Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.133e-6■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.938e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.518e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 EP400NL-210ENST00000537558 861 ntTSL 417.76■□□□□ 0.434e-8■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 ING5-206ENST00000482774 2376 ntTSL 316.81■□□□□ 0.281e-6■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 RSRP1-208ENST00000561867 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.22■□□□□ 0.198e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 RSRP1-219ENST00000568701 629 ntAPPRIS ALT2 TSL 416.22■□□□□ 0.198e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.198e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.198e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 EP400NL-212ENST00000539351 564 ntTSL 415.55■□□□□ 0.088e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.061e-6■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 ING5-210ENST00000492488 822 ntTSL 214.31□□□□□ -0.121e-6■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 RSRP1-220ENST00000568996 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.3□□□□□ -0.128e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.158e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 CHD8-211ENST00000556833 416 ntTSL 514.08□□□□□ -0.168e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 ING5-209ENST00000489509 920 ntTSL 214.07□□□□□ -0.161e-6■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 RSRP1-204ENST00000473314 3034 ntTSL 213.45□□□□□ -0.268e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 MTHFSD-213ENST00000566050 1270 ntTSL 1 (best)13.05□□□□□ -0.328e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.48e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 SON-208ENST00000455528 8394 ntTSL 1 (best)11.97□□□□□ -0.492e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 MTHFSD-201ENST00000360900 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.538e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 MTHFSD-215ENST00000567539 556 ntTSL 411.25□□□□□ -0.618e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 AC006449.2-201ENST00000618407 486 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.618e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 SON-202ENST00000356577 8813 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.682e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 ING5-211ENST00000493261 543 ntTSL 210.45□□□□□ -0.741e-6■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 MTHFSD-219ENST00000625049 3623 nt10.27□□□□□ -0.778e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 MTHFSD-208ENST00000562096 691 ntTSL 39.8□□□□□ -0.848e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 SORBS1-215ENST00000474353 2906 ntTSL 29.02□□□□□ -0.978e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 SORBS1-210ENST00000371246 6931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.998e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 SORBS1-211ENST00000371247 7354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.048e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 MAP3K15-204ENST00000518578 4697 ntTSL 28.5□□□□□ -1.058e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 HOOK2-213ENST00000589765 108 ntTSL 58.36□□□□□ -1.071e-12■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.18e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 SON-207ENST00000436227 5269 ntAPPRIS P1 TSL 58.07□□□□□ -1.122e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 SORBS1-212ENST00000371249 5927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.248e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.288e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.318e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.358e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 SON-205ENST00000421541 1151 ntTSL 1 (best)6.57□□□□□ -1.362e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.62e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 LMNB2-204ENST00000527409 838 ntTSL 521.07■□□□□ 0.961e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 LMNB2-206ENST00000534495 491 ntTSL 319.99■□□□□ 0.791e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 NCOR2-223ENST00000542565 746 ntTSL 319.08■□□□□ 0.647e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 HDLBP-210ENST00000423693 544 ntTSL 512□□□□□ -0.495e-9■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 HDLBP-246ENST00000496569 374 ntTSL 411.46□□□□□ -0.575e-9■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 HDLBP-207ENST00000420451 559 ntTSL 410.07□□□□□ -0.85e-9■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 HDLBP-205ENST00000413241 581 ntTSL 59.62□□□□□ -0.875e-9■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 HDLBP-230ENST00000462130 464 ntTSL 49.59□□□□□ -0.875e-9■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 HDLBP-206ENST00000417540 525 ntTSL 49.54□□□□□ -0.885e-9■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 HDLBP-216ENST00000428482 1096 ntTSL 59.54□□□□□ -0.885e-9■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 HDLBP-201ENST00000310931 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.945e-9■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 HDLBP-211ENST00000425989 530 ntTSL 58.66□□□□□ -1.025e-9■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 USP22-209ENST00000579645 1906 ntTSL 517.5■□□□□ 0.399e-10■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.269e-10■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.419e-10■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 USP22-211ENST00000584538 554 ntTSL 410.93□□□□□ -0.669e-10■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 USP22-202ENST00000455117 677 ntTSL 59.68□□□□□ -0.869e-10■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.43e-6■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.363e-6■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.436e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 NPHP4-207ENST00000470763 3156 ntTSL 213.25□□□□□ -0.292e-6■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 CR1L-201ENST00000294997 1587 ntTSL 1 (best)6.88□□□□□ -1.314e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.941e-6■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.921e-6■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 USF2-216ENST00000607959 1920 ntTSL 519.65■□□□□ 0.741e-6■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.531e-6■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.371e-6■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.281e-6■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 USF2-213ENST00000600341 1392 ntTSL 216.66■□□□□ 0.261e-6■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 USF2-211ENST00000599471 1173 ntTSL 316.37■□□□□ 0.211e-6■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 USF2-208ENST00000596380 550 ntTSL 315.57■□□□□ 0.081e-6■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 USF2-212ENST00000599625 446 ntTSL 28.62□□□□□ -1.031e-6■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 USF2-209ENST00000597671 464 ntTSL 56□□□□□ -1.451e-6■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 EP400NL-201ENST00000332441 2741 ntTSL 218.27■□□□□ 0.511e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.816e-6■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.626e-6■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 ZGPAT-208ENST00000472711 787 ntTSL 318.7■□□□□ 0.586e-6■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.536e-6■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.56e-6■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.246e-6■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 ZGPAT-210ENST00000478385 935 ntTSL 216.17■□□□□ 0.186e-6■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 ZGPAT-209ENST00000477340 2831 ntTSL 215.37■□□□□ 0.056e-6■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 NEU4-213ENST00000435934 451 ntTSL 415.92■□□□□ 0.142e-9■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.381e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.331e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.291e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 STXBP2-211ENST00000597068 1785 ntTSL 1 (best)14.05□□□□□ -0.161e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 STXBP2-217ENST00000599737 1523 ntTSL 513.56□□□□□ -0.241e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 STXBP2-214ENST00000599400 811 ntTSL 513.55□□□□□ -0.241e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 STXBP2-219ENST00000600702 770 ntTSL 212.25□□□□□ -0.451e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.016e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 PCGF3-204ENST00000427463 582 ntTSL 319.85■□□□□ 0.776e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 PCGF3-210ENST00000482726 538 ntTSL 419.85■□□□□ 0.776e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.486e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 PCGF3-205ENST00000430644 2621 ntTSL 216.74■□□□□ 0.276e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.236e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 PCGF3-203ENST00000419774 589 ntTSL 516.07■□□□□ 0.166e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 PCGF3-211ENST00000484141 566 ntTSL 215.69■□□□□ 0.16e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 PCGF3-207ENST00000440452 3609 ntTSL 211.74□□□□□ -0.536e-7■■■■□ 22.5
CSTF2TQ9H0L4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.841e-8■■■■□ 22.4
Retrieved 100 of 19,151 protein–RNA pairs in 181 ms