Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -09e-8■■□□□ 13
PUM1Q14671 CHD1-202ENST00000414220 434 ntTSL 514.93□□□□□ -0.029e-8■■□□□ 13
PUM1Q14671 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.369e-8■■□□□ 13
PUM1Q14671 RAD21-206ENST00000519837 515 ntTSL 411.02□□□□□ -0.652e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 HDAC2-212ENST00000521610 580 ntTSL 410.91□□□□□ -0.669e-8■■□□□ 13
PUM1Q14671 ATF3-211ENST00000613954 2031 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.719e-8■■□□□ 13
PUM1Q14671 ATF3-206ENST00000366987 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.89e-8■■□□□ 13
PUM1Q14671 ATF3-209ENST00000492118 2103 ntTSL 29.97□□□□□ -0.819e-8■■□□□ 13
PUM1Q14671 CHD1-205ENST00000508756 724 ntTSL 59.32□□□□□ -0.929e-8■■□□□ 13
PUM1Q14671 NRBP1-202ENST00000356442 585 ntTSL 39.29□□□□□ -0.929e-8■■□□□ 13
PUM1Q14671 ATF3-207ENST00000464547 767 ntTSL 1 (best)9.28□□□□□ -0.929e-8■■□□□ 13
PUM1Q14671 ATF3-210ENST00000613104 581 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.979e-8■■□□□ 13
PUM1Q14671 ATF3-205ENST00000366985 516 ntTSL 59.01□□□□□ -0.979e-8■■□□□ 13
PUM1Q14671 ATF3-204ENST00000366983 858 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.999e-8■■□□□ 13
PUM1Q14671 RAD21-205ENST00000519469 549 ntTSL 28.5□□□□□ -1.052e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 RABEP1-201ENST00000341923 2490 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.29e-8■■□□□ 13
PUM1Q14671 CACYBP-206ENST00000469173 904 ntTSL 37.36□□□□□ -1.236e-14■■□□□ 13
PUM1Q14671 NCL-208ENST00000466274 671 ntTSL 27.11□□□□□ -1.272e-20■■□□□ 13
PUM1Q14671 ATF3-203ENST00000366981 680 ntTSL 1 (best)7.04□□□□□ -1.289e-8■■□□□ 13
PUM1Q14671 RABEP1-205ENST00000574568 578 ntTSL 46.99□□□□□ -1.299e-8■■□□□ 13
PUM1Q14671 CHD1-206ENST00000511067 817 ntTSL 56.34□□□□□ -1.399e-8■■□□□ 13
PUM1Q14671 RAD21-207ENST00000520992 831 ntTSL 45.61□□□□□ -1.512e-6■■□□□ 13
PUM1Q14671 HDAC2-216ENST00000523628 549 ntTSL 45.27□□□□□ -1.579e-8■■□□□ 13
PUM1Q14671 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.636e-14■■□□□ 13
PUM1Q14671 ANXA1-203ENST00000415424 526 ntTSL 44.76□□□□□ -1.659e-8■■□□□ 13
PUM1Q14671 HDAC2-202ENST00000425835 553 ntTSL 24.14□□□□□ -1.759e-8■■□□□ 13
PUM1Q14671 ATG3-207ENST00000494571 2758 ntTSL 23.93□□□□□ -1.789e-8■■□□□ 13
PUM1Q14671 PPP5C-211ENST00000525507 1300 ntTSL 221.31■■□□□ 11e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 PPP5C-213ENST00000527623 1215 ntTSL 220.99■□□□□ 0.951e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.91e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.61e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 PPP5C-206ENST00000486994 2209 ntTSL 216.49■□□□□ 0.231e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 PPP5C-207ENST00000487483 4675 ntTSL 514.09□□□□□ -0.151e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 PPP5C-205ENST00000478046 1886 ntTSL 1 (best)14.08□□□□□ -0.161e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 PAIP2-204ENST00000507755 776 ntTSL 518.09■□□□□ 0.492e-11■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 ISYNA1-213ENST00000583534 629 ntTSL 1 (best)21.52■■□□□ 1.049e-11■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 ISYNA1-205ENST00000578352 592 ntTSL 220.16■□□□□ 0.829e-11■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 ISYNA1-208ENST00000581800 627 ntTSL 417.03■□□□□ 0.329e-11■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 HSPA5-201ENST00000324460 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.867e-14■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.755e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.325e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.325e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.325e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.275e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 CLTA-208ENST00000493185 714 ntTSL 321.76■■□□□ 1.075e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.855e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.435e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.435e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 CLTA-205ENST00000464497 1890 ntTSL 517.22■□□□□ 0.355e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 ATXN7L3-205ENST00000587097 1341 ntTSL 531.99■■■□□ 2.717e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 CD81-214ENST00000530239 425 ntTSL 224.78■■□□□ 1.564e-10■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 CD81-203ENST00000464784 794 ntTSL 524.06■■□□□ 1.444e-10■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 KRT8-206ENST00000546900 523 ntTSL 321.9■■□□□ 1.14e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 PKP4-209ENST00000479398 550 ntTSL 521.23■□□□□ 0.997e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 SEPT9-227ENST00000590059 670 ntTSL 520.77■□□□□ 0.924e-16■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.74e-10■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 CD81-208ENST00000492252 1136 ntTSL 319.39■□□□□ 0.694e-10■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 CD81-205ENST00000475945 606 ntTSL 219.38■□□□□ 0.694e-10■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 CD81-217ENST00000533417 444 ntTSL 319.38■□□□□ 0.694e-10■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 TBC1D9B-216ENST00000522224 532 ntTSL 519.25■□□□□ 0.677e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 CD81-213ENST00000527343 720 ntTSL 319.13■□□□□ 0.654e-10■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.634e-10■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 MLLT6-209ENST00000620482 1556 ntTSL 1 (best)18.57■□□□□ 0.566e-14■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 STRN4-205ENST00000593979 675 ntTSL 418.55■□□□□ 0.567e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 KCNH2-204ENST00000461280 2430 ntTSL 1 (best)18.47■□□□□ 0.554e-10■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.54e-10■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.437e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 CD81-211ENST00000524805 982 ntTSL 517.59■□□□□ 0.414e-10■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.384e-10■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 KCNH2-205ENST00000473610 2782 ntTSL 217.23■□□□□ 0.354e-10■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 KCNH2-206ENST00000532957 3374 ntTSL 217.06■□□□□ 0.324e-10■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.244e-10■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 NFE2-205ENST00000553198 1208 ntTSL 516.44■□□□□ 0.227e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.214e-10■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.137e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 MLLT6-207ENST00000618652 624 ntTSL 315.62■□□□□ 0.096e-14■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.076e-14■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.077e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 SLC2A1-205ENST00000475162 598 ntTSL 515.42■□□□□ 0.067e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 CD81-210ENST00000493525 396 ntTSL 515.21■□□□□ 0.034e-10■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 PKP4-205ENST00000426248 4134 ntTSL 1 (best)14.88□□□□□ -0.037e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.047e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 SEPT9-232ENST00000590825 554 ntTSL 414.69□□□□□ -0.064e-16■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.094e-16■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.096e-14■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 STRN4-220ENST00000600710 565 ntTSL 514.46□□□□□ -0.097e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.12e-7■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 KRT8-209ENST00000547176 250 ntTSL 514.36□□□□□ -0.114e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 ZPR1-204ENST00000429220 2364 ntTSL 513.81□□□□□ -0.27e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.314e-10■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 CD81-215ENST00000530648 558 ntTSL 413.12□□□□□ -0.314e-10■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 STRN4-212ENST00000596012 560 ntTSL 412.31□□□□□ -0.447e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 ZPR1-206ENST00000444935 2497 ntTSL 510.77□□□□□ -0.697e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 ZPR1-201ENST00000227322 6566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.77e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 PKP4-203ENST00000411900 552 ntTSL 410.57□□□□□ -0.727e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 COPG2-202ENST00000425248 3134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.787e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 PKP4-206ENST00000452162 2359 ntTSL 1 (best)10.14□□□□□ -0.797e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 PKP4-201ENST00000389757 5777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.837e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 PKP4-207ENST00000457109 520 ntTSL 39.55□□□□□ -0.887e-8■■□□□ 12.9
PUM1Q14671 ZPR1-205ENST00000431973 508 ntTSL 59.44□□□□□ -0.97e-8■■□□□ 12.9
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