM23-201ENST00000580018 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.68■■□□□ 1.7
TIMM23-201ENST00000580018 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.67■■□□□ 1.7
TIMM23-201ENST00000580018 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.52■■□□□ 1.68
TIMM23-201ENST00000580018 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.43■■□□□ 1.66
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TIMM23-201ENST00000580018 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.01■■□□□ 1.59
TIMM23-201ENST00000580018 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.01■■□□□ 1.59
TIMM23-201ENST00000580018 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.98■■□□□ 1.59
TIMM23-201ENST00000580018 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.97■■□□□ 1.59
TIMM23-201ENST00000580018 SCRIBQ14160 1630 aa24.94■■□□□ 1.58
TIMM23-201ENST00000580018 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
TIMM23-201ENST00000580018 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.35■■□□□ 1.49
TIMM23-201ENST00000580018 NCAPD3P42695 1498 aa23.96■■□□□ 1.43
TIMM23-201ENST00000580018 CUX2O14529 1486 aa23.94■■□□□ 1.42
TIMM23-201ENST00000580018 ERCC6Q03468 1493 aa23.89■■□□□ 1.42
TIMM23-201ENST00000580018 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.86■■□□□ 1.41
TIMM23-201ENST00000580018 NESP48681 1621 aa23.75■■□□□ 1.39
TIMM23-201ENST00000580018 SMARCA4P51532 1647 aa23.75■■□□□ 1.39
TIMM23-201ENST00000580018 HMGXB3Q12766 1538 aa23.73■■□□□ 1.39
TIMM23-201ENST00000580018 SMARCA2P51531 1590 aa23.73■■□□□ 1.39
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TIMM23-201ENST00000580018 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
TIMM23-201ENST00000580018 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.5■■□□□ 1.35
TIMM23-201ENST00000580018 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.44■■□□□ 1.34
TIMM23-201ENST00000580018 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.43■■□□□ 1.34
TIMM23-201ENST00000580018 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.41■■□□□ 1.34
TIMM23-201ENST00000580018 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.31■■□□□ 1.32
TIMM23-201ENST00000580018 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.21■■□□□ 1.31
TIMM23-201ENST00000580018 TRIM41Q8WV44 630 aa23.17■■□□□ 1.3
TIMM23-201ENST00000580018 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.15■■□□□ 1.3
TIMM23-201ENST00000580018 WIZO95785 1651 aa23.14■■□□□ 1.29
TIMM23-201ENST00000580018 WDR62O43379 1518 aa23.11■■□□□ 1.29
TIMM23-201ENST00000580018 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.98■■□□□ 1.27
TIMM23-201ENST00000580018 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.95■■□□□ 1.26
TIMM23-201ENST00000580018 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TIMM23-201ENST00000580018 CFTRP13569 1480 aa22.89■■□□□ 1.25
TIMM23-201ENST00000580018 OSCARQ8IYS5 282 aa22.82■■□□□ 1.24
TIMM23-201ENST00000580018 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
TIMM23-201ENST00000580018 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
TIMM23-201ENST00000580018 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
TIMM23-201ENST00000580018 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
TIMM23-201ENST00000580018 PRDM2Q13029 1718 aa22.63■■□□□ 1.21
TIMM23-201ENST00000580018 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
TIMM23-201ENST00000580018 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.6■■□□□ 1.21
TIMM23-201ENST00000580018 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.6■■□□□ 1.21
TIMM23-201ENST00000580018 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.6■■□□□ 1.21
TIMM23-201ENST00000580018 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.55■■□□□ 1.2
TIMM23-201ENST00000580018 IFT140Q96RY7 1462 aa22.53■■□□□ 1.2
TIMM23-201ENST00000580018 TOPBP1Q92547 1522 aa22.5■■□□□ 1.19
TIMM23-201ENST00000580018 ARHGEF11O15085 1522 aa22.48■■□□□ 1.19
TIMM23-201ENST00000580018 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
TIMM23-201ENST00000580018 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
TIMM23-201ENST00000580018 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.36■■□□□ 1.17
TIMM23-201ENST00000580018 ABCC8Q09428 1581 aa22.36■■□□□ 1.17
TIMM23-201ENST00000580018 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.36■■□□□ 1.17
TIMM23-201ENST00000580018 CHD1O14646 1710 aa22.34■■□□□ 1.17
TIMM23-201ENST00000580018 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TIMM23-201ENST00000580018 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TIMM23-201ENST00000580018 ARAP1Q96P48 1450 aa22.25■■□□□ 1.15
TIMM23-201ENST00000580018 FBLN2P98095 1184 aa22.24■■□□□ 1.15
TIMM23-201ENST00000580018 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.22■■□□□ 1.15
TIMM23-201ENST00000580018 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TIMM23-201ENST00000580018 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TIMM23-201ENST00000580018 SOGA1O94964 1423 aa22.14■■□□□ 1.13
TIMM23-201ENST00000580018 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TIMM23-201ENST00000580018 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.09■■□□□ 1.13
TIMM23-201ENST00000580018 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.06■■□□□ 1.12
TIMM23-201ENST00000580018 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.06■■□□□ 1.12
TIMM23-201ENST00000580018 CUX1P39880 1505 aa22.02■■□□□ 1.12
TIMM23-201ENST00000580018 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TIMM23-201ENST00000580018 WDR97A6NE52 1622 aa21.99■■□□□ 1.11
TIMM23-201ENST00000580018 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TIMM23-201ENST00000580018 SYNJ1O43426 1573 aa21.97■■□□□ 1.11
TIMM23-201ENST00000580018 GRIN2BQ13224 1484 aa21.95■■□□□ 1.1
TIMM23-201ENST00000580018 SYNJ2O15056 1496 aa21.91■■□□□ 1.1
TIMM23-201ENST00000580018 PBRM1Q86U86 1689 aa21.88■■□□□ 1.09
TIMM23-201ENST00000580018 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.85■■□□□ 1.09
TIMM23-201ENST00000580018 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.79■■□□□ 1.08
TIMM23-201ENST00000580018 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.78■■□□□ 1.08
TIMM23-201ENST00000580018 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.76■■□□□ 1.07
TIMM23-201ENST00000580018 GRIN2AQ12879 1464 aa21.69■■□□□ 1.06
TIMM23-201ENST00000580018 CEP170Q5SW79 1584 aa21.65■■□□□ 1.06
TIMM23-201ENST00000580018 ADAMTS12P58397 1594 aa21.64■■□□□ 1.05
TIMM23-201ENST00000580018 NUP160Q12769 1436 aa21.63■■□□□ 1.05
TIMM23-201ENST00000580018 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.05
TIMM23-201ENST00000580018 SHROOM2Q13796 1616 aa21.58■■□□□ 1.05
TIMM23-201ENST00000580018 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.55■■□□□ 1.04
TIMM23-201ENST00000580018 TOP2BQ02880 1626 aa21.55■■□□□ 1.04
TIMM23-201ENST00000580018 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.55■■□□□ 1.04
TIMM23-201ENST00000580018 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.51■■□□□ 1.03
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