Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 PRRC1-205ENST00000512871 703 ntTSL 29.24□□□□□ -0.931e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 FAR2P4-201ENST00000416266 2210 ntTSL 28.93□□□□□ -0.982e-12■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 NEMP1-201ENST00000300128 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.051e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 SETD4-209ENST00000429161 745 ntTSL 28.45□□□□□ -1.061e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 SETD4-210ENST00000442559 431 ntTSL 48.24□□□□□ -1.091e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 SETD4-208ENST00000424303 796 ntTSL 28.04□□□□□ -1.121e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 TNNT1-206ENST00000586649 340 ntTSL 57.59□□□□□ -1.191e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 DLG1-221ENST00000469371 4046 ntTSL 27.35□□□□□ -1.231e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 TRAF6-203ENST00000529150 575 ntTSL 57.08□□□□□ -1.281e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 UBR4-212ENST00000475973 600 ntTSL 36.52□□□□□ -1.371e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 PRRC1-203ENST00000507774 703 ntTSL 25.95□□□□□ -1.461e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.481e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 OPA1-215ENST00000483516 594 ntTSL 35.49□□□□□ -1.531e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 DLG1-224ENST00000475394 864 ntTSL 55.23□□□□□ -1.571e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 SETD4-216ENST00000485865 549 ntTSL 25.09□□□□□ -1.591e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.641e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 VBP1-202ENST00000460509 586 ntTSL 24.72□□□□□ -1.651e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 DLG1-222ENST00000470629 416 ntTSL 33.99□□□□□ -1.771e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.861e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 NUP62CL-203ENST00000432145 688 ntAPPRIS P1 TSL 53.17□□□□□ -1.91e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 MAP3K7-206ENST00000479630 2214 ntTSL 22.54□□□□□ -21e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC5.86□□□□□ -1.471e-26■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.736e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 CTSA-206ENST00000480961 513 ntTSL 218.3■□□□□ 0.526e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.36e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.286e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 ARHGDIA-209ENST00000582309 628 ntTSL 215.71■□□□□ 0.116e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.046e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.066e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 NPIPA1-206ENST00000541836 2747 ntTSL 513.66□□□□□ -0.226e-6■□□□□ 8.6
SF3B4Q15427 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.474e-9■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 CDC42EP1-203ENST00000430687 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.36■□□□□ 0.214e-9■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 CDC42EP1-202ENST00000415670 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.68□□□□□ -0.064e-9■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 CDC42EP1-204ENST00000434728 564 ntTSL 412.34□□□□□ -0.434e-9■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 ARHGDIA-216ENST00000584397 622 ntTSL 222.42■■□□□ 1.187e-6■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 ARHGDIA-213ENST00000583499 560 ntTSL 221.47■■□□□ 1.037e-6■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.178e-6■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.38e-6■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 EML4-202ENST00000401738 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.968e-6■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 EML4-204ENST00000406175 4622 ntTSL 1 (best)5.86□□□□□ -1.478e-6■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 CCNB2-202ENST00000559301 575 ntTSL 218.33■□□□□ 0.523e-9■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 MAP3K4-213ENST00000542952 629 ntTSL 413.67□□□□□ -0.223e-9■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 MAST2-203ENST00000372009 4047 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.733e-9■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 RCOR3-208ENST00000526255 909 ntTSL 1 (best)3.87□□□□□ -1.793e-9■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 UBE2D3-218ENST00000505009 440 ntTSL 24.79□□□□□ -1.641e-6■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 IDH1-206ENST00000451391 563 ntTSL 317.39■□□□□ 0.376e-10■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 IDH1-202ENST00000415282 942 ntTSL 216.09■□□□□ 0.176e-10■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 IDH1-204ENST00000417583 702 ntTSL 412.78□□□□□ -0.366e-10■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 IDH1-207ENST00000462386 1614 ntTSL 211.46□□□□□ -0.576e-10■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 IDH1-208ENST00000481557 556 ntTSL 211.06□□□□□ -0.646e-10■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.33■■□□□ 1.334e-65■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 DANCR-203ENST00000441504 336 ntTSL 216.11■□□□□ 0.174e-65■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.014e-65■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 YES1-202ENST00000577611 568 ntTSL 418.22■□□□□ 0.515e-6■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 ATG13-202ENST00000395549 937 ntTSL 514.93□□□□□ -0.022e-10■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.082e-10■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 ATG13-222ENST00000534610 1655 ntTSL 513.54□□□□□ -0.242e-10■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.272e-10■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 ATG13-211ENST00000528494 2351 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.412e-10■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 SERBP1-207ENST00000490406 624 ntTSL 510.93□□□□□ -0.669e-20■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 ATG13-207ENST00000526508 4199 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.762e-10■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 ATG13-213ENST00000528984 587 ntTSL 49.29□□□□□ -0.922e-10■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 ATG13-203ENST00000524625 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.062e-10■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 ATG13-201ENST00000359513 4348 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.132e-10■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 ATG13-209ENST00000527907 662 ntTSL 27.93□□□□□ -1.142e-10■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 ATG13-205ENST00000525850 562 ntTSL 47.91□□□□□ -1.142e-10■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 ATG13-212ENST00000528704 574 ntTSL 56.05□□□□□ -1.442e-10■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 PPP2R5C-214ENST00000555237 607 ntTSL 55.37□□□□□ -1.552e-10■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 PPP2R5C-225ENST00000557071 798 ntTSL 35.37□□□□□ -1.552e-10■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 PPP2R5C-232ENST00000561006 483 ntTSL 55.11□□□□□ -1.592e-10■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 SERBP1-206ENST00000484880 628 ntTSL 25.02□□□□□ -1.619e-20■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 CAPN2-205ENST00000472601 625 ntTSL 33.28□□□□□ -1.882e-10■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.162e-7■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.142e-7■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.072e-7■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 SOD2-209ENST00000535561 551 ntTSL 313.16□□□□□ -0.32e-7■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.372e-7■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.522e-7■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 SOD2-204ENST00000401980 523 ntTSL 411.28□□□□□ -0.62e-7■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 SOD2-214ENST00000545162 571 ntTSL 310.82□□□□□ -0.682e-7■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 SOD2-216ENST00000546260 4302 ntTSL 510.71□□□□□ -0.692e-7■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 SOD2-203ENST00000367055 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.882e-7■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 SOD2-210ENST00000537657 507 ntTSL 29.53□□□□□ -0.882e-7■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.312e-7■□□□□ 8.5
SF3B4Q15427 EPB41L4A-AS1-202ENST00000427306 1367 ntTSL 221.28■■□□□ 11e-57■□□□□ 8.4
SF3B4Q15427 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.171e-57■□□□□ 8.4
SF3B4Q15427 EPB41L4A-AS1-203ENST00000442823 578 ntTSL 216.01■□□□□ 0.151e-57■□□□□ 8.4
SF3B4Q15427 EPB41L4A-AS1-204ENST00000508590 292 ntTSL 314.84□□□□□ -0.031e-57■□□□□ 8.4
SF3B4Q15427 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.431e-57■□□□□ 8.4
SF3B4Q15427 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.9■□□□□ 0.143e-23■□□□□ 8.4
SF3B4Q15427 LARS-211ENST00000508709 633 ntTSL 55.43□□□□□ -1.549e-14■□□□□ 8.4
SF3B4Q15427 LARS-205ENST00000504611 576 ntTSL 34.21□□□□□ -1.749e-14■□□□□ 8.4
SF3B4Q15427 RPL9-207ENST00000506581 371 ntTSL 54.93□□□□□ -1.623e-12■□□□□ 8.4
SF3B4Q15427 RPL9-210ENST00000511643 618 ntTSL 24.18□□□□□ -1.743e-12■□□□□ 8.4
SF3B4Q15427 MIGA2-210ENST00000483458 2532 ntTSL 216.78■□□□□ 0.281e-7■□□□□ 8.4
SF3B4Q15427 MIGA2-211ENST00000492279 901 ntTSL 316.64■□□□□ 0.251e-7■□□□□ 8.4
SF3B4Q15427 BTNL9-206ENST00000511056 332 ntTSL 316.63■□□□□ 0.251e-7■□□□□ 8.4
SF3B4Q15427 BTNL9-203ENST00000491209 2199 ntTSL 216.01■□□□□ 0.151e-7■□□□□ 8.4
SF3B4Q15427 BTNL9-204ENST00000506782 676 ntTSL 510.79□□□□□ -0.681e-7■□□□□ 8.4
SF3B4Q15427 CCT5-210ENST00000511995 1091 ntTSL 28.66□□□□□ -1.021e-7■□□□□ 8.4
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