Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 ZNF3-210ENST00000449785 735 ntTSL 312.39□□□□□ -0.431e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ZNF3-211ENST00000460331 562 ntTSL 412.35□□□□□ -0.431e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 IGHMBP2-201ENST00000255078 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.441e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ZNF3-209ENST00000441298 574 ntTSL 412.14□□□□□ -0.471e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ZNF3-201ENST00000292393 512 ntTSL 212.12□□□□□ -0.471e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 CHIC2-203ENST00000510894 528 ntTSL 212.11□□□□□ -0.471e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ACP6-208ENST00000613673 4564 ntTSL 1 (best)11.85□□□□□ -0.511e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ZHX1-206ENST00000522655 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.536e-12■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ACP6-204ENST00000493129 543 ntTSL 511.02□□□□□ -0.651e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ZNF3-214ENST00000485892 722 ntTSL 210.88□□□□□ -0.671e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SZRD1-207ENST00000475554 583 ntTSL 310.79□□□□□ -0.681e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ACP6-205ENST00000583509 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.71e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 GCLC-202ENST00000504353 597 ntTSL 310.58□□□□□ -0.721e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 CHIC2-202ENST00000509678 462 ntTSL 210.48□□□□□ -0.731e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SZRD1-209ENST00000486763 549 ntTSL 410.4□□□□□ -0.741e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SNF8-214ENST00000515174 823 ntTSL 210.37□□□□□ -0.751e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ZNF3-215ENST00000487620 2660 ntTSL 210.32□□□□□ -0.761e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ZNF3-205ENST00000413658 1441 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.791e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 AC008758.1-201ENST00000428311 4505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.811e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SZRD1-210ENST00000492354 3401 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.811e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SZRD1-202ENST00000401089 3447 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.811e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SNF8-201ENST00000290330 951 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.841e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SNF8-207ENST00000509995 560 ntTSL 39.68□□□□□ -0.861e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ACP6-207ENST00000611629 562 ntTSL 49.65□□□□□ -0.861e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ZNF3-207ENST00000424697 2718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.871e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ZNF3-208ENST00000428683 999 ntTSL 29.56□□□□□ -0.881e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SNF8-210ENST00000511214 429 ntTSL 29.49□□□□□ -0.891e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 GCLC-212ENST00000515580 2132 ntTSL 1 (best)9.28□□□□□ -0.921e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SNF8-211ENST00000512243 863 ntTSL 29.25□□□□□ -0.931e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ZNF3-202ENST00000299667 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.961e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 PRR14L-204ENST00000431684 2841 ntTSL 28.81□□□□□ -11e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 GCLC-206ENST00000509541 3774 ntTSL 58.72□□□□□ -1.011e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SLC39A10-207ENST00000458054 593 ntTSL 48.33□□□□□ -1.081e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SLC39A10-203ENST00000412905 337 ntTSL 38.27□□□□□ -1.091e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 RNMT-205ENST00000588457 1612 ntTSL 28.1□□□□□ -1.111e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 WDR59-210ENST00000563797 652 ntTSL 38.02□□□□□ -1.131e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.191e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SNF8-204ENST00000506104 455 ntTSL 37.61□□□□□ -1.191e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.271e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SZRD1-208ENST00000476423 567 ntTSL 47.05□□□□□ -1.281e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 GCKR-206ENST00000478147 579 ntTSL 56.99□□□□□ -1.291e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 IFT172-204ENST00000420854 569 ntTSL 56.94□□□□□ -1.31e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.31e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 GCLC-207ENST00000510837 776 ntTSL 26.74□□□□□ -1.331e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.411e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.421e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SLC39A10-205ENST00000430412 4478 ntTSL 25.68□□□□□ -1.51e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.541e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.581e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.61e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 RNMT-207ENST00000591746 572 ntTSL 34.49□□□□□ -1.691e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.691e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SLC39A10-206ENST00000444421 544 ntTSL 44.07□□□□□ -1.761e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.841e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 RAPGEF5-210ENST00000488366 345 ntTSL 32.81□□□□□ -1.961e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.031e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 NBAS-204ENST00000427792 442 ntTSL 23.01□□□□□ -1.931e-6■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.154e-6■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 HEMK1-205ENST00000448997 5757 ntTSL 212.6□□□□□ -0.394e-6■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.34e-6■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 AC097478.1-206ENST00000513572 2010 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.662e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.192e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 AC097478.1-205ENST00000507916 602 ntTSL 35.31□□□□□ -1.562e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 AC097478.1-201ENST00000506864 560 ntTSL 44.41□□□□□ -1.72e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.742e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.117e-27■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.097e-27■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.827e-27■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 TNFRSF14-205ENST00000435221 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 218.02■□□□□ 0.481e-6■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 TNFRSF14-204ENST00000434817 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.15□□□□□ -0.141e-6■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SRSF5-206ENST00000554021 567 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.139e-8■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.269e-8■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 EIF4G2-211ENST00000527526 555 ntTSL 412.66□□□□□ -0.383e-9■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 F7-203ENST00000444337 564 ntTSL 518.84■□□□□ 0.611e-12■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 GTPBP3-223ENST00000600995 812 ntTSL 219.39■□□□□ 0.691e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 GTPBP3-228ENST00000602165 617 ntTSL 417.27■□□□□ 0.361e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 GTPBP3-204ENST00000593297 555 ntTSL 417.04■□□□□ 0.321e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 GTPBP3-206ENST00000594345 1004 ntTSL 316.99■□□□□ 0.311e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 GTPBP3-225ENST00000601261 606 ntTSL 416.97■□□□□ 0.311e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 GTPBP3-215ENST00000596941 678 ntTSL 216.57■□□□□ 0.241e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 GTPBP3-224ENST00000601213 584 ntTSL 416.57■□□□□ 0.241e-7■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 MAP4-201ENST00000335271 1564 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.11■□□□□ 0.012e-6■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 MAP4-208ENST00000429422 3724 ntTSL 1 (best)11.56□□□□□ -0.562e-6■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 MAP4-205ENST00000420772 3478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.772e-6■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SMARCC2-211ENST00000550859 656 ntTSL 34.2□□□□□ -1.742e-6■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 YARS-202ENST00000466052 728 ntTSL 310.62□□□□□ -0.713e-11■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 RPS15-204ENST00000586656 436 ntTSL 314.38□□□□□ -0.112e-6■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 RPS15-213ENST00000617694 338 ntTSL 311.19□□□□□ -0.622e-6■□□□□ 10.6
EFTUD2Q15029 SH3BP2-226ENST00000513095 609 ntTSL 413.66□□□□□ -0.226e-8■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 SH3BP2-205ENST00000502260 727 ntTSL 312.95□□□□□ -0.346e-8■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 SH3BP2-224ENST00000513020 868 ntTSL 311.43□□□□□ -0.586e-8■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 INO80E-204ENST00000562291 255 ntTSL 39.05□□□□□ -0.965e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 AC015849.4-201ENST00000603678 421 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.92e-12■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.175e-15■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PMS2P3-205ENST00000437568 1185 ntTSL 523.66■■□□□ 1.382e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PMS2P3-202ENST00000418756 1490 ntTSL 322.79■■□□□ 1.242e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PMS2P3-201ENST00000394921 1316 ntTSL 221.59■■□□□ 1.052e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.332e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.212e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 MAN2A2-222ENST00000560505 643 ntTSL 212.44□□□□□ -0.421e-12■□□□□ 10.5
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