Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 CMC2-207ENST00000564174 424 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.75e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 TMEM97-202ENST00000336687 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.715e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 EIF3D-204ENST00000426531 710 ntTSL 210.47□□□□□ -0.735e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 HERC2P3-211ENST00000440774 551 ntTSL 410.32□□□□□ -0.765e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 HERC2P3-210ENST00000440441 781 ntTSL 410.05□□□□□ -0.85e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 LDLR-211ENST00000560173 389 ntTSL 310□□□□□ -0.815e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.815e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 HERC2P3-206ENST00000429257 4088 ntBASIC9.93□□□□□ -0.825e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 LBR-205ENST00000425080 874 ntTSL 39.85□□□□□ -0.835e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 LINC01088-209ENST00000512130 525 ntTSL 39.73□□□□□ -0.855e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.895e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.915e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 ATG4D-202ENST00000585437 377 ntTSL 59.15□□□□□ -0.945e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 SPEN-202ENST00000438066 1733 ntTSL 39.09□□□□□ -0.955e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 GM2A-201ENST00000357164 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.975e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 RSRC2-215ENST00000528263 792 ntTSL 38.93□□□□□ -0.985e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 LINC01088-206ENST00000510667 534 ntTSL 38.88□□□□□ -0.995e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 FTX-204ENST00000430772 708 ntTSL 58.82□□□□□ -15e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 AC073367.1-201ENST00000421480 697 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.025e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 LINC01088-211ENST00000515597 664 ntTSL 1 (best)8.43□□□□□ -1.065e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 CMC2-206ENST00000563779 2087 ntTSL 1 (best)8.36□□□□□ -1.075e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.085e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 LINC01088-210ENST00000513153 695 ntTSL 38.13□□□□□ -1.115e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 CMC2-213ENST00000565914 528 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.125e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.125e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 LINC01088-204ENST00000507761 842 ntTSL 28.03□□□□□ -1.125e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 OSBPL9-220ENST00000531061 530 ntTSL 47.89□□□□□ -1.155e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.175e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 CMC2-203ENST00000561614 683 ntTSL 37.16□□□□□ -1.265e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.285e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.299e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 EIF3D-210ENST00000462794 764 ntTSL 26.96□□□□□ -1.35e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 AC093752.1-208ENST00000498873 981 ntTSL 56.95□□□□□ -1.35e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 SPEN-204ENST00000471538 1404 ntTSL 26.88□□□□□ -1.315e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 CMC2-215ENST00000566047 660 ntTSL 26.81□□□□□ -1.325e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 OSBPL9-224ENST00000533825 565 ntTSL 46.79□□□□□ -1.325e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 CMC2-221ENST00000569666 545 ntTSL 26.72□□□□□ -1.335e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 MSI2-211ENST00000579531 472 ntTSL 26.67□□□□□ -1.349e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 MSI2-213ENST00000581523 534 ntTSL 26.61□□□□□ -1.359e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 APLP2-212ENST00000529483 323 ntTSL 56.36□□□□□ -1.395e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 UBAP2L-213ENST00000466173 804 ntTSL 25.97□□□□□ -1.455e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 UBXN7-202ENST00000381887 375 ntTSL 35.95□□□□□ -1.465e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 UBXN7-203ENST00000413584 374 ntTSL 55.57□□□□□ -1.525e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 TMEM56-204ENST00000463375 349 ntTSL 53.25□□□□□ -1.895e-7■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 AC139887.2-203ENST00000503185 618 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 AC139887.2-204ENST00000503405 550 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 26.9
UTP3Q9NQZ2 BAZ2A-202ENST00000546695 722 ntTSL 316.8■□□□□ 0.282e-10■■■■■ 26.8
UTP3Q9NQZ2 BAZ2A-215ENST00000551959 483 ntTSL 416.28■□□□□ 0.22e-10■■■■■ 26.8
UTP3Q9NQZ2 BAZ2A-208ENST00000549506 577 ntTSL 28.83□□□□□ -12e-10■■■■■ 26.8
UTP3Q9NQZ2 UBA1-207ENST00000451702 1706 ntTSL 511.42□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 26.8
UTP3Q9NQZ2 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 01e-6■■■■■ 26.8
UTP3Q9NQZ2 PKM-205ENST00000561609 1568 ntTSL 1 (best)12.2□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 26.8
UTP3Q9NQZ2 TECR-204ENST00000594545 735 ntTSL 321.86■■□□□ 1.097e-7■■■■■ 26.8
UTP3Q9NQZ2 TECR-224ENST00000601461 828 ntTSL 311.69□□□□□ -0.547e-7■■■■■ 26.8
UTP3Q9NQZ2 MEIOB-204ENST00000460494 605 ntTSL 322.61■■□□□ 1.211e-8■■■■■ 26.8
UTP3Q9NQZ2 PRKDC-204ENST00000521331 1087 ntTSL 215.73■□□□□ 0.111e-8■■■■■ 26.8
UTP3Q9NQZ2 EXOC1-203ENST00000381295 3551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.554e-6■■■■■ 26.8
UTP3Q9NQZ2 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.354e-6■■■■■ 26.8
UTP3Q9NQZ2 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.644e-6■■■■■ 26.8
UTP3Q9NQZ2 DHX36-211ENST00000491011 833 ntTSL 29.48□□□□□ -0.898e-7■■■■■ 26.8
UTP3Q9NQZ2 CKAP5-212ENST00000533413 3084 ntTSL 1 (best)6.58□□□□□ -1.365e-7■■■■■ 26.8
UTP3Q9NQZ2 HSP90AB1-203ENST00000371646 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.736e-8■■■■■ 26.8
UTP3Q9NQZ2 HSP90AB1-201ENST00000353801 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.836e-8■■■■■ 26.8
UTP3Q9NQZ2 HSP90AB1-204ENST00000620073 2644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.96e-8■■■■■ 26.8
UTP3Q9NQZ2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.434e-7■■■■□ 26.7
UTP3Q9NQZ2 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.254e-7■■■■□ 26.7
UTP3Q9NQZ2 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.214e-7■■■■□ 26.7
UTP3Q9NQZ2 GLUL-204ENST00000417584 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.154e-7■■■■□ 26.7
UTP3Q9NQZ2 GLUL-207ENST00000463851 939 ntTSL 310.66□□□□□ -0.74e-7■■■■□ 26.7
UTP3Q9NQZ2 ARPC3-207ENST00000547365 308 ntTSL 27.17□□□□□ -1.262e-6■■■■□ 26.7
UTP3Q9NQZ2 TMEM248-205ENST00000433271 1610 ntTSL 1 (best)28.48■■■□□ 2.153e-6■■■■□ 26.7
UTP3Q9NQZ2 TMEM248-207ENST00000607045 690 ntTSL 323.17■■□□□ 1.33e-6■■■■□ 26.7
UTP3Q9NQZ2 BRD2-206ENST00000456339 887 ntTSL 415.84■□□□□ 0.131e-6■■■■□ 26.7
UTP3Q9NQZ2 NUMA1-217ENST00000540626 2276 ntTSL 216.01■□□□□ 0.151e-7■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 NUMA1-219ENST00000541262 706 ntTSL 313.77□□□□□ -0.211e-7■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 EIF4A2-201ENST00000323963 1919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.683e-16■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 EIF4A2-203ENST00000426808 1751 ntTSL 1 (best)9.45□□□□□ -0.93e-16■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 EIF4A2-223ENST00000494445 629 ntTSL 29.45□□□□□ -0.93e-16■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 EIF4A2-207ENST00000443963 1729 ntTSL 1 (best)8.53□□□□□ -1.043e-16■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.153e-16■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 EIF4A2-225ENST00000496382 460 ntTSL 1 (best)6.76□□□□□ -1.333e-16■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 EIF4A2-202ENST00000425053 1977 ntTSL 56.44□□□□□ -1.383e-16■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 EIF4A2-219ENST00000485101 5327 ntTSL 54.65□□□□□ -1.673e-16■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.098e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.032e-10■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 CCDC136-203ENST00000459946 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 325.54■■□□□ 1.688e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 CCDC136-208ENST00000472049 253 ntAPPRIS ALT2 TSL 325.54■■□□□ 1.688e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.388e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.148e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 ERCC2-212ENST00000591309 557 ntTSL 422.08■■□□□ 1.138e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 ERCC2-206ENST00000586131 1007 ntTSL 321.92■■□□□ 1.18e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 12e-10■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 CCDC136-213ENST00000488925 552 ntAPPRIS ALT2 TSL 420.4■□□□□ 0.868e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.82e-10■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.788e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.662e-10■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.562e-10■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 CCDC136-211ENST00000485998 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 518.39■□□□□ 0.538e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 C7orf73-203ENST00000509448 581 ntTSL 418.37■□□□□ 0.538e-6■■■■□ 26.6
UTP3Q9NQZ2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.32e-10■■■■□ 26.6
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